112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0103 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
153 aa  311  1.9999999999999998e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5912  hypothetical protein  69.49 
 
 
155 aa  187  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0350  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  46.15 
 
 
217 aa  124  4.0000000000000003e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0130  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.44 
 
 
149 aa  117  7.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4253  hypothetical protein  41.67 
 
 
144 aa  110  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.825501  normal  0.678624 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1174  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.5 
 
 
142 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2495  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.6 
 
 
151 aa  105  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.746892 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2167  hypothetical protein  40.83 
 
 
149 aa  104  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3574  Rieske (2Fe-2S) region  45.19 
 
 
117 aa  100  9e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.556915  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2849  Rieske (2Fe-2S) protein  38.18 
 
 
118 aa  92  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0858  Rieske (2Fe-2S) region  38.94 
 
 
120 aa  86.7  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0972  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  41.84 
 
 
110 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000277135  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0838  Rieske [2Fe-2S] region  38.74 
 
 
132 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000649112 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0114  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.58 
 
 
108 aa  85.9  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.225812  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1935  hypothetical protein  39.09 
 
 
120 aa  85.1  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.455363  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4801  Rieske (2Fe-2S) region  41.24 
 
 
105 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0146102  hitchhiker  0.00629459 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0992  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.3 
 
 
105 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0130458  hitchhiker  0.00000000116756 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1043  hypothetical protein  40.74 
 
 
138 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0922873  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01838  rieske  42.5 
 
 
113 aa  78.6  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.318103  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3370  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  42.86 
 
 
104 aa  78.2  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0252226 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4829  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.86 
 
 
119 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.642068 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0114  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.12 
 
 
122 aa  77.4  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0228441  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4226  Rieske (2Fe-2S) protein  45.59 
 
 
133 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40748  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5626  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.58 
 
 
111 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.164476 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3193  Rieske (2Fe-2S) domain protein  43.59 
 
 
111 aa  75.1  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.242192  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3905  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  41.41 
 
 
114 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.391138  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0990  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.65 
 
 
136 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0973  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.18 
 
 
130 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0515815 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3650  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  45.12 
 
 
130 aa  72.8  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.27405 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0994  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.65 
 
 
136 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0908  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.46 
 
 
130 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.313285  normal  0.0276254 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1065  hypothetical protein  40 
 
 
133 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.967629  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0634  Rieske (2Fe-2S) region  42.65 
 
 
133 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5218  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.58 
 
 
111 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.434864  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1114  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.65 
 
 
133 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2190  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.65 
 
 
132 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0622882 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1072  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.65 
 
 
133 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal  0.136055 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3380  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.35 
 
 
111 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2919  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40 
 
 
134 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00744341  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0523  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  41.67 
 
 
131 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472442  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1710  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  39.24 
 
 
131 aa  72  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0741905  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2437  Rieske (2Fe-2S) region  46.15 
 
 
127 aa  71.6  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.55603  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2487  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  41.67 
 
 
131 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00132222  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2795  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  41.67 
 
 
131 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00324792  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2799  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  41.67 
 
 
131 aa  72  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0503713  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2860  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  41.67 
 
 
131 aa  72  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0573473  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1810  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  41.67 
 
 
131 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0676  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.18 
 
 
123 aa  71.2  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0821  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.67 
 
 
130 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239168  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2272  Rieske (2Fe-2S) region  38.16 
 
 
134 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42610  hypothetical protein  33.67 
 
 
105 aa  69.7  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.217045  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3141  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.77 
 
 
120 aa  70.1  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4690  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.35 
 
 
114 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000178918 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3434  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.59 
 
 
111 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4083  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.59 
 
 
111 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171695  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0589  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.73 
 
 
126 aa  69.3  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.03606 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4554  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.35 
 
 
105 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000741211 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6068  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.42 
 
 
111 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0959217  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4688  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.35 
 
 
105 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0626972  hitchhiker  0.0000000488951 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2008  Rieske (2Fe-2S) region  30.28 
 
 
119 aa  67.4  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2735  Rieske (2Fe-2S) protein  41.49 
 
 
111 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0390389  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1238  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.04 
 
 
109 aa  66.6  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.724379  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0744  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.34 
 
 
105 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.347579  hitchhiker  0.000000000639734 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1561  hypothetical protein  41.38 
 
 
116 aa  66.2  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.150485  normal  0.132727 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1663  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.73 
 
 
118 aa  65.5  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1176  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.67 
 
 
125 aa  66.2  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.262842  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0659  hypothetical protein  33.02 
 
 
136 aa  65.5  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62360  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32.99 
 
 
115 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5427  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32.99 
 
 
107 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3198  ferredoxin, 2Fe-2S  36.17 
 
 
112 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0027175  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1340  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.38 
 
 
116 aa  62.8  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000041033 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1723  Rieske (2Fe-2S) protein  40.98 
 
 
121 aa  62  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4785  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.82 
 
 
126 aa  62  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.453437 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5489  ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  29.41 
 
 
119 aa  61.6  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.121832  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3287  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.57 
 
 
125 aa  60.8  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2640  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.57 
 
 
125 aa  60.8  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0029  Ketohexokinase  36.19 
 
 
420 aa  60.5  0.000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.892362  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1381  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.73 
 
 
123 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5279  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.71 
 
 
124 aa  57.8  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.238737  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3657  Rieske (2Fe-2S) region  35.56 
 
 
121 aa  57.8  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0036  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.46 
 
 
111 aa  57.8  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3083  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.68 
 
 
121 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3084  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.08 
 
 
138 aa  56.2  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.325284  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1421  Rieske (2Fe-2S) region  29.63 
 
 
122 aa  54.3  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.606028 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2795  Rieske iron sulfur-like protein  33.33 
 
 
170 aa  48.9  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2392  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.43 
 
 
124 aa  48.9  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.348824  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1488  PfkB  30.67 
 
 
401 aa  47.8  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1360  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  26.23 
 
 
151 aa  47  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0559  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.5 
 
 
156 aa  45.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0386  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.08 
 
 
171 aa  43.9  0.0009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.166623  normal  0.344702 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3228  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  30.19 
 
 
289 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.769303  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2157  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.25 
 
 
182 aa  42.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00819561  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0476  nitrogen-fixing NifU domain protein  31.25 
 
 
286 aa  42.4  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.140105  normal  0.34365 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3656  Rieske (2Fe-2S) region  32.58 
 
 
105 aa  41.6  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.747877  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4105  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.58 
 
 
105 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4711  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.58 
 
 
105 aa  41.6  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.938131  normal  0.140067 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5589  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.58 
 
 
105 aa  41.6  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587987 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4570  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.58 
 
 
105 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0919723  hitchhiker  0.000210645 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2796  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  29.55 
 
 
108 aa  41.2  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.654028  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3982  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.58 
 
 
105 aa  41.2  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0367029 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>