More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0170 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0170  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  100 
 
 
501 aa  993    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.679833  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2478  NADH dehydrogenase (quinone)  69.65 
 
 
492 aa  657    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.487557 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0933  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  64.48 
 
 
502 aa  629  1e-179  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1264  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  64.31 
 
 
503 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0324503 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3851  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  63.31 
 
 
503 aa  578  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.425582  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1400  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  55.98 
 
 
482 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0920  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  49.54 
 
 
516 aa  375  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1138  hydrogenase subunit  46.15 
 
 
527 aa  372  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0311036  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3288  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  46.08 
 
 
519 aa  373  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.14856  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4667  hydrogenase 4 subunit G  45.53 
 
 
514 aa  364  2e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.986005  normal  0.679723 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1811  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  44.14 
 
 
515 aa  361  2e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2153  hydrogenase-4, G subunit  44.14 
 
 
515 aa  361  2e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6069  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  44.4 
 
 
524 aa  360  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00289137 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0325  putative formate hydrogenlyase subunit  43.03 
 
 
515 aa  361  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0175  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit  43.69 
 
 
522 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1265  hydrogenase-3, subunit E  46.39 
 
 
559 aa  350  4e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0101141  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0107  hydrogenase subunit  44.81 
 
 
567 aa  324  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1613  putative hydrogenase subunit  44.81 
 
 
574 aa  324  2e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1528  putative hydrogenase subunit  44.81 
 
 
574 aa  323  3e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2464  NADH dehydrogenase (quinone)  42.21 
 
 
531 aa  303  6.000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.511351  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4707  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  42.92 
 
 
486 aa  298  1e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10088  formate hydrogenase hycE  43.76 
 
 
492 aa  288  2e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.301164  normal  0.197013 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2989  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  42.05 
 
 
506 aa  284  3.0000000000000004e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.016212  hitchhiker  0.00562837 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3785  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  38.39 
 
 
515 aa  280  3e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.315955 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1123  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  37.73 
 
 
526 aa  279  9e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.165135  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3717  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  38.15 
 
 
521 aa  278  2e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.000990438  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3800  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  37.95 
 
 
521 aa  276  6e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0795  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  38.02 
 
 
525 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1687  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  36.41 
 
 
530 aa  272  9e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4284  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  37.2 
 
 
551 aa  272  1e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0699  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  34.93 
 
 
524 aa  271  2e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.758996  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3659  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  37.68 
 
 
521 aa  270  4e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3188  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  38.01 
 
 
503 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.377236  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1303  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  35.27 
 
 
478 aa  265  2e-69  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0888  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  36.2 
 
 
507 aa  265  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1073  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  36.3 
 
 
503 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.1537600000000002e-34 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0743  NAD-dependent dehydrogenase subunit  38.16 
 
 
505 aa  262  1e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1818  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  38.34 
 
 
519 aa  262  1e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.207478  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4465  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  41.6 
 
 
391 aa  260  4e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.314486  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2554  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  33.59 
 
 
506 aa  259  9e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1317  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  35.9 
 
 
526 aa  256  7e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1571  hydrogenase, group 4, HycE subunit, putative  37.26 
 
 
526 aa  255  2.0000000000000002e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0265592  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0371  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  35.57 
 
 
502 aa  251  3e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1449  hydrogenase, HycE subunit  37.58 
 
 
526 aa  248  1e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0376579  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2622  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  36.4 
 
 
493 aa  239  1e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2597  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  34.6 
 
 
506 aa  237  4e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3217  hypothetical protein  39.08 
 
 
513 aa  235  1.0000000000000001e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728125  normal  0.0835857 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3430  hypothetical protein  39.08 
 
 
513 aa  234  3e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0340  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  33.92 
 
 
504 aa  230  4e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0164129  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2466  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  36.44 
 
 
499 aa  224  4e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278234  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3280  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  34.85 
 
 
498 aa  218  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2186  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  33.03 
 
 
574 aa  215  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.418476 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0774  NAD-dependent dehydrogenase subunit  37.9 
 
