284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0090 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1607  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  74.57 
 
 
519 aa  845  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262136  normal  0.703776 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3630  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  84.01 
 
 
519 aa  933  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.154092 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1787  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  61.27 
 
 
511 aa  655  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2118  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  60.12 
 
 
511 aa  651  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0200867 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0090  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  100 
 
 
519 aa  1087  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1520  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit  79.96 
 
 
519 aa  898  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.268449  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2343  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  71.48 
 
 
519 aa  802  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.303723  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0539  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  62.62 
 
 
506 aa  704  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1568  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  67.44 
 
 
511 aa  750  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.511918  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4249  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  60.96 
 
 
512 aa  674  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3994  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  68.21 
 
 
512 aa  758  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5054  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  62.5 
 
 
513 aa  685  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1238  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  79.96 
 
 
519 aa  898  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.028424 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0475  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  79.81 
 
 
520 aa  896  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1075  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  77.46 
 
 
537 aa  882  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.902597  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7755  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  69.94 
 
 
519 aa  793  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1467  nitrogenase, molybdenum-iron protein beta chain(NifK)  71.29 
 
 
519 aa  806  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.261912  hitchhiker  0.00055229 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1432  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  72.25 
 
 
519 aa  821  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.880154 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3536  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  68.21 
 
 
512 aa  763  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0971  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  78.23 
 
 
519 aa  889  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4138  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  59.81 
 
 
512 aa  640  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.453924  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1012  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  62.43 
 
 
510 aa  703  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.245367  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2366  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  61.92 
 
 
511 aa  668  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2190  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  62.62 
 
 
516 aa  704  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0387614  normal  0.12949 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5923  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain, nifK  86.9 
 
 
519 aa  977  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0231  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  82.85 
 
 
519 aa  915  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.819432  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5099  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  79.38 
 
 
519 aa  896  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4932  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  62.5 
 
 
510 aa  679  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1815  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  61.27 
 
 
511 aa  655  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.994927  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3930  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  59.73 
 
 
512 aa  667  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.39743  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6223  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  64.35 
 
 
513 aa  707  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1248  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  62.81 
 
 
506 aa  703  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.836121 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1352  nitrogenase molybdenum-iron protein subunit beta  62.62 
 
 
511 aa  679  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.475929  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4461  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  78.61 
 
 
518 aa  891  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1413  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  56.71 
 
 
522 aa  608  1e-173  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.079976 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6879  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  54.86 
 
 
518 aa  590  1e-167  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.640197  normal  0.320804 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01400  Nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  53.76 
 
 
523 aa  588  1e-167  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4486  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  53.5 
 
 
518 aa  585  1e-166  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0272  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  50.75 
 
 
523 aa  568  1e-161  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.322626  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1200  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  51.24 
 
 
524 aa  558  1e-158  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251423 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0493  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  50.66 
 
 
522 aa  552  1e-156  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2076  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  52.7 
 
 
487 aa  523  1e-147  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0648  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  50.3 
 
 
489 aa  522  1e-147  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2819  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit  50.72 
 
 
489 aa  515  1e-145  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2143  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  52.28 
 
 
487 aa  518  1e-145  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.305963 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2100  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  50.62 
 
 
487 aa  513  1e-144  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0664  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  50.3 
 
 
489 aa  509  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1177  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  52.79 
 
 
487 aa  507  1e-142  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3205  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  49.68 
 
 
489 aa  505  1e-142  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3028  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  49.59 
 
 
489 aa  502  1e-141  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3469  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  50.33 
 
 
487 aa  500  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1051  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  48.11 
 
 
472 aa  472  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1248  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  39.38 
 
 
485 aa  352  7e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.36292  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0681  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  39.65 
 
 
459 aa  350  3e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.746204  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0740  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  39.83 
 
 
459 aa  350  4e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1755  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  39.82 
 
 
460 aa  348  1e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.077468  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1953  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  38.44 
 
 
460 aa  348  2e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.119434  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2617  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  39.29 
 
 
458 aa  345  1e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1532  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  38.48 
 
 
459 aa  343  6e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3094  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  38.31 
 
 
461 aa  342  1e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0838  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  37.45 
 
 
458 aa  340  3e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0167  nitrogenase, subunit beta  37.31 
 
 
456 aa  340  4e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1631  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  38.82 
 
 
460 aa  339  8e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  8.77058e-05  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1154  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit  38.84 
 
 
461 aa  338  1e-91  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.813541  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2817  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  38.51 
 
 
463 aa  337  4e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1027  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  37.5 
 
 
461 aa  336  5e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.975928  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0557  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  37.98 
 
 
455 aa  333  5e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0151336  normal  0.228475 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1015  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  37.78 
 
 
458 aa  331  2e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.502201  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0061  nitrogenase  38.6 
 
 
462 aa  316  7e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1146  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  35.28 
 
 
455 aa  313  4e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.101192  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0147  nitrogenase  38.08 
 
 
490 aa  311  2e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0059  nitrogenase  36.61 
 
 
458 aa  307  3e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.148206  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0662  nitrogenase  36.53 
 
 
462 aa  307  3e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.341539  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1799  nitrogenase  36.53 
 
 
462 aa  306  5e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0102  nitrogenase  36.3 
 
 
462 aa  306  6e-82  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0981911  normal  0.153494 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0104  nitrogenase  37.36 
 
 
458 aa  305  1e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.294919  normal  0.143181 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1797  nitrogenase  37.36 
 
 
458 aa  303  4e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.561613  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0664  nitrogenase  36.91 
 
 
458 aa  301  1e-80  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.683559  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1430  nitrogenase  38.27 
 
 
472 aa  299  1e-79  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1198  nitrogenase  34.13 
 
 
475 aa  282  8e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.403437  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0165  nitrogenase associated protein N  34.13 
 
 
477 aa  274  3e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4040  nitrogenase  33.05 
 
 
475 aa  265  1e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.342277  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48970  Fe-only nitrogenase, beta subunit  34.51 
 
 
462 aa  253  5e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12057  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02590  vanadium nitrogenase beta subunit, vnfK  35.21 
 
 
475 aa  251  3e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.607029  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2276  nitrogenase, subunit beta  34.59 
 
 
461 aa  246  5e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.665587  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1551  nitrogenase, subunit K  34.32 
 
 
462 aa  239  7e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1757  Nitrogenase  33.69 
 
 
457 aa  238  3e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0799606  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1392  nitrogenase  34.01 
 
 
462 aa  233  4e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.392625  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1152  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit, putative  32.65 
 
 
451 aa  233  7e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.680246  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2613  Fe-only nitrogenase, beta subunit  32.05 
 
 
462 aa  228  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2815  nitrogenase  32.89 
 
 
479 aa  229  1e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4027  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  33.79 
 
 
463 aa  228  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.762261 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1633  Nitrogenase  34.21 
 
 
456 aa  226  1e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  3.22358e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4681  nitrogenase  33.33 
 
 
462 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1620  Fe-only nitrogenase, beta subunit  33.18 
 
 
461 aa  223  5e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.855819  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1029  Nitrogenase  30.6 
 
 
466 aa  223  7e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0555  Nitrogenase  30.18 
 
 
456 aa  221  2e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.376218 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1250  nitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein NifN, putative  32.67 
 
 
452 aa  221  3e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.113259  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0679  Nitrogenase  33.04 
 
 
451 aa  219  1e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0432483  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1534  nitrogenase  32.28 
 
 
450 aa  217  3e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.898228  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>