280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0292 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0292  ribosome-binding factor A  100 
 
 
151 aa  301  1e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.887654  normal  0.0167928 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2818  ribosome-binding factor A  61.87 
 
 
145 aa  174  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.259467  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2696  ribosome-binding factor A  59.71 
 
 
145 aa  171  4e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.674256 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2610  ribosome-binding factor A  62.86 
 
 
139 aa  170  6e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.191354 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2922  ribosome-binding factor A  62.31 
 
 
145 aa  169  8e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0301917  normal  0.0601013 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3726  ribosome-binding factor A  62.5 
 
 
142 aa  166  9e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.879451  normal  0.0692072 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1046  ribosome-binding factor A  58.91 
 
 
141 aa  164  4e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.12886  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4619  ribosome-binding factor A  66.12 
 
 
135 aa  162  1e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.302767  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0746  ribosome-binding factor A  56.52 
 
 
150 aa  156  9e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.321784  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0601  ribosome-binding factor A  60.8 
 
 
135 aa  154  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0481  ribosome-binding factor A  60.8 
 
 
137 aa  155  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.214856  normal  0.376721 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0032  ribosome-binding factor A  60.66 
 
 
137 aa  152  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0230  ribosome-binding factor A  59.69 
 
 
136 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00202036  normal  0.436051 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0058  ribosome-binding factor A  57.03 
 
 
138 aa  151  3e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.649534  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0439  ribosome-binding factor A  59.52 
 
 
137 aa  151  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2166  ribosome-binding factor A  58.73 
 
 
150 aa  147  3e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2078  ribosome-binding factor A  58.73 
 
 
197 aa  147  6e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0263191  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0025  ribosome-binding factor A  57.48 
 
 
146 aa  146  1e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4066  ribosome-binding factor A  58.87 
 
 
134 aa  144  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2294  ribosome-binding factor A  54.03 
 
 
155 aa  143  7e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.121706 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4386  ribosome-binding factor A  57.26 
 
 
134 aa  139  1e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.4784 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3442  ribosome-binding factor A  52.31 
 
 
134 aa  137  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.728771  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0170  ribosome-binding factor A  55.28 
 
 
137 aa  134  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0610976  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3815  ribosome-binding factor A  56.67 
 
 
132 aa  133  8e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.104911  normal  0.0213018 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0613  ribosome-binding factor A  55 
 
 
136 aa  130  6e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.440259  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1106  ribosome-binding factor A  51.56 
 
 
140 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.811236  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2799  ribosome-binding factor A  53.79 
 
 
138 aa  121  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.285538  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2768  ribosome-binding factor A  50.78 
 
 
137 aa  120  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2924  ribosome-binding factor A  49.63 
 
 
165 aa  120  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.332986  normal  0.135151 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1255  ribosome-binding factor A  50.78 
 
 
148 aa  119  2e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3931  ribosome-binding factor A  52.5 
 
 
133 aa  118  4e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.627477  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3046  ribosome-binding factor A  48.82 
 
 
141 aa  117  5e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2488  ribosome-binding factor A  46.97 
 
 
135 aa  115  2e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.266682  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0086  ribosome-binding factor A  52.38 
 
 
131 aa  114  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.744834  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3629  ribosome-binding factor A  48.78 
 
 
140 aa  113  1e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.445652  normal  0.0497582 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3041  ribosome-binding factor A  49.22 
 
 
135 aa  112  2e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.603703  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3782  ribosome-binding factor A  48.74 
 
 
164 aa  112  2e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0911878  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0226  ribosome-binding factor A  49.58 
 
 
140 aa  106  9e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.435446  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4036  ribosome-binding factor A  47.06 
 
 
143 aa  104  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2071  ribosome-binding factor A  49.17 
 
 
145 aa  104  4e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.573719 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0038  ribosome-binding factor A  38.67 
 
 
164 aa  101  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.623045  normal  0.446494 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3725  ribosome-binding factor A  36.04 
 
 
123 aa  72  3e-12  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2463  ribosome-binding factor A  37.38 
 
 
118 aa  70.5  7e-12  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0350107  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0610  ribosome-binding factor A  35.78 
 
 
128 aa  70.5  7e-12  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0012936  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3849  ribosome-binding factor A  37.38 
 
 
118 aa  70.5  8e-12  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3570  ribosome-binding factor A  37.38 
 
 
118 aa  70.5  8e-12  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3858  ribosome-binding factor A  37.38 
 
 
118 aa  70.5  8e-12  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  3.6841e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3552  ribosome-binding factor A  37.38 
 
 
118 aa  70.5  8e-12  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3822  ribosome-binding factor A  37.38 
 
 
118 aa  70.1  9e-12  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.32995e-63 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3948  ribosome-binding factor A  37.38 
 
 
118 aa  69.7  1e-11  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3662  ribosome-binding factor A  37.38 
 
 
118 aa  69.7  1e-11  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118279  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1947  ribosome-binding factor A  37.5 
 
 
130 aa  70.1  1e-11  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0382472 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3633  ribosome-binding factor A  36.45 
 
