More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0296 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0296  hypothetical protein  100 
 
 
286 aa  566  1e-160  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.299993  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0443  hypothetical protein  65.56 
 
 
259 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0234  hypothetical protein  61.54 
 
 
262 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0597  hypothetical protein  60.87 
 
 
259 aa  215  7e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2614  hypothetical protein  62.43 
 
 
201 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal  0.0922711 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2822  protein of unknown function DUF150  58.76 
 
 
255 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.189115  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2926  protein of unknown function DUF150  58.92 
 
 
251 aa  210  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3730  hypothetical protein  60 
 
 
257 aa  211  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401483  normal  0.0819057 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0028  hypothetical protein  61.58 
 
 
263 aa  210  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2700  hypothetical protein  58.92 
 
 
251 aa  210  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.765292 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1050  hypothetical protein  49.79 
 
 
314 aa  209  6e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4615  protein of unknown function DUF150  60.73 
 
 
238 aa  209  6e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130835  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3927  hypothetical protein  62.79 
 
 
220 aa  205  5e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4390  hypothetical protein  56.91 
 
 
201 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0477  hypothetical protein  56.38 
 
 
272 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.981594  normal  0.577769 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4070  hypothetical protein  57.3 
 
 
201 aa  199  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0054  hypothetical protein  61.24 
 
 
253 aa  198  7.999999999999999e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.454767  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0750  hypothetical protein  56.65 
 
 
224 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.251451  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2162  hypothetical protein  57.47 
 
 
219 aa  196  5.000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.213663  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2074  hypothetical protein  57.47 
 
 
219 aa  196  5.000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0717176  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3438  hypothetical protein  56.9 
 
 
205 aa  196  5.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0021  hypothetical protein  61.8 
 
 
260 aa  189  5e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0581916 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2298  protein of unknown function DUF150  57.06 
 
 
279 aa  187  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.022015 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1251  hypothetical protein  51.34 
 
 
209 aa  186  5e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0164  hypothetical protein  52.57 
 
 
204 aa  185  7e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.89885  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3625  hypothetical protein  51.76 
 
 
207 aa  163  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.443103 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2591  hypothetical protein  46.56 
 
 
206 aa  160  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2067  hypothetical protein  50.84 
 
 
207 aa  160  3e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.677656 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3560  hypothetical protein  45.6 
 
 
196 aa  160  3e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2909  hypothetical protein  49.43 
 
 
203 aa  156  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.829531  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0041  hypothetical protein  46.55 
 
 
194 aa  152  7e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2754  hypothetical protein  46.86 
 
 
204 aa  152  7e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.229577  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1162  hypothetical protein  44.57 
 
 
204 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3778  hypothetical protein  49.69 
 
 
225 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2823  hypothetical protein  44.57 
 
 
204 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0030  hypothetical protein  44.27 
 
 
199 aa  141  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.906317  normal  0.667348 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3040  hypothetical protein  49.07 
 
 
178 aa  135  7.000000000000001e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0222  hypothetical protein  47.24 
 
 
201 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0609  hypothetical protein  43.79 
 
 
181 aa  123  4e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.142397  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3820  hypothetical protein  51.37 
 
 
186 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.646345  normal  0.0215546 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2493  hypothetical protein  44.64 
 
 
186 aa  113  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0301958  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1950  hypothetical protein  41.61 
 
 
176 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.197995  normal  0.0512088 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0453  protein of unknown function DUF150  39.23 
 
 
152 aa  104  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5464  hypothetical protein  43.9 
 
 
152 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62780  hypothetical protein  43.9 
 
 
152 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1046  hypothetical protein  40.65 
 
 
158 aa  103  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708313  unclonable  0.00000000857031 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0995  hypothetical protein  38.06 
 
 
154 aa  101  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000184773  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1751  hypothetical protein  39.42 
 
 
151 aa  99.8  4e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  38.41 
 
 
153 aa  100  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42840  hypothetical protein  45.61 
 
 
145 aa  99.8  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3076  hypothetical protein  39.33 
 
