More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0278 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0278  alanine racemase domain-containing protein  100 
 
 		 232 aa  470  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.334709  normal  0.0228737 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0174  hypothetical protein  70.89 
 
 		 228 aa  310  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405099  normal  0.913317 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1403  alanine racemase domain-containing protein  72.38 
 
 		 227 aa  304  6e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.113582 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0282  hypothetical protein  69.91 
 
 		 219 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.118746 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0096  hypothetical protein  68.3 
 
 		 225 aa  302  2.0000000000000002e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.480165  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1661  alanine racemase domain protein  67.12 
 
 		 244 aa  300  1e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.19823 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0089  hypothetical protein  69.77 
 
 		 224 aa  300  2e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.937473  normal  0.0909898 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1857  alanine racemase domain protein  66.21 
 
 		 247 aa  297  8e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.821186 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1578  alanine racemase domain-containing protein  65.3 
 
 		 247 aa  295  5e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.417677  normal  0.0750539 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0438  hypothetical protein  68.22 
 
 		 221 aa  293  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1021  alanine racemase domain protein  68.75 
 
 		 227 aa  292  3e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.952251  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3208  hypothetical protein  65.75 
 
 		 225 aa  288  6e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491657  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4107  alanine racemase domain-containing protein  64.84 
 
 		 250 aa  286  2e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.760524  normal  0.399061 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0288  alanine racemase domain protein  66.67 
 
 		 219 aa  284  8e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0383  hypothetical protein  65.89 
 
 		 221 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.69916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1094  alanine racemase domain-containing protein  64.86 
 
 		 250 aa  281  9e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0335  alanine racemase domain protein  69.44 
 
 		 230 aa  279  3e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00537658 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4380  hypothetical protein  66.2 
 
 		 219 aa  279  3e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0226  alanine racemase domain-containing protein  66.2 
 
 		 230 aa  278  4e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0695521  normal  0.167093 
 
 
-
 
NC_004310  BR1808  hypothetical protein  63.01 
 
 		 226 aa  274  8e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4249  alanine racemase domain protein  65.26 
 
 		 219 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.405464 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1741  hypothetical protein  63.01 
 
 		 226 aa  272  3e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3923  alanine racemase domain protein  63.85 
 
 		 219 aa  267  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823584  normal  0.338994 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3197  alanine racemase domain-containing protein  65.26 
 
 		 219 aa  267  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0042  alanine racemase domain protein  61.29 
 
 		 218 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000221923 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3634  hypothetical protein  60.09 
 
 		 242 aa  263  2e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.205526  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0414  hypothetical protein  62.32 
 
 		 217 aa  261  6.999999999999999e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1285  alanine racemase domain-containing protein  66.15 
 
 		 230 aa  256  3e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0048  hypothetical protein  59.81 
 
 		 218 aa  254  6e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.434055 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2762  alanine racemase domain-containing protein  60.47 
 
 		 217 aa  254  9e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0716815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3131  alanine racemase domain-containing protein  60.09 
 
 		 220 aa  247  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.803662  hitchhiker  0.000192693 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0102  hypothetical protein  54.29 
 
 		 226 aa  243  9.999999999999999e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2502  alanine racemase domain-containing protein  62.19 
 
 		 221 aa  239  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.936846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0844  hypothetical protein  62.19 
 
 		 221 aa  239  2e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5034  alanine racemase domain-containing protein  66.84 
 
 		 214 aa  239  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_003296  RS01766  hypothetical protein  57.82 
 
 		 226 aa  236  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.720058  normal  0.155386 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2952  hypothetical protein  55.16 
 
 		 225 aa  233  3e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0628  alanine racemase domain protein  60.51 
 
 		 248 aa  223  2e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0643141 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2856  alanine racemase domain-containing protein  54.93 
 
 		 221 aa  218  5e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0170216  normal  0.0492664 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0433  hypothetical protein  58.33 
 
 		 191 aa  218  5e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0415  alanine racemase domain protein  46.83 
 
 		 225 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.837437  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3024  hypothetical protein  53.18 
 
