More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0088 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0088  nitrogenase reductase  100 
 
 
303 aa  623  1e-177  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.55556  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0143  nitrogenase reductase  100 
 
 
293 aa  603  1e-171  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5925  nitrogenase reductase  93.52 
 
 
295 aa  571  1e-162  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.780912  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5879  nitrogenase reductase  93.17 
 
 
295 aa  570  1e-162  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0809019  normal  0.897591 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3632  nitrogenase reductase  92.15 
 
 
293 aa  560  1e-159  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.664822 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0229  nitrogenase reductase  92.15 
 
 
293 aa  561  1e-159  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0473  nitrogenase reductase  91.38 
 
 
290 aa  553  1e-156  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.686958  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1465  nitrogenase reductase  90.44 
 
 
293 aa  552  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.375574  hitchhiker  0.00132251 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1430  nitrogenase reductase  89.08 
 
 
293 aa  548  1e-155  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7808  nitrogenase reductase  88.4 
 
 
293 aa  537  1e-152  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.220892  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7753  nitrogenase reductase  88.74 
 
 
293 aa  539  1e-152  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73881  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1240  nitrogenase reductase  88.62 
 
 
296 aa  537  1e-152  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.118183 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1522  nitrogenase reductase  88.62 
 
 
296 aa  537  1e-152  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2345  nitrogenase reductase  87.76 
 
 
296 aa  525  1e-148  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.383855  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1570  nitrogenase reductase  84.12 
 
 
298 aa  494  1e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3534  nitrogenase reductase  85.2 
 
 
299 aa  494  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.332377  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3996  nitrogenase reductase  84.48 
 
 
299 aa  493  1e-138  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5101  nitrogenase reductase  82.86 
 
 
298 aa  493  1e-138  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0969  nitrogenase reductase  83.75 
 
 
299 aa  493  1e-138  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1073  nitrogenase reductase  83.75 
 
 
299 aa  493  1e-138  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4463  nitrogenase reductase  83.39 
 
 
300 aa  490  1e-138  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6225  nitrogenase reductase  80 
 
 
297 aa  490  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.572672  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5052  nitrogenase reductase  80.58 
 
 
295 aa  481  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1010  nitrogenase reductase  80.5 
 
 
295 aa  483  1e-135  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4930  nitrogenase reductase  80.58 
 
 
295 aa  478  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1246  nitrogenase reductase  81.21 
 
 
312 aa  470  1e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.944984  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0541  nitrogenase reductase  82.01 
 
 
291 aa  464  1e-130  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.72124  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2192  nitrogenase reductase  82.01 
 
 
291 aa  464  1e-130  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.866269  normal  0.548044 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0491  nitrogenase iron protein  74.32 
 
 
293 aa  448  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01380  Nitrogenase iron protein  75.17 
 
 
290 aa  447  1e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4054  nitrogenase iron protein subunit NifH  73.1 
 
 
324 aa  445  1e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00458685  normal  0.287563 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3916  nitrogenase reductase  74.14 
 
 
295 aa  446  1e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3855  nitrogenase iron protein  75.27 
 
 
326 aa  444  1e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.430007  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1354  nitrogenase iron protein  72.85 
 
 
296 aa  441  1e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3467  nitrogenase iron protein  72.16 
 
 
288 aa  437  1e-122  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0274  nitrogenase iron protein  71.88 
 
 
291 aa  439  1e-122  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.23577  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4247  nitrogenase iron protein subunit NifH  72.79 
 
 
296 aa  437  1e-122  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.252394  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1202  nitrogenase iron protein subunit NifH  73.33 
 
 
296 aa  439  1e-122  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.451718  hitchhiker  0.00669218 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4488  nitrogenase iron protein subunit NifH  72.38 
 
 
287 aa  437  1e-121  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2098  nitrogenase iron protein  72.89 
 
 
292 aa  435  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2364  nitrogenase iron protein  76.79 
 
