More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0382 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0382  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 
396 aa  785    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.410142  normal  0.745706 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.95 
 
 
390 aa  154  4e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0225  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.78 
 
 
347 aa  147  5e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.175978  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0949  RND family efflux transporter MFP subunit  29.82 
 
 
390 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3711  RND family efflux transporter MFP subunit  28.57 
 
 
389 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3408  RND family efflux transporter MFP subunit  27.76 
 
 
389 aa  138  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0128497  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1361  RND efflux membrane protein  29.16 
 
 
383 aa  121  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1673  secretion protein HlyD  26.43 
 
 
396 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.801945 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1362  secretion protein HlyD  27.14 
 
 
381 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.27807  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2837  RND family efflux transporter MFP subunit  27.86 
 
 
406 aa  117  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0025637 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.27 
 
 
377 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2877  secretion protein HlyD  28.07 
 
 
383 aa  114  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1251  RND family efflux transporter MFP subunit  29.08 
 
 
383 aa  114  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0652431  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3834  RND family efflux transporter MFP subunit  28.8 
 
 
383 aa  113  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3851  RND family efflux transporter MFP subunit  28.8 
 
 
383 aa  113  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1919  RND family efflux transporter MFP subunit  28.8 
 
 
383 aa  113  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  26.64 
 
 
376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2685  RND family efflux transporter MFP subunit  28.8 
 
 
383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.133522  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4314  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.48 
 
 
438 aa  111  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.544766  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3303  RND family efflux transporter MFP subunit  30 
 
 
418 aa  111  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.3496  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1908  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.86 
 
 
407 aa  110  5e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  27.51 
 
 
379 aa  108  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1281  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.08 
 
 
357 aa  108  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.036609  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1241  RND family efflux transporter MFP subunit  27.79 
 
 
398 aa  107  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1571  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25 
 
 
435 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.334008  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1045  RND family efflux transporter MFP subunit  28.74 
 
 
397 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.71 
 
 
438 aa  103  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444201  normal  0.22934 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3855  RND family efflux transporter MFP subunit  29.43 
 
 
438 aa  102  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.336679  normal  0.260987 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1326  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.46 
 
 
398 aa  102  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0997151  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1161  RND family efflux transporter MFP subunit  28.37 
 
 
404 aa  101  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0203325  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  25.5 
 
 
421 aa  101  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2408  secretion protein HlyD  26.12 
 
 
404 aa  98.2  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000198894  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2282  macrolide transporter subunit MacA  25.72 
 
 
371 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000339116  normal  0.0134871 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  25.36 
 
 
400 aa  97.8  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1515  RND family efflux transporter MFP subunit  24.58 
 
 
405 aa  97.8  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00883  macrolide transporter subunit, membrane fusion protein (MFP) component  25.72 
 
 
371 aa  96.7  6e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0982  macrolide transporter subunit MacA  25.72 
 
 
371 aa  96.7  6e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.44834  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00889  hypothetical protein  25.72 
 
 
371 aa  96.7  6e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2718  macrolide transporter subunit MacA  25.72 
 
 
371 aa  96.7  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2451  macrolide transporter subunit MacA  25.72 
 
 
371 aa  96.7  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00913289  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0951  macrolide transporter subunit MacA  25.72 
 
 
371 aa  96.7  6e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557503  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1039  macrolide transporter subunit MacA  25.72 
 
 
371 aa  96.3  8e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.184306  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1184  secretion protein HlyD  26.67 
 
 
396 aa  96.3  9e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0145  RND family efflux transporter MFP subunit  27.17 
 
 
383 aa  96.3  9e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0454  secretion protein HlyD  24.37 
 
 
373 aa  95.1  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2764  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.46 
 
 
371 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.161658  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1916  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.22 
 
 
384 aa  93.6  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4014  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.32 
 
 
362 aa  92.8  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0181773  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1597  macrolide transporter subunit MacA  25 
 
 
370 aa  92.4  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2696  macrolide transporter subunit MacA  25 
 
