More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0100 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0100  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
286 aa  580  1.0000000000000001e-165  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.602678  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5914  thiosulfate sulfurtransferase  63.03 
 
 
283 aa  385  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259229  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2925  rhodanese domain-containing protein  48.91 
 
 
283 aa  265  8.999999999999999e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6256  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  48.75 
 
 
285 aa  258  7e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2916  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  46.64 
 
 
286 aa  256  2e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.388128  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2989  rhodanese domain-containing protein  44.89 
 
 
281 aa  256  4e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.700254 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1615  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.29 
 
 
285 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2490  rhodanese-related sulfurtransferase  47.35 
 
 
292 aa  250  2e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36636  normal  0.490803 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4678  rhodanese domain-containing protein  45.9 
 
 
284 aa  244  9.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0122  rhodanese domain-containing protein  44.44 
 
 
282 aa  241  7e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1915  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.42 
 
 
285 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.021654  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3457  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.48 
 
 
285 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.167949  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4133  Rhodanese domain protein  44.57 
 
 
286 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3775  rhodanese domain-containing protein  46.18 
 
 
288 aa  237  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1219  rhodanese domain-containing protein  43.62 
 
 
284 aa  235  6e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.315032  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0405  rhodanese-like protein  42.91 
 
 
284 aa  235  7e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.484971  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5874  rhodanese domain-containing protein  46.76 
 
 
280 aa  234  9e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0631  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.65 
 
 
286 aa  233  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.166979 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6380  Rhodanese domain protein  44.24 
 
 
280 aa  230  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0885  thiosulfate sulfurtransferase, rhodanese-like  43.01 
 
 
282 aa  230  3e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2127  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.52 
 
 
285 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.312853  hitchhiker  0.0057571 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2544  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.01 
 
 
282 aa  230  3e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1365  rhodanese domain-containing protein  42.91 
 
 
287 aa  223  4e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.247662  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1555  mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.73 
 
 
316 aa  219  5e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2634  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  39.57 
 
 
283 aa  218  1e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0430  Rhodanese domain protein  40.79 
 
 
286 aa  218  1e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0030  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.82 
 
 
287 aa  217  2e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.918889 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2263  rhodanese domain-containing protein  42.5 
 
 
284 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.552964  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2142  rhodanese domain-containing protein  41.03 
 
 
284 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.557885  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1877  thiosulfate sulfurtransferase  43.22 
 
 
477 aa  216  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.346194  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0146  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.37 
 
 
291 aa  214  9.999999999999999e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.717164  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2500  Rhodanese domain protein  40.52 
 
 
282 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.585045  normal  0.552129 
 
 
-
 
NC_004310  BR1055  rhodanese family protein  42.12 
 
 
284 aa  213  1.9999999999999998e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2553  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.55 
 
 
289 aa  213  3.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0650161  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3061  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.09 
 
 
279 aa  211  1e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.122579  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2866  rhodanese domain-containing protein  38.18 
 
 
284 aa  209  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1333  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.18 
 
 
284 aa  209  3e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1020  rhodanese family protein  41.76 
 
 
284 aa  209  3e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.85738  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2791  Rhodanese domain protein  40.52 
 
 
282 aa  209  4e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.798975  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3798  rhodanese domain-containing protein  40.52 
 
 
281 aa  209  5e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.271835  normal  0.0625377 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2787  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.82 
 
 
284 aa  208  8e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1113  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  39.58 
 
 
284 aa  207  1e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2568  rhodanese domain-containing protein  40.15 
 
 
282 aa  206  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3021  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.68 
 
 
289 aa  206  4e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.927756  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1426  rhodanese-like protein  41.03 
 
 
281 aa  206  5e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334626  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1436  Rhodanese domain protein  39.56 
 
 
289 aa  206  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.506053  normal  0.624415 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1615  Rhodanese domain protein  39.56 
 
 
289 aa  205  7e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12037  normal  0.481952 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3630  rhodanese-like protein  36.23 
 