 
153 aa  99.4  6e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2122  hypothetical protein  38.67 
 
 
151 aa  98.6  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.330912  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3610  hypothetical protein  43.48 
 
 
152 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0065  hypothetical protein  40.41 
 
 
144 aa  97.1  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000828588  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  40.26 
 
 
161 aa  97.4  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000315608  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1474  hypothetical protein  42.34 
 
 
152 aa  96.3  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150708  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1018  hypothetical protein  42.34 
 
 
152 aa  96.3  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.680488  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1498  hypothetical protein  42.34 
 
 
152 aa  96.3  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310765  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1138  hypothetical protein  41.79 
 
 
171 aa  95.9  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0279371 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1898  hypothetical protein  42.42 
 
 
159 aa  96.3  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000581162  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4714  hypothetical protein  42.61 
 
 
169 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109953  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4579  hypothetical protein  42.61 
 
 
169 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312509  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1585  hypothetical protein  39.49 
 
 
159 aa  95.5  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0279837  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0596  hypothetical protein  37.07 
 
 
151 aa  95.1  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.277868  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4639  hypothetical protein  42.34 
 
 
152 aa  95.1  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0564312  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0561  hypothetical protein  35.97 
 
 
153 aa  94.4  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0719  hypothetical protein  41.74 
 
 
169 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1440  protein of unknown function DUF150  34.18 
 
 
154 aa  94  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.266374  normal  0.102283 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0389  lipoprotein, putative  41.67 
 
 
150 aa  94.4  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.281265  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0553  protein of unknown function DUF150  41.67 
 
 
153 aa  94.4  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.169356 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4714  hypothetical protein  41.74 
 
 
152 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1757  hypothetical protein  41.67 
 
 
152 aa  94  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.47468  normal  0.0284791 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1602  hypothetical protein  34.78 
 
 
153 aa  92.8  5e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.781407  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2822  hypothetical protein  34.85 
 
 
152 aa  92.4  8e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1666  hypothetical protein  39.22 
 
 
159 aa  92  9e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1063  hypothetical protein  40.28 
 
 
153 aa  92  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.295932  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0177  hypothetical protein  40.28 
 
 
153 aa  92  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00695056  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1760  hypothetical protein  40.28 
 
 
153 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0659337  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  38.05 
 
 
165 aa  92  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1509  hypothetical protein  40.28 
 
 
153 aa  92  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.985298  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0989  hypothetical protein  40.28 
 
 
153 aa  92  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.233502  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2566  hypothetical protein  40.28 
 
 
153 aa  92  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000987168  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1420  hypothetical protein  41.91 
 
 
152 aa  91.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.042517 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1380  hypothetical protein  41.91 
 
 
152 aa  91.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.449131  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1738  hypothetical protein  40.28 
 
 
153 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00684436  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1159  protein of unknown function DUF150  41.79 
 
 
171 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.710629  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07810  hypothetical protein  35.06 
 
 
159 aa  91.3  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2691  hypothetical protein  34.4 
 
 
152 aa  90.9  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4182  hypothetical protein  42.06 
 
 
158 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.844103 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1913  hypothetical protein  39.58 
 
 
153 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.454349  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1099  hypothetical protein  41.79 
 
 
171 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2822  hypothetical protein  48.15 
 
 
152 aa  90.9  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00822471  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1630  hypothetical protein  48.15 
 
 
152 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00641879 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3583  hypothetical protein  44.86 
 
 
150 aa  90.5  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3645  hypothetical protein  44.86 
 
 
150 aa  90.5  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1121  hypothetical protein  47.62 
 
 
151 aa  90.5  3e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3477  hypothetical protein  44.86 
 
 
154 aa  90.5  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3546  hypothetical protein  44.86 
 
 
154 aa  90.5  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.210683  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3478  hypothetical protein  44.86 
 
 
150 aa  90.5  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.615546  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3467  protein of unknown function DUF150  42.86 
 
 
154 aa  90.5  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>