 
370 aa  92.4  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.761507  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2611  macrolide transporter subunit MacA  25 
 
 
370 aa  92.4  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3253  RND family efflux transporter MFP subunit  27.36 
 
 
397 aa  92  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0694  secretion protein HlyD  29.97 
 
 
417 aa  91.7  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.459164  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1965  secretion protein HlyD  28.4 
 
 
388 aa  91.7  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.455875 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1047  RND family efflux transporter subunit MFP  24.92 
 
 
461 aa  91.3  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0423833  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4616  secretion protein HlyD  26.82 
 
 
414 aa  90.5  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0549  secretion protein HlyD  29.21 
 
 
407 aa  90.1  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2584  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.19 
 
 
421 aa  90.1  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2322  secretion protein HlyD  25.08 
 
 
399 aa  89.7  8e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000756014  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3522  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.19 
 
 
421 aa  89.4  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1046  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.58 
 
 
378 aa  89.4  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0357289  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4563  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.8 
 
 
426 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1039  macrolide transporter subunit MacA  24.15 
 
 
372 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.303516  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2543  secretion protein HlyD  23.27 
 
 
471 aa  88.6  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467529  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1059  macrolide transporter subunit MacA  24.15 
 
 
372 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.75011  normal  0.992508 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3265  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.03 
 
 
404 aa  88.6  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3623  secretion protein HlyD  27.89 
 
 
398 aa  88.2  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0728465  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2456  hypothetical protein  26.63 
 
 
431 aa  88.6  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0942  macrolide transporter subunit MacA  24.15 
 
 
372 aa  88.2  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1392  RND efflux system membrane fusion protein  25.29 
 
 
419 aa  87.8  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0449025  normal  0.0986293 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1685  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.15 
 
 
383 aa  87.4  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  26.71 
 
 
387 aa  87  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1892  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.38 
 
 
430 aa  87  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1955  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.47 
 
 
400 aa  87  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.159137  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0976  macrolide transporter subunit MacA  24.15 
 
 
372 aa  87  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2520  RND family efflux transporter MFP subunit  25.87 
 
 
406 aa  87  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  26.71 
 
 
387 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0748  putative PAS/PAC sensor protein  24.54 
 
 
607 aa  86.7  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1309  efflux protein  25.66 
 
 
364 aa  86.7  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0831  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.61 
 
 
372 aa  86.3  8e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0273609  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2314  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.32 
 
 
466 aa  85.5  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1791  secretion protein HlyD  27.23 
 
 
402 aa  86.3  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2690  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.66 
 
 
360 aa  85.9  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1088  MFP family transporter  27.62 
 
 
368 aa  85.1  0.000000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.802038  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0747  secretion protein HlyD  24.02 
 
 
357 aa  85.1  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.554021  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1395  macrolide transporter subunit MacA  27.24 
 
 
371 aa  85.1  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.458807  normal  0.0347786 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1748  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.08 
 
 
388 aa  84.7  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2825  Fis family transcriptional regulator  30.32 
 
 
466 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.506795  normal  0.45265 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0871  secretion protein HlyD  23.97 
 
 
406 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.75327  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1008  macrolide transporter subunit MacA  23.88 
 
 
372 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.622007  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15871  membrane fusion protein  23.72 
 
 
357 aa  85.1  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3160  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.61 
 
 
1460 aa  85.1  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0225  RND family efflux transporter MFP subunit  27.73 
 
 
461 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.540049  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0618  RND family efflux transporter MFP subunit  25.73 
 
 
387 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1943  secretion protein HlyD  26.69 
 
 
523 aa  84.7  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.354822  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3301  RND family efflux transporter MFP subunit  27.25 
 
 
381 aa  84.3  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.446472 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16800  putative efflux transmembrane protein  26.43 
 
 
367 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0868415  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0307  RND family efflux transporter MFP subunit  26.19 
 
 
413 aa  84  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0899354  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1925  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.28 
 
 
396 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.588537  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0986  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.11 
 
 
405 aa  84  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.831389 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>