 		 220 aa  201  7e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2054  alanine racemase domain-containing protein  56.22 
 
 		 229 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0733965  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  47.85 
 
 		 231 aa  174  9.999999999999999e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  46.48 
 
 		 227 aa  164  8e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  44.69 
 
 		 227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2164  alanine racemase domain protein  43.46 
 
 		 219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  48.21 
 
 		 223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  47.45 
 
 		 213 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  43.61 
 
 		 228 aa  156  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  45.13 
 
 		 232 aa  154  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  38.43 
 
 		 231 aa  153  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2860  hypothetical protein  41.01 
 
 		 228 aa  152  4e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00719508  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1702  alanine racemase domain-containing protein  42.99 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3759  hypothetical protein  44.89 
 
 		 238 aa  150  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.125293  normal  0.217424 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1352  alanine racemase domain protein  48.21 
 
 		 223 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  41.41 
 
 		 230 aa  149  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2937  hypothetical protein  43.3 
 
 		 229 aa  148  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  40.53 
 
 		 230 aa  148  7e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0939  alanine racemase domain protein  39.29 
 
 		 229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3641  hypothetical protein  42.79 
 
 		 226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3981  hypothetical protein  44.83 
 
 		 232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.409738 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  39.38 
 
 		 235 aa  147  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0984  alanine racemase domain protein  39.18 
 
 		 271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3879  hypothetical protein  45.37 
 
 		 239 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.145132  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3884  hypothetical protein  42.22 
 
 		 229 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.508799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0647  alanine racemase domain-containing protein  46.8 
 
 		 232 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  40.97 
 
 		 231 aa  145  5e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  40.61 
 
 		 244 aa  145  5e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  45.34 
 
 		 232 aa  145  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0621  hypothetical protein  46.26 
 
 		 268 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3817  hypothetical protein  46.02 
 
 		 257 aa  144  9e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1288  hypothetical protein  45.18 
 
 		 232 aa  144  9e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0699  alanine racemase domain-containing protein  45.81 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.239195  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0247  hypothetical protein  45.81 
 
 		 239 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0731  hypothetical protein  45.81 
 
 		 239 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18938  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2919  alanine racemase domain protein  43.59 
 
 		 238 aa  143  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1630  alanine racemase domain-containing protein  41.78 
 
 		 229 aa  142  6e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00531953 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2507  alanine racemase domain protein  43.64 
 
 		 238 aa  142  6e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.813169 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2108  hypothetical protein  42.92 
 
 		 241 aa  142  6e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0775  alanine racemase domain protein  40.18 
 
 		 241 aa  141  8e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1137  alanine racemase domain-containing protein  40.19 
 
 		 233 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.343329 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  40.97 
 
 		 234 aa  141  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4019  alanine racemase domain protein  38.4 
 
 		 270 aa  140  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3839  alanine racemase domain protein  39.24 
 
 		 280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0543  membrane protein, related to K+ transport  35.37 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.42956  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2732  hypothetical protein  40.53 
 
 		 244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.688712  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2919  alanine racemase domain protein  44.34 
 
 		 236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489919  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1215  hypothetical protein  36.28 
 
 		 231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.157009  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2415  alanine racemase domain protein  41.59 
 
 		 237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2875  alanine racemase domain protein  38.63 
 
 		 234 aa  139  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.99771  normal  0.581883 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2263  alanine racemase domain protein  41.59 
 
 		 212 aa  139  3e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03578  hypothetical protein  39.57 
 
 		 236 aa  139  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1127  alanine racemase domain-containing protein  39.63 
 
 		 233 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0116545  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4047  alanine racemase domain protein  38.43 
 
 		 233 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0138922  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  38.77 
 
 		 237 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6110  alanine racemase domain protein  36.8 
 
 		 244 aa  139  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2655  alanine racemase domain-containing protein  46.31 
 
 		 235 aa  138  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.042433 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  43.63 
 
 		 228 aa  138  6e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4142  alanine racemase domain-containing protein  36.86 
 
 		 243 aa  138  6e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>