 
282 aa  201  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.69295  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3017  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.69 
 
 
281 aa  199  3e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.439328  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1253  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.32 
 
 
289 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2742  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  36.03 
 
 
284 aa  198  7e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2673  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.68 
 
 
281 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.121629  normal  0.540659 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02413  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.68 
 
 
281 aa  194  1e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1147  Rhodanese domain protein  37.68 
 
 
281 aa  194  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1156  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.68 
 
 
281 aa  194  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.831294 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02375  hypothetical protein  37.68 
 
 
281 aa  194  1e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3750  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.68 
 
 
281 aa  194  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.19199  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2805  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.68 
 
 
281 aa  194  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2728  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.5 
 
 
280 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2791  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.5 
 
 
280 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2672  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.32 
 
 
281 aa  192  6e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2772  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.68 
 
 
280 aa  192  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.573482  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2904  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.5 
 
 
280 aa  192  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.823076  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2896  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.32 
 
 
281 aa  191  1e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2685  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.05 
 
 
280 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362659  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1432  rhodanese domain-containing protein  37.92 
 
 
281 aa  191  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.90665  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0193  Rhodanese domain protein  40 
 
 
284 aa  187  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0926264  normal  0.228732 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0854  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  36.46 
 
 
289 aa  186  4e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2642  rhodanese-like protein  37.32 
 
 
286 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1494  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.46 
 
 
276 aa  172  3.9999999999999995e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.732763 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_13229  predicted protein  38.46 
 
 
304 aa  168  1e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0726  rhodanese domain-containing protein  36.07 
 
 
291 aa  167  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.893447  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3747  rhodanese-like protein  36.13 
 
 
290 aa  163  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.745396  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0321  rhodanese domain-containing protein  35.82 
 
 
288 aa  161  9e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2802  thiosulfate sulfurtransferase  33.33 
 
 
290 aa  158  8e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0562  putative thiosulfate sulfurtransferase SseA  32.26 
 
 
276 aa  154  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06252  thiosulfate sulfurtransferase SseA  32.73 
 
 
276 aa  150  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0188  Rhodanese domain protein  35.31 
 
 
285 aa  150  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1047  Rhodanese domain protein  33.79 
 
 
289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1705  rhodanese-like domain-containing protein  31.62 
 
 
277 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0165982  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1745  rhodanese-like domain protein  31.62 
 
 
277 aa  145  5e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000561696  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1892  Rhodanese domain protein  31.79 
 
 
278 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.474796  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1310  rhodanese domain-containing protein  30.15 
 
 
276 aa  144  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.965267  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1618  Rhodanese domain protein  32.43 
 
 
291 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.97892  normal  0.0367317 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3006  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.68 
 
 
285 aa  143  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.148603  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3103  rhodanese domain-containing protein  34.02 
 
 
285 aa  142  4e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1669  rhodanese-like domain protein  31.77 
 
 
277 aa  142  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2924  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.1 
 
 
285 aa  142  6e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.860252  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1483  rhodanese-like domain-containing protein  31.77 
 
 
277 aa  142  7e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1599  rhodanese-like domain-containing protein  31.77 
 
 
277 aa  142  7e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.317702  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1261  mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.69 
 
 
285 aa  142  8e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1455  thiosulfate sulfurtransferase  31.41 
 
 
277 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1455  thiosulfate sulfurtransferase  31.62 
 
 
277 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1634  rhodanese-like domain protein  31.62 
 
 
277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0494002  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1326  Rhodanese domain protein  35.97 
 
 
283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0377463  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3711  rhodanese-like domain protein  30.51 
 
 
277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.584837  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000488  rhodanese-related sulfurtransferase  33.57 
 
 
276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.572454  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0968  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.36 
 
 
284 aa  139  6e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10395  thiosulfate sulfurtransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01370)  32.71 
 
 
344 aa  139  7e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0802234  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2221  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.8 
 
 
283 aa  138  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.28427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>