123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0407 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0407  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  261  3e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.38857  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2808  hypothetical protein  51.67 
 
 
126 aa  133  7.000000000000001e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0098  hypothetical protein  57.14 
 
 
124 aa  133  8e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0407  protein of unknown function DUF1232  54.24 
 
 
124 aa  133  9e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0363693  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3628  hypothetical protein  51.67 
 
 
142 aa  130  5e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.89928  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1386  hypothetical protein  58.82 
 
 
139 aa  129  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0704  hypothetical protein  52.68 
 
 
124 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0081  hypothetical protein  50 
 
 
127 aa  122  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.461887  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0247  hypothetical protein  52.43 
 
 
135 aa  122  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0079  hypothetical protein  50 
 
 
127 aa  122  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2523  hypothetical protein  50.49 
 
 
129 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0989751  normal  0.209211 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0092  hypothetical protein  50 
 
 
126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4050  protein of unknown function DUF1232  44.83 
 
 
130 aa  114  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3727  protein of unknown function DUF1232  43.97 
 
 
130 aa  114  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.883988  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4172  hypothetical protein  44.66 
 
 
146 aa  110  9e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0445378  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3070  hypothetical protein  46.36 
 
 
125 aa  107  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3346  hypothetical protein  52.73 
 
 
124 aa  106  8.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0208  hypothetical protein  44.12 
 
 
140 aa  82.4  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.776323  normal  0.198508 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4080  hypothetical protein  41.58 
 
 
117 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3677  hypothetical protein  41.58 
 
 
116 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001113  hypothetical protein  37.62 
 
 
124 aa  75.5  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.777907  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05801  hypothetical protein  36.21 
 
 
121 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4049  hypothetical protein  40.59 
 
 
116 aa  74.7  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4167  hypothetical protein  40.59 
 
 
116 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3972  protein of unknown function DUF1232  40.59 
 
 
116 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3867  hypothetical protein  40.59 
 
 
116 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04866  hypothetical protein  34.15 
 
 
120 aa  73.6  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0277  protein of unknown function DUF1232  38.71 
 
 
134 aa  72.4  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0318  hypothetical protein  41.3 
 
 
116 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0289  hypothetical protein  39.6 
 
 
116 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06321  hypothetical protein  45.71 
 
 
122 aa  68.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3655  hypothetical protein  40.59 
 
 
116 aa  67  0.00000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06411  hypothetical protein  38.32 
 
 
124 aa  67  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06311  hypothetical protein  36.08 
 
 
121 aa  67  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0012  hypothetical protein  36.08 
 
 
121 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0576  hypothetical protein  45.71 
 
 
122 aa  66.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.64986  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18241  hypothetical protein  36.08 
 
 
123 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0694351 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06021  hypothetical protein  45.71 
 
 
122 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3332  hypothetical protein  37.78 
 
 
115 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2657  hypothetical protein  36.08 
 
 
126 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90763  hitchhiker  0.00677971 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0383  hypothetical protein  40.24 
 
 
115 aa  62.8  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0999  hypothetical protein  35.85 
 
 
129 aa  61.6  0.000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.178423  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1921  hypothetical protein  34.69 
 
 
112 aa  60.8  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0280  hypothetical protein  40.23 
 
 
117 aa  60.5  0.000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0234  hypothetical protein  42.65 
 
 
119 aa  59.7  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.74255 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4217  hypothetical protein  38.64 
 
 
114 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0145  hypothetical protein  38.04 
 
 
132 aa  58.2  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1034  hypothetical protein  31.58 
 
 
150 aa  57.4  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.383392  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3765  hypothetical protein  39.76 
 
 
121 aa  57  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000021606  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0904  hypothetical protein  35.29 
 
 
131 aa  55.1  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4912  hypothetical protein  33.67 
 
 
121 aa  54.7  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.76328e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5080  hypothetical protein  33 
 
 
121 aa  53.9  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000473899  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4927  hypothetical protein  33 
 
 
121 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000366167  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0801  hypothetical protein  32.99 
 
 
123 aa  54.3  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5468  hypothetical protein  33 
 
 
121 aa  53.9  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000040052  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5320  hypothetical protein  33 
 
 
121 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34657e-47 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5022  hypothetical protein  38.71 
 
 
121 aa  53.9  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000591225  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5346  hypothetical protein  33 
 
 
121 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000784394  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5403  hypothetical protein  33 
 
 
121 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000173737  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5352  hypothetical protein  37.5 
 
 
121 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00015826  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5607  hypothetical protein  35.79 
 
 
121 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000035022  hitchhiker  2.94963e-24 
 
 
-
 
NC_002950  PG1826  hypothetical protein  28.46 
 
 
139 aa  51.6  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2736  hypothetical protein  40.98 
 
 
148 aa  51.6  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.909587  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4460  protein of unknown function DUF1232  34.43 
 
 
138 aa  50.8  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1268  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 
213 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0129761  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0858  hypothetical protein  33.33 
 
 
171 aa  50.4  0.000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0411  transcriptional regulator  35.56 
 
 
217 aa  50.1  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0476  DNA-binding protein  35.56 
 
 
217 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0498  DNA-binding protein  37.65 
 
 
217 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00729869  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0407  transcriptional regulator  37.65 
 
 
217 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4824  DNA-binding protein  39.29 
 
 
217 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0158337  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0549  DNA-binding protein  38.1 
 
 
217 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.550111  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2908  protein of unknown function DUF1232  41.38 
 
 
152 aa  48.5  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2863  hypothetical protein  33.33 
 
 
114 aa  47.8  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0874191  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1681  hypothetical protein  37.29 
 
 
131 aa  47.8  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.232652 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0413  XRE family transcriptional regulator  34.83 
 
 
217 aa  47.4  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0468  DNA-binding protein  34.83 
 
 
217 aa  47  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0494  DNA-binding protein  34.83 
 
 
217 aa  47  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144904  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4497  protein of unknown function DUF1232  42 
 
 
153 aa  47  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.923848 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1704  hypothetical protein  34.18 
 
 
323 aa  47  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0800873  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0549  DNA-binding protein  36.47 
 
 
217 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000426784  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0024  protein of unknown function DUF1232  33.77 
 
 
87 aa  46.2  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3901  hypothetical protein  34.62 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0698239  normal  0.0160769 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2537  protein of unknown function DUF1232  28.87 
 
 
155 aa  47  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.36697  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0836  hypothetical protein  40 
 
 
167 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.202842 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2125  hypothetical protein  39.34 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.836422  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1437  hypothetical protein  37.1 
 
 
323 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.973186  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0463  hypothetical protein  33.33 
 
 
130 aa  45.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.572887  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2278  hypothetical protein  26.97 
 
 
109 aa  45.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0575719  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2487  hypothetical protein  26.97 
 
 
109 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2261  hypothetical protein  26.97 
 
 
109 aa  45.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000353755  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2219  hypothetical protein  26.97 
 
 
109 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2505  hypothetical protein  26.97 
 
 
105 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00216917  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2566  hypothetical protein  26.97 
 
 
109 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0631165  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0315  hypothetical protein  31.11 
 
 
131 aa  43.9  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3605  hypothetical protein  33.33 
 
 
118 aa  43.9  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134025  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1295  protein of unknown function DUF1232  43.18 
 
 
116 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1315  hypothetical protein  33.78 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000812186  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0422  helix-turn-helix domain-containing protein  38.27 
 
 
217 aa  43.5  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000401833  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3716  hypothetical protein  31.82 
 
 
103 aa  43.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270803 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>