28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0095 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0095  hypothetical protein  100 
 
 
66 aa  126  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.253511  normal  0.848098 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0480  hypothetical protein  75.41 
 
 
66 aa  93.6  8e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5918  hypothetical protein  71.21 
 
 
66 aa  93.6  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.315015  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1080  hypothetical protein  69.23 
 
 
68 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1563  protein of unknown function DUF683  66.67 
 
 
69 aa  90.1  9e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4456  hypothetical protein  66.15 
 
 
68 aa  87  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5094  protein of unknown function DUF683  67.69 
 
 
68 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0976  hypothetical protein  64.62 
 
 
68 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3625  protein of unknown function DUF683  60.61 
 
 
66 aa  79.7  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.172508 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1353  hypothetical protein  63.33 
 
 
66 aa  78.6  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3541  hypothetical protein  56.92 
 
 
65 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00864487 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2321  hypothetical protein  60.71 
 
 
66 aa  73.2  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0251723  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7732  hypothetical protein  56.92 
 
 
72 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1513  hypothetical protein  51.67 
 
 
87 aa  71.6  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.266242  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1231  protein of unknown function DUF683  51.67 
 
 
87 aa  71.6  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278631 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1474  hypothetical protein  69.57 
 
 
68 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.909815  hitchhiker  0.000297198 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3989  ferredoxin III, nif-specific  52.54 
 
 
179 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0809121  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6874  hypothetical protein  50 
 
 
87 aa  67.4  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.258333 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4800  protein of unknown function DUF683  46.67 
 
 
84 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1346  hypothetical protein  49.21 
 
 
66 aa  64.7  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.780671  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0237  hypothetical protein  54.72 
 
 
63 aa  63.9  0.0000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.260551  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6220  hypothetical protein  50 
 
 
67 aa  60.8  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3936  hypothetical protein  42.86 
 
 
71 aa  60.5  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0231611 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4481  hypothetical protein  51.16 
 
 
88 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4254  hypothetical protein  44.26 
 
 
82 aa  58.2  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2112  protein of unknown function DUF683  44.26 
 
 
78 aa  57.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268898 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1792  protein of unknown function DUF683  39.34 
 
 
76 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1820  protein of unknown function DUF683  39.34 
 
 
76 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>