34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0097 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0097  NifQ family protein  100 
 
 
222 aa  452  1e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428951  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1561  NifQ family protein  42.93 
 
 
205 aa  170  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3988  NifQ family protein  43.17 
 
 
257 aa  147  1e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.152989  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5878  putative nitrogen fixation protein nifQ  43.72 
 
 
245 aa  146  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.103781  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3623  NifQ family protein  43.32 
 
 
231 aa  138  7e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0978  NifQ  40.11 
 
 
236 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.789318  normal  0.328088 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4454  NifQ  41.85 
 
 
235 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1082  NifQ  40.22 
 
 
235 aa  136  3e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5092  NifQ family protein  40.62 
 
 
236 aa  131  6e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3543  NifQ family protein  41.63 
 
 
217 aa  128  6e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.910171  normal  0.0106924 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0482  NifQ family protein  45.61 
 
 
215 aa  118  7e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2281  NifQ  37.24 
 
 
222 aa  110  2e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1355  NifQ family protein  34.01 
 
 
224 aa  102  7e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0280  NifQ family protein  35.8 
 
 
197 aa  96.7  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.239171  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1448  NifQ  34.86 
 
 
190 aa  95.9  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0239  nitrogen fixation protein nifQ, putative  33.15 
 
 
197 aa  93.6  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.305155  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2319  NifQ family protein  36.2 
 
 
200 aa  89.4  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00231718  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1254  NifQ family protein  40 
 
 
179 aa  87.8  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.594431  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7734  NifQ family protein  35.16 
 
 
192 aa  86.7  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51040  Nitrogen fixation cofactor assembly protein  31.55 
 
 
195 aa  85.1  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0404512  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0315  NifU-like protein  28.95 
 
 
335 aa  84.3  1e-15  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.02631e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2185  NifQ family protein  36.31 
 
 
179 aa  82.8  4e-15  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.149657 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0533  putative nitrogen fixation protein nifQ  42.71 
 
 
179 aa  82.4  5e-15  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.057616  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1511  nitrogen fixation protein NifQ  43.9 
 
 
217 aa  82.4  5e-15  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.203705  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1229  NifQ family protein  43.9 
 
 
217 aa  82.4  5e-15  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.411993  hitchhiker  0.000327606 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0514  NifQ family protein  37.33 
 
 
170 aa  81.6  9e-15  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1209  NifQ family protein  32.19 
 
 
204 aa  81.6  1e-14  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0325483 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1476  putative nitrogen fixation-related protein(NifQ)  50.7 
 
 
192 aa  79  6e-14  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000951053 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4126  putative nitrogen fixation protein NifQ  34.9 
 
 
210 aa  73.9  2e-12  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.850177  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5817  hypothetical protein  31.85 
 
 
195 aa  57.4  2e-07  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0755025  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6182  NifQ family protein  31.85 
 
 
195 aa  57.4  2e-07  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29812  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6662  NifQ family protein  42.31 
 
 
195 aa  55.8  5e-07  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0612725  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7727  hypothetical protein  34.85 
 
 
199 aa  55.1  8e-07  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6153  NifQ family protein  37.18 
 
 
202 aa  49.3  5e-05  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.439751  normal  0.16118 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>