More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0452 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0452  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 569 aa  1135    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.384213  normal  0.0840159 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0451  TPR repeat-containing protein  53.33 
 
 		 574 aa  549  1e-155  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.871153  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  42.94 
 
 		 4489 aa  419  1e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  43.15 
 
 		 3560 aa  414  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  42.75 
 
 		 1094 aa  412  1e-114  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  42.2 
 
 		 3035 aa  410  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  43.64 
 
 		 1085 aa  400  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  42.12 
 
 		 700 aa  398  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  46.86 
 
 		 654 aa  381  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  40.99 
 
 		 647 aa  374  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0489  TPR repeat-containing protein  37.25 
 
 		 618 aa  369  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0261011  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  38.19 
 
 		 761 aa  355  2e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  44.35 
 
 		 740 aa  347  5e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0772  TPR repeat-containing protein  43.44 
 
 		 611 aa  346  6e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  36.88 
 
 		 732 aa  345  8.999999999999999e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  42.28 
 
 		 667 aa  332  1e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1547  hypothetical protein  44.69 
 
 		 459 aa  325  2e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.948596 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1891  hypothetical protein  42.57 
 
 		 492 aa  318  2e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.591473 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04549  tetratricopeptide repeat domain protein  40.28 
 
 		 568 aa  316  6e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0122  TPR repeat-containing protein  34.51 
 
 		 660 aa  313  3.9999999999999997e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.142603  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  33.52 
 
 		 909 aa  313  6.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7846  hypothetical protein  43.74 
 
 		 452 aa  310  4e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346388 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  32.64 
 
 		 750 aa  308  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  30.8 
 
 		 816 aa  305  1.0000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  36.59 
 
 		 616 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0720  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.49 
 
 		 570 aa  305  2.0000000000000002e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3361  TPR repeat-containing protein  37.77 
 
 		 750 aa  300  4e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3428  tetratricopeptide TPR_2  38.72 
 
 		 560 aa  297  4e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0384278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1008  TPR repeat-containing protein  37.55 
 
 		 672 aa  293  4e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  31.6 
 
 		 739 aa  287  4e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1086  hypothetical protein  36.33 
 
 		 632 aa  283  8.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0359  hypothetical protein  39.72 
 
 		 657 aa  281  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.224796  normal  0.0716049 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20301  hypothetical protein  39.9 
 
 		 395 aa  278  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.236649 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0327  hypothetical protein  38.31 
 
 		 657 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.322162 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  33.01 
 
 		 706 aa  273  9e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3091  hypothetical protein  33.82 
 
 		 680 aa  270  5e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677352  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  34.77 
 
 		 808 aa  269  1e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1162  hypothetical protein  37.64 
 
 		 633 aa  265  1e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2579  hypothetical protein  34.01 
 
 		 588 aa  263  6e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.385383  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1161  hypothetical protein  40.09 
 
 		 637 aa  262  1e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.143311  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1088  hypothetical protein  38.06 
 
 		 566 aa  258  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1319  TPR repeat-containing protein  46.47 
 
 		 295 aa  256  9e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000490816  hitchhiker  8.5993e-22 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3853  O-linked acetylglucosamine transferase  38.2 
 
 		 590 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4069  TPR repeat-containing protein  37.79 
 
 		 590 aa  251  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00017793  normal  0.44147 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2410  hypothetical protein  35.87 
 
 		 624 aa  236  7e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.361804  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  26.47 
 
 		 632 aa  236  7e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2411  hypothetical protein  39.62 
 
 		 582 aa  233  5e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100681  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1160  hypothetical protein  36.13 
 
 		 630 aa  233  9e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795058  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.46 
 
 		 1106 aa  206  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  33.73 
 
 		 585 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 		 789 aa  199  9e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.47 
 
 		 589 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  32.26 
 
 		 627 aa  197  4.0000000000000005e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  32.77 
 
 		 1106 aa  196  8.000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.09 
 
 		 529 aa  196  9e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4222  glycosyltransferase TPR domain-containing protein  29.73 
 
 		 594 aa  195  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  34.67 
 
 		 708 aa  193  8e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  28.24 
 
 		 789 aa  190  5.999999999999999e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  30.63 
 
 		 754 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 		 828 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3368  Tetratricopeptide domain protein  34.85 
 
 		 596 aa  184  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  30.4 
 
 		 619 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  31.53 
 
 		 828 aa  183  9.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  30.12 
 
 		 598 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  28.28 
 
 		 1714 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  30.47 
 
 		 754 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  28.49 
 
 		 776 aa  180  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  28.49 
 
 		 821 aa  180  7e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  28.49 
 
 		 776 aa  180  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  28.49 
 
 		 776 aa  180  7e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  30.83 
 
 		 937 aa  179  8e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.51 
 
 		 667 aa  179  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0094  TPR domain-containing protein  28.13 
 
 		 821 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.822931  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  28.45 
 
 		 739 aa  177  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3873  TPR repeat-containing protein  28.13 
 
 		 776 aa  177  5e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.661818  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  27.73 
 
 		 626 aa  177  5e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  29.78 
 
 		 633 aa  177  5e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.35 
 
 		 589 aa  176  7e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5235  hypothetical protein  31.01 
 
 		 797 aa  176  7e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050699  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3955  TPR repeat-containing protein  27.95 
 
 		 776 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4399  TPR repeat-containing protein  30.29 
 
 		 727 aa  174  3.9999999999999995e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 		 595 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0051  TPR repeat-containing protein  29.38 
 
 		 633 aa  174  5e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00265  UDP-N-acetylglucosaminyltransferase (AFU_orthologue; AFUA_1G03380)  28.66 
 
 		 1596 aa  174  5.999999999999999e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0115382 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  29.39 
 
 		 718 aa  172  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0605  tetratricopeptide domain-containing protein  28.71 
 
 		 553 aa  171  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.335277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  28.75 
 
 		 717 aa  171  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  30.57 
 
 		 713 aa  170  6e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 968 aa  169  9e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  29.88 
 
 		 734 aa  169  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  30.46 
 
 		 828 aa  168  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  28.73 
 
 		 717 aa  168  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2387  tetratricopeptide TPR_2  28.61 
 
 		 745 aa  167  5.9999999999999996e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.625245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0346  TPR repeat-containing protein  31.23 
 
 		 739 aa  166  9e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.110262  normal  0.110805 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  30.71 
 
 		 824 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  27.72 
 
 		 647 aa  165  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0100  TPR domain-containing protein  26.99 
 
 		 790 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  29.82 
 
 		 732 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0256  hypothetical protein  28.73 
 
 		 719 aa  164  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  31.56 
 
 		 699 aa  163  7e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>