79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0093 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0093  nitrogen fixation protein NifX  100 
 
 
131 aa  270  5e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.071454  normal  0.884171 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5920  nitrogenase molybdenum-iron protein nifX  83.97 
 
 
131 aa  233  5e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.936872  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3627  nitrogen fixation protein NifX  79.39 
 
 
133 aa  221  3e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.184482 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1233  nitrogen fixation protein NifX  75.19 
 
 
138 aa  213  6e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000802968 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1515  nitrogen fixation protein NifX  75.19 
 
 
138 aa  213  6e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.19909  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0235  nitrogenase molybdenum-iron protein NifX  76.12 
 
 
141 aa  211  4e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00441901  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4458  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  72.52 
 
 
135 aa  201  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2323  nitrogen fixation protein NifX  69.47 
 
 
136 aa  197  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0653956  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0974  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  72.09 
 
 
155 aa  196  8e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.649686  normal  0.349862 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1078  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  72.09 
 
 
132 aa  194  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5096  nitrogen fixation protein NifX  69.77 
 
 
132 aa  193  5e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1472  nitrogen fixation-related protein (NifX)  67.94 
 
 
137 aa  192  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.437364  decreased coverage  9.79183e-05 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0478  nitrogen fixation protein NifX  70.68 
 
 
134 aa  192  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1351  nitrogen fixation protein NifX  64.89 
 
 
143 aa  182  9e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7731  nitrogen fixation protein NifX  64.12 
 
 
138 aa  175  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4798  nitrogen fixation protein NifX  53.44 
 
 
138 aa  156  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1790  nitrogen fixation protein NifX  53.03 
 
 
135 aa  153  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1818  nitrogen fixation protein NifX  53.03 
 
 
135 aa  153  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2114  nitrogen fixation protein NifX  54.55 
 
 
136 aa  153  9e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0083007 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4252  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  51.52 
 
 
134 aa  149  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1348  nitrogen fixation protein NifX  50 
 
 
139 aa  142  1e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.802033  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3934  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  49.23 
 
 
137 aa  140  7e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0518816 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2284  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  50 
 
 
162 aa  139  2e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1565  nitrogen fixation protein NifX  44.78 
 
 
164 aa  134  4e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0671  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  46.88 
 
 
127 aa  130  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.551037 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2805  nitrogenase molybdenum-iron cofactor biosynthesis protein NifX  46.56 
 
 
129 aa  125  2e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6876  nitrogen fixation protein NifX  52.1 
 
 
148 aa  123  8e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3539  nitrogen fixation protein NifX  45.24 
 
 
158 aa  120  7e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.89885  decreased coverage  0.00377232 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0634  nitrogen fixation protein NifX  42.31 
 
 
128 aa  120  7e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1202  nitrogen fixation protein NifX  42.52 
 
 
128 aa  119  1e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.120985  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2140  nitrogen fixation protein NifX  45.67 
 
 
129 aa  118  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0156404 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4140  nitrogen fixation protein NifX  41.35 
 
 
139 aa  117  7e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.480569  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2078  nitrogen fixation protein NifX  45.04 
 
 
129 aa  115  2e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1251  nitrogen fixation protein NifX  44.8 
 
 
157 aa  115  2e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3490  nitrogen fixation protein NifX  44.62 
 
 
132 aa  115  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4483  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  43.7 
 
 
144 aa  114  4e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.746591  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2188  nitrogen fixation protein NifX  42.4 
 
 
144 aa  113  7e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.141271 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3991  nitrogen fixation protein NifX  40.8 
 
 
163 aa  113  9e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.370272  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2101  nitrogen fixation protein NifX  42.98 
 
 
119 aa  112  1e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0536  putative nitrogenase molybdenum-iron protein NifX  41.6 
 
 
158 aa  112  2e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.697848  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4052  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  42.42 
 
 
133 aa  112  2e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.147779  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6221  nitrogen fixation protein NifX  39.2 
 
 
165 aa  111  4e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.550036  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01480  Nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifX  41.22 
 
 
158 aa  106  9e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3026  nitrogen fixation protein NifX  41.18 
 
 
137 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1058  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  41.6 
 
 
128 aa  103  8e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0460  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  36.25 
 
 
168 aa  103  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0648445 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1193  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  35.88 
 
 
146 aa  96.3  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  decreased coverage  6.88158e-05 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1506  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  35 
 
 
159 aa  90.1  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50910  Nitrogen fixation-related protein, gamma subunit  35.66 
 
 
243 aa  87  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0585445  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0265  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  39.1 
 
 
161 aa  85.9  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3207  nitrogen fixation protein NifX  38.84 
 
 
127 aa  83.2  1e-15  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01420  Nitrogenase iron molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.3 
 
 
242 aa  83.2  1e-15  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1198  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  36.59 
 
 
227 aa  82  3e-15  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.127129  hitchhiker  0.000500892 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1410  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  35.29 
 
 
243 aa  79  2e-14  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0617008 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02570  nitrogen fixation-related protein, vnfY  27.27 
 
 
161 aa  75.1  3e-13  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0717484  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1054  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.43 
 
 
123 aa  73.2  1e-12  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0270  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  30.16 
 
 
247 aa  69.7  1e-11  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0495  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.59 
 
 
220 aa  69.3  2e-11  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1455  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  27.56 
 
 
247 aa  67.8  5e-11  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0499  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.04 
 
 
155 aa  61.6  3e-09  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48700  Metallocluster binding protein of the NafY/NifY/NifX/VnfX family  35.71 
 
 
120 aa  58.9  2e-08  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02740  nitrogenase biosynthetic protein vnfX  26.9 
 
 
182 aa  58.2  4e-08  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1036  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  36.05 
 
 
123 aa  55.1  3e-07  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3646  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  37.93 
 
 
519 aa  52  3e-06  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0204  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  35.96 
 
 
522 aa  48.9  2e-05  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.037885  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5904  nitrogenase FeMo cofactor biosynthesis protein NifB  34.83 
 
 
520 aa  48.9  3e-05  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0396  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  37.65 
 
 
527 aa  47.8  6e-05  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.452553  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0111  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  35.63 
 
 
520 aa  47.4  7e-05  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4244  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  34.95 
 
 
484 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1358  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  33.01 
 
 
479 aa  43.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1529  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  34 
 
 
499 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1245  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  36.47 
 
 
522 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.720089  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3202  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  29.9 
 
 
482 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2599  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  26.27 
 
 
127 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0187403  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7742  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  30.21 
 
 
535 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379245  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1359  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  27.03 
 
 
120 aa  41.2  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3912  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  32.08 
 
 
475 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4472  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  38.16 
 
 
518 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4478  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  31.73 
 
 
527 aa  40  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0277889  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>