More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0106 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0106  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  100 
 
 
106 aa  218  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.809451 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5909  Iron-binding protein IscA (iron-sulfur cluster assembly protein)  75.24 
 
 
107 aa  167  6e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3622  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  66.67 
 
 
106 aa  141  4e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.246464 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3583  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  60.38 
 
 
106 aa  130  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0213074 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0532  hypothetical protein  56.19 
 
 
106 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0361463  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2184  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  56.19 
 
 
106 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.24202 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1083  HesB/YadR/YfhF  58.49 
 
 
106 aa  125  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1255  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  56.19 
 
 
106 aa  124  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1560  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  63.81 
 
 
106 aa  123  7e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5091  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  61.11 
 
 
106 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0979  HesB/YadR/YfhF  60.38 
 
 
106 aa  123  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.29141 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4021  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  54.72 
 
 
106 aa  122  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0483  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  55.66 
 
 
107 aa  122  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4453  HesB/YadR/YfhF  54.72 
 
 
106 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1509  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  55.24 
 
 
122 aa  114  6.9999999999999995e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00886553  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1227  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  55.24 
 
 
122 aa  114  6.9999999999999995e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000951684 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01610  Nitrogen fixation Fe-S cluster assembly protein IscAnif  50.48 
 
 
107 aa  108  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2271  HesB/YadR/YfhF  51.43 
 
 
110 aa  108  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.563165  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1795  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.08 
 
 
119 aa  104  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1823  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.08 
 
 
119 aa  104  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1513  HesB/YadR/YfhF  45.71 
 
 
107 aa  101  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0694  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.08 
 
 
110 aa  101  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.134882  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3939  HesB/YadR/YfhF  48.15 
 
 
123 aa  100  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0246542 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3562  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.81 
 
 
127 aa  98.2  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.558968  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3589  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.19 
 
 
127 aa  97.8  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200335 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3630  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.81 
 
 
127 aa  98.2  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3478  HesB/YadR/YfhF  42.86 
 
 
127 aa  97.4  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2652  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.67 
 
 
105 aa  97.4  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.758195  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0240  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.06 
 
 
120 aa  96.7  8e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4257  HesB/YadR/YfhF  42.59 
 
 
123 aa  96.7  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1413  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.95 
 
 
118 aa  96.3  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4331  FeS assembly scaffold SufA  43.27 
 
 
126 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3701  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.04 
 
 
108 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3392  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.04 
 
 
108 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.585208  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2171  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.08 
 
 
108 aa  94.7  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.367568  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0997  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.23 
 
 
125 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.147129  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4614  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.15 
 
 
141 aa  94.7  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.642683  normal  0.147205 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4477  HesB/YadR/YfhF  47.22 
 
 
206 aa  94.4  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0747916  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1343  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.86 
 
 
124 aa  94.4  5e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.388172  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1235  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.1 
 
 
116 aa  93.6  9e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.014396  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2468  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.12 
 
 
108 aa  93.2  9e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.698044  normal  0.0161049 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2887  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.9 
 
 
120 aa  92.8  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3325  FeS assembly scaffold SufA  42.31 
 
 
126 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2733  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40 
 
 
139 aa  92.8  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1480  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.15 
 
 
110 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.692508  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5101  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.27 
 
 
116 aa  92  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000105722  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6870  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.17 
 
 
206 aa  92.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3583  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.12 
 
 
108 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.143681  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0349  HesB/YadR/YfhF  40.95 
 
 
113 aa  91.7  3e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46030  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.12 
 
 
116 aa  91.7  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1815  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.23 
 
 
116 aa  91.7  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.444261  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1303  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.9 
 
 
116 aa  91.7  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00012282 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3930  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.31 
 
 
116 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0777842  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2209  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.42 
 
 
119 aa  91.3  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2279  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.95 
 
 
130 aa  91.3  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000000652366  hitchhiker  0.00000000102221 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2353  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.19 
 
 
108 aa  91.3  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.130413  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4144  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.42 
 
 
116 aa  90.9  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0915367  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2452  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.45 
 
 
121 aa  90.5  7e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.162096 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0653  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.16 
 
 
116 aa  90.1  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.8310399999999997e-21  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1463  FeS assembly scaffold SufA  42.31 
 
 
130 aa  90.5  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0458373 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0605  HesB/YadR/YfhF family protein  42.31 
 
 
116 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4568  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.31 
 
 
116 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.420029  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2712  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.66 
 
 
118 aa  89.4  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.573216 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0806  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.14 
 
 
116 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106738  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3032  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.95 
 
 
121 aa  89.4  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2494  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.59 
 
 
121 aa  89  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.686511  normal  0.176727 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08510  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.14 
 
 
116 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.64455  hitchhiker  0.000000019455 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0433  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.35 
 
 
132 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.282495  normal  0.240783 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0463  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.35 
 
 
132 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0092949  normal  0.21785 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0629  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.34 
 
 
110 aa  88.2  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0466  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.35 
 
 
132 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.147286  hitchhiker  0.00198975 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0620  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.34 
 
 
110 aa  88.2  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.779082  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0594  HesB/YadR/YfhF  44.34 
 
 
110 aa  88.2  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0939  HesB/YadR/YfhF family protein  41.35 
 
 
126 aa  87.8  4e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.665013  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4803  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50 
 
 
121 aa  87.8  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.901063 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0323  HesB/YadR/YfhF  50 
 
 
140 aa  87.8  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000000123552  hitchhiker  0.00657769 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2752  iron-sulfur cluster assembly scaffold protein  40.95 
 
 
123 aa  87.8  5e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.203289  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2109  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.12 
 
 
124 aa  87.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00107266 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2247  FeS assembly scaffold SufA  42.31 
 
 
126 aa  87.4  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0453155  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0934  hesb protein  41.35 
 
 
168 aa  87.4  6e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4462  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.38 
 
 
126 aa  87  7e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.155055 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2815  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.35 
 
 
116 aa  87  7e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0995979  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0639  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.38 
 
 
109 aa  87  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.248132  normal  0.354977 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4770  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.35 
 
 
132 aa  87  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00616694  normal  0.727621 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0867  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.35 
 
 
118 aa  87  8e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0569822  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2450  iron-sulfur cluster assembly scaffold protein  40 
 
 
123 aa  86.7  9e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.121814  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3125  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.48 
 
 
110 aa  86.7  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185787  normal  0.24612 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2702  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.22 
 
 
123 aa  86.7  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.840574  normal  0.551617 
 
 
-
 
NC_004310  BR0875  HesB/YadR/YfhF family protein  43.27 
 
 
108 aa  86.3  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.699772  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0648  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.22 
 
 
123 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010158  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0601  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.22 
 
 
123 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00222893  normal  0.443525 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0725  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.35 
 
 
120 aa  86.7  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1581  HesB/YadR/YfhF  45.71 
 
 
186 aa  86.7  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.617469  normal  0.0534413 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0901  HesB/YadR/YfhF  49.51 
 
 
107 aa  86.3  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0198  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.22 
 
 
123 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0800429  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3982  FeS assembly scaffold SufA  40.38 
 
 
126 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4351  FeS assembly scaffold SufA  40.38 
 
 
126 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.836672 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0959  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.14 
 
 
119 aa  86.7  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0861768  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0575  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.22 
 
 
123 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0103846  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0681  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.22 
 
 
123 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0105609  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>