 
118 aa  68.6  3e-11  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0539851  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3909  ribosome-binding factor A  36.45 
 
 
118 aa  68.6  3e-11  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.391027  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1335  ribosome-binding factor A  36.45 
 
 
118 aa  68.6  3e-11  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0231832  hitchhiker  0.00144693 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1693  ribosome-binding factor A  32.33 
 
 
141 aa  68.2  4e-11  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0101873  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1939  ribosome-binding factor A  34.86 
 
 
116 aa  67.8  5e-11  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1657  ribosome-binding factor A  34.86 
 
 
116 aa  67.8  5e-11  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1052  ribosome-binding factor A  36.79 
 
 
132 aa  66.6  1e-10  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  1.64371e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2119  ribosome-binding factor A  36 
 
 
127 aa  65.5  2e-10  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.328304  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1232  ribosome-binding factor A  35.29 
 
 
139 aa  65.9  2e-10  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1164  ribosome-binding factor A  39.29 
 
 
138 aa  65.9  2e-10  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.338865  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1143  ribosome-binding factor A  39.45 
 
 
122 aa  65.1  3e-10  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.115087 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0990  ribosome-binding factor A  30.56 
 
 
123 aa  65.5  3e-10  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.645083  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2049  ribosome-binding factor A  33.94 
 
 
127 aa  65.5  3e-10  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1104  ribosome-binding factor A  39.29 
 
 
138 aa  65.1  3e-10  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0588249  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4489  ribosome-binding factor A  31.39 
 
 
138 aa  64.7  4e-10  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0856583  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0780  ribosome-binding factor A  34.86 
 
 
133 aa  63.9  7e-10  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000489115  normal  0.0558247 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4576  ribosome-binding factor A  33.94 
 
 
132 aa  63.2  1e-09  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.63413  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4711  ribosome-binding factor A  33.94 
 
 
132 aa  63.2  1e-09  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165962  hitchhiker  0.00698134 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0722  ribosome-binding factor A  33.86 
 
 
132 aa  63.2  1e-09  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.041956 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4711  ribosome-binding factor A  33.94 
 
 
132 aa  62.8  1e-09  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.31631 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0964  ribosome-binding factor A  31.4 
 
 
122 aa  62.4  2e-09  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.404033  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1748  ribosome-binding factor A  40.74 
 
 
126 aa  62.8  2e-09  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0187668  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1157  ribosome-binding factor A  33.03 
 
 
126 aa  62.4  2e-09  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  8.26248e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07850  ribosome-binding factor A  33.93 
 
 
122 aa  61.6  3e-09  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0726  ribosome-binding factor A  37.04 
 
 
147 aa  61.6  4e-09  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.237747  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1304  ribosome-binding factor A  31.43 
 
 
119 aa  61.6  4e-09  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0293197  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1956  ribosome-binding factor A  32.73 
 
 
120 aa  61.6  4e-09  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1445  ribosome-binding factor A  29.6 
 
 
131 aa  61.2  5e-09  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  1.45103e-05  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1004  ribosome-binding factor A  35.51 
 
 
129 aa  61.2  5e-09  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.439697  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2980  ribosome-binding factor A  31.43 
 
 
119 aa  61.2  5e-09  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.06185e-26 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2451  ribosome-binding factor A  32.17 
 
 
123 aa  60.8  5e-09  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0315755  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2027  ribosome-binding factor A  30.89 
 
 
122 aa  60.8  6e-09  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.373244  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1028  ribosome-binding factor A  32.37 
 
 
129 aa  60.8  6e-09  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0189385  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0458  ribosome-binding factor A  29.91 
 
 
117 aa  60.5  7e-09  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2665  ribosome-binding factor A  31.01 
 
 
133 aa  60.5  8e-09  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0640591  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3675  ribosome-binding factor A  31.45 
 
 
125 aa  60.5  9e-09  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3347  ribosome-binding factor A  35 
 
 
143 aa  60.5  9e-09  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0531  ribosome-binding factor A  39.81 
 
 
133 aa  60.1  1e-08  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000335299 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3359  ribosome-binding factor A  39.81 
 
 
133 aa  60.1  1e-08  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3463  ribosome-binding factor A  39.81 
 
 
133 aa  60.1  1e-08  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.287723 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3651  ribosome-binding factor A  39.81 
 
 
133 aa  60.1  1e-08  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0538  ribosome-binding factor A  39.81 
 
 
133 aa  60.1  1e-08  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4488  ribosome-binding factor A  39.81 
 
 
133 aa  60.1  1e-08  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03034  ribosome-binding factor A  39.81 
 
 
133 aa  60.1  1e-08  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.710808  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3604  ribosome-binding factor A  39.81 
 
 
133 aa  60.1  1e-08  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2815  ribosome-binding factor A  34.86 
 
 
122 aa  59.7  1e-08  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473664  hitchhiker  0.00211169 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4179  ribosome-binding factor A  32.11 
 
 
138 aa  60.1  1e-08  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308306  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02985  hypothetical protein  39.81 
 
 
133 aa  60.1  1e-08  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.757266  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>