86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0264 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0264  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 
266 aa  532  1e-150  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.0227624 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2661  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 
266 aa  532  1e-150  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260623  normal  0.584947 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0853  putative transmembrane anti-sigma factor  52.33 
 
 
274 aa  242  5e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5734  putative transmembrane anti-sigma factor  52.47 
 
 
266 aa  233  3e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2754  putative transmembrane anti-sigma factor  46.95 
 
 
268 aa  231  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5261  putative transmembrane anti-sigma factor  49.23 
 
 
268 aa  221  7e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.127786  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3793  hypothetical protein  37.16 
 
 
265 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0670841  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2754  putative transmembrane anti-sigma factor  40.29 
 
 
271 aa  178  5.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3142  transmembrane protein  41.76 
 
 
277 aa  176  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3279  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  41.88 
 
 
277 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1310  hypothetical protein  40.7 
 
 
259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1209  anti-sigma factor  39.77 
 
 
256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.736755 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2466  hypothetical protein  38.19 
 
 
256 aa  157  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2549  putative transmembrane transcriptional regulator  35.21 
 
 
272 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2555  putative transmembrane anti-sigma factor  40.38 
 
 
279 aa  150  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00539506 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3001  putative transmembrane anti-sigma factor  37.45 
 
 
279 aa  150  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.166986  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2782  putative transmembrane anti-sigma factor  38.35 
 
 
260 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.826576  normal  0.798214 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1672  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  35.16 
 
 
275 aa  149  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4979  putative transmembrane anti-sigma factor  34.8 
 
 
275 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291853  normal  0.0783383 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3260  putative transmembrane anti-sigma factor  37.64 
 
 
286 aa  146  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.760903  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3398  putative transmembrane anti-sigma factor  40 
 
 
260 aa  145  6e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.745464  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2913  putative transmembrane anti-sigma factor  37.55 
 
 
286 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030577 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5401  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  34.36 
 
 
271 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0522  hypothetical protein  35.23 
 
 
264 aa  144  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0229  hypothetical protein  37.2 
 
 
255 aa  142  4e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1653  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  40.16 
 
 
253 aa  141  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000000192348  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0145  putative transmembrane anti-sigma factor  40.54 
 
 
256 aa  139  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.617823  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0298  putative transmembrane anti-sigma factor  38 
 
 
257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0173  putative transmembrane anti-sigma factor  36.4 
 
 
255 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.365386  normal  0.0709192 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1998  putative transmembrane anti-sigma factor  35.09 
 
 
269 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.706225  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1708  putative transmembrane anti-sigma factor  35.71 
 
 
264 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2523  putative transmembrane anti-sigma factor  35.88 
 
 
260 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.690899  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0019  putative transmembrane anti-sigma factor  31.87 
 
 
277 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.836012 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3377  putative transmembrane anti-sigma factor  37.41 
 
 
294 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1253  putative transmembrane anti-sigma factor  40 
 
 
279 aa  131  9e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0479785  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2783  putative transmembrane transcriptional regulator(anti-sigma factor) protein, PrtR  36.82 
 
 
283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.32667 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1667  putative transmembrane anti-sigma factor  36.82 
 
 
283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.519316  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2037  putative transmembrane anti-sigma factor  35.29 
 
 
253 aa  123  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000249253 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2982  hypothetical protein  36.76 
 
 
286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3944  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  33.74 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00740335  normal  0.0369582 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3198  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  39.02 
 
 
252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000206133  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3667  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma-factor)  32.78 
 
 
250 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000130088  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0059  putative transmembrane anti-sigma factor  37.96 
 
 
252 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.13724  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0012  putative transmembrane anti-sigma factor  37.96 
 
 
252 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237975  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1501  hypothetical protein  33.07 
 
 
274 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.204589  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0033  putative transmembrane anti-sigma factor  37.5 
 
 
252 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00163217  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0745  putative transmembrane anti-sigma factor  33.47 
 
 
259 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0155499 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0826  putative transmembrane anti-sigma factor  34.27 
 
 
259 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00528212  hitchhiker  0.000460261 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3785  putative transmembrane anti-sigma factor  37.09 
 
 
274 aa  103  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1186  hypothetical protein  31.91 
 
 
274 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.128596  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0855  putative transmembrane anti-sigma factor  33.87 
 
 
260 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.366382  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0728  putative transmembrane anti-sigma factor  34.15 
 
 
261 aa  99.8  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.48642  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0015  hypothetical protein  39.69 
 
 
495 aa  99.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.689839  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1414  hypothetical protein  32.3 
 
 
274 aa  99  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.142705  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1155  hypothetical protein  31.91 
 
 
274 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0145  hypothetical protein  31.91 
 
 
274 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261228  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0424  hypothetical protein  31.91 
 
 
274 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.365685  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1386  hypothetical protein  33.33 
 
 
270 aa  96.7  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0048642  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2533  putative transmembrane anti-sigma factor  35.18 
 
 
260 aa  94  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420248  normal  0.0303873 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0008  putative transmembrane anti-sigma factor  34.95 
 
 
253 aa  92.8  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0328629 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0009  putative transmembrane anti-sigma factor  35 
 
 
253 aa  92.4  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343688  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2392  putative transmembrane anti-sigma factor  32.28 
 
 
250 aa  92  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0017  putative transmembrane anti-sigma factor  35 
 
 
253 aa  92  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00133889  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0070  transmembrane regulator PrtR  31.67 
 
 
250 aa  89  8e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2801  putative transmembrane anti-sigma factor  30.86 
 
 
250 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.261643 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2889  putative transmembrane anti-sigma factor  30.53 
 
 
250 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00655403  normal  0.801415 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2285  putative transmembrane anti-sigma factor  29.46 
 
 
275 aa  85.9  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.15965 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0373  putative transmembrane anti-sigma factor  38.66 
 
 
126 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.227866  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0293  transmembrane regulator PrtR  32.78 
 
 
252 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000206398  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0083  transmembrane regulator PrtR  33.2 
 
 
252 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0083  transmembrane regulator PrtR  32.78 
 
 
252 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273948  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2893  putative transmembrane anti-sigma factor  31.89 
 
 
250 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138399  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6219  transcriptional regulator  28.02 
 
 
274 aa  66.6  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0474635  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3067  putative transmembrane anti-sigma factor  27.76 
 
 
281 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0599961  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6012  putative transmembrane anti-sigma factor  26.85 
 
 
255 aa  62.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.784619  normal  0.0731526 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4551  putative transmembrane anti-sigma factor  36.59 
 
 
257 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.902003  decreased coverage  0.00125777 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7160  putative transmembrane anti-sigma factor  26.36 
 
 
255 aa  55.8  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.494902  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2803  putative transmembrane anti-sigma factor  26.89 
 
 
280 aa  55.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0342001 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4483  putative transmembrane anti-sigma factor  25.29 
 
 
259 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.662421  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3094  putative transmembrane anti-sigma factor  34.51 
 
 
255 aa  46.6  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.334579  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3821  putative transmembrane anti-sigma factor  34.51 
 
 
255 aa  46.2  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.563425 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4456  putative transmembrane anti-sigma factor  26.42 
 
 
252 aa  44.3  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1369  putative transmembrane anti-sigma factor  41.67 
 
 
256 aa  43.5  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3672  hypothetical protein  43.55 
 
 
255 aa  42.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.671386 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1789  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  26.23 
 
 
228 aa  42.7  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3435  putative transmembrane anti-sigma factor  23.17 
 
 
265 aa  42  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>