 
565 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.133337  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3709  hydrogenase-4, G subunit  31.97 
 
 
571 aa  213  9e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2769  hydrogenase-4, G subunit  31.75 
 
 
571 aa  211  3e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3052  formate hydrogenlyase subunit E  33.33 
 
 
569 aa  210  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.309808 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3036  formate hydrogenlyase subunit E  33.33 
 
 
569 aa  210  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000143989 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3001  formate hydrogenlyase subunit E  33.33 
 
 
569 aa  210  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.33609  normal  0.016492 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3159  formate hydrogenlyase, subunit E  33.33 
 
 
569 aa  210  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.146854 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2970  formate hydrogenlyase, subunit E  33.33 
 
 
569 aa  210  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2634  hydrogenase-4, G subunit  31.75 
 
 
571 aa  210  5e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0183  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  33.95 
 
 
567 aa  209  7e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02571  hydrogenase 3, large subunit  33.11 
 
 
569 aa  209  8e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.671666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0968  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  33.11 
 
 
569 aa  209  8e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2857  formate hydrogenlyase, subunit E  33.11 
 
 
569 aa  209  8e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0991  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  33.11 
 
 
569 aa  209  8e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0591467 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02536  hypothetical protein  33.11 
 
 
569 aa  209  8e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.576982  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3009  formate hydrogenlyase, subunit E  33.11 
 
 
569 aa  209  9e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3972  formate hydrogenlyase, subunit E  33.11 
 
 
576 aa  209  9e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3155  formate hydrogenlyase, subunit E  32.88 
 
 
569 aa  209  1e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2846  formate hydrogenlyase, subunit E  33.11 
 
 
576 aa  209  1e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.15789 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3059  Ni Fe-hydrogenase III large subunit-like protein  37.12 
 
 
510 aa  206  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000957006  normal  0.573719 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2859  hydrogenase-4, G subunit  31.32 
 
 
571 aa  204  2e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2430  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  32.27 
 
 
567 aa  204  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.85735  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0939  hydrogenase, component E-formate hydrogenlyase subunit 5-like protein  29.98 
 
 
518 aa  205  2e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.297277  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2713  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  31.75 
 
 
575 aa  204  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1280  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  32.18 
 
 
575 aa  204  3e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.637418  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3194  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  32.42 
 
 
569 aa  203  5e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1790  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  34.01 
 
 
518 aa  201  3e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.57722  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02379  hydrogenase 4, subunit  31.1 
 
 
555 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1182  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  31.1 
 
 
555 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1189  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  31.1 
 
 
555 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.454918 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02341  hypothetical protein  31.1 
 
 
555 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2621  hydrogenase-4, G subunit  30.89 
 
 
555 aa  195  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00990  Ni,Fe-hydrogenase III large subunit  31.89 
 
 
576 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.823272  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1866  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  29.82 
 
 
579 aa  182  1e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4570  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  29.98 
 
 
571 aa  180  7e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1425  ech hydrogenase subunit E  32.01 
 
 
361 aa  178  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3020  ech hydrogenase subunit E  31.76 
 
 
359 aa  178  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1734  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  30 
 
 
359 aa  177  5e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00563551  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0553  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  32.66 
 
 
358 aa  176  7e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0728  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  33.33 
 
 
499 aa  176  8e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0174132  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1071  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  29.89 
 
 
537 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0867  hydrogenase, group 4, EchE subunit, putative  31.64 
 
 
359 aa  173  5.999999999999999e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.195553  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4501  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  31.82 
 
 
361 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0565202 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0964  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  30.92 
 
 
366 aa  172  1e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.138643 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0803  NADH dehydrogenase (quinone)  33.63 
 
 
359 aa  171  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3189  NADH dehydrogenase (quinone)  29.48 
 
 
377 aa  168  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.482242 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1102  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  30.4 
 
 
358 aa  167  5e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0785  ech hydrogenase subunit E  30.23 
 
 
359 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>