36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0094 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0094  hypothetical protein  100 
 
 
156 aa  322  1e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.123891  normal  0.916048 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5919  hypothetical protein  79.49 
 
 
156 aa  260  6e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29421  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4457  hypothetical protein  71.71 
 
 
155 aa  239  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3626  nitrogen fixation protein  73.08 
 
 
155 aa  236  1e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.136981 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0236  hypothetical protein  70.07 
 
 
152 aa  227  4e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0970015  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5095  nitrogen fixation protein  65.16 
 
 
154 aa  224  4e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0975  hypothetical protein  66.23 
 
 
154 aa  223  7e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1079  hypothetical protein  67.86 
 
 
155 aa  218  2e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0479  nitrogen fixation protein  66.67 
 
 
156 aa  215  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1232  nitrogen fixation protein  65.73 
 
 
155 aa  212  2e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000318988 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1514  hypothetical protein  65.73 
 
 
155 aa  212  2e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.111049  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1473  hypothetical protein  58.75 
 
 
165 aa  207  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554599  decreased coverage  0.000104665 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2322  hypothetical protein  57.14 
 
 
170 aa  204  5e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0454045  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1352  nitrogen fixation protein  58.86 
 
 
159 aa  198  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2283  hypothetical protein  51.39 
 
 
157 aa  174  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3990  nitrogen fixation protein  53.57 
 
 
160 aa  173  1e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186093  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3540  nitrogen fixation protein  52.78 
 
 
158 aa  172  1e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.859638  hitchhiker  0.00968593 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1564  nitrogen fixation protein  53.25 
 
 
153 aa  170  8e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0535  hypothetical protein  53.62 
 
 
156 aa  160  4e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385601  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2187  hypothetical protein  53.62 
 
 
156 aa  160  4e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0900342 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1252  hypothetical protein  52.9 
 
 
156 aa  159  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0266  hypothetical protein  46.48 
 
 
169 aa  145  2e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1192  hypothetical protein  42.03 
 
 
149 aa  134  7e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  decreased coverage  7.19142e-05 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1508  hypothetical protein  40 
 
 
153 aa  132  2e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.689838  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1347  nitrogen fixation protein  44.2 
 
 
158 aa  131  3e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.629038  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01490  hypothetical protein  37.09 
 
 
160 aa  125  2e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2113  nitrogen fixation protein  41.13 
 
 
159 aa  125  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00558029 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3935  hypothetical protein  41.73 
 
 
158 aa  123  8e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0255327 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4253  hypothetical protein  37.58 
 
 
158 aa  120  7e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1791  nitrogen fixation protein  37.86 
 
 
156 aa  118  2e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1819  nitrogen fixation protein  37.86 
 
 
156 aa  118  4e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4141  hypothetical protein  37.68 
 
 
156 aa  112  1e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4799  nitrogen fixation protein  35.92 
 
 
157 aa  110  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4482  hypothetical protein  37.23 
 
 
147 aa  104  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.995501  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6875  hypothetical protein  37.23 
 
 
155 aa  103  9e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2115  hypothetical protein  25.55 
 
 
154 aa  60.1  1e-08  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00818252 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>