 
298 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6881  nitrogenase iron protein  70.18 
 
 
289 aa  429  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82086  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3030  nitrogenase iron protein  72.08 
 
 
288 aa  430  1e-119  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3771  nitrogenase iron protein  72.66 
 
 
299 aa  425  1e-118  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0377842  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4478  nitrogenase reductase  74.91 
 
 
297 aa  423  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2074  nitrogenase iron protein  74.91 
 
 
289 aa  418  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2821  nitrogenase iron protein  72.85 
 
 
289 aa  418  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1175  nitrogenase iron protein  73.87 
 
 
289 aa  419  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2145  nitrogenase iron protein  74.91 
 
 
289 aa  419  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.936237 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1415  nitrogenase iron protein subunit NifH  73.61 
 
 
296 aa  420  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.210537 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02660  vanadium nitrogenase iron protein  72.66 
 
 
290 aa  416  1e-115  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2120  nitrogenase iron protein  70.5 
 
 
299 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.109902 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0650  nitrogenase iron protein  73.33 
 
 
288 aa  414  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1049  nitrogenase iron protein  72.73 
 
 
275 aa  412  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0662  nitrogenase iron protein subunit NifH  73.5 
 
 
289 aa  412  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.24324  normal  0.221237 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1218  nitrogenase iron protein  73.5 
 
 
288 aa  409  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3203  nitrogenase iron protein  71.43 
 
 
288 aa  408  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1813  nitrogenase iron protein  70.5 
 
 
296 aa  400  1e-110  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1785  nitrogenase iron protein  70.5 
 
 
296 aa  400  1e-110  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4136  nitrogenase iron protein subunit NifH  72.87 
 
 
296 aa  397  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0109879  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2821  nitrogenase iron protein  66.06 
 
 
272 aa  377  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.436411  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0834  nitrogenase reductase  64.16 
 
 
276 aa  371  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0561  nitrogenase iron protein  63.77 
 
 
276 aa  372  1e-102  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  3.68653e-05  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1023  nitrogenase iron protein  62.59 
 
 
275 aa  371  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1573  nitrogenase iron protein subunit NifH  62.72 
 
 
284 aa  368  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3090  nitrogenase reductase  63.8 
 
 
277 aa  367  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2613  nitrogenase reductase  63.44 
 
 
276 aa  366  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1142  nitrogenase iron protein  62.32 
 
 
276 aa  364  1e-99  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.442855  normal  0.809863 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1019  nitrogenase reductase  63.27 
 
 
274 aa  364  1e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855562  normal  0.490785 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1627  nitrogenase reductase  66.15 
 
 
274 aa  357  2e-97  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000481616  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1158  nitrogenase reductase  60.87 
 
 
274 aa  353  3e-96  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1751  nitrogenase reductase  65 
 
 
274 aa  353  3e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.555016  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2281  nitrogenase reductase  62.77 
 
 
275 aa  350  2e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000562599  normal  0.173141 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49000  nitrogenase reductase  61.17 
 
 
275 aa  348  8e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0171  nitrogenase reductase  62.04 
 
 
273 aa  347  2e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.217628  normal  0.670038 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1623  nitrogenase reductase  60.22 
 
 
275 aa  344  1e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1949  nitrogenase reductase  65 
 
 
274 aa  342  5e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00645764  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2610  nitrogenase reductase  59.49 
 
 
275 aa  340  1e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.343866  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1395  nitrogenase reductase  60.58 
 
 
275 aa  340  2e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0685  nitrogenase reductase  65 
 
 
274 aa  340  2e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1528  nitrogenase reductase  64.62 
 
 
274 aa  339  4e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4684  nitrogenase reductase  60.22 
 
 
275 aa  339  4e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0143  nitrogenase iron protein  60.95 
 
 
280 aa  339  4e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.343179  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1244  nitrogenase reductase  63.85 
 
 
274 aa  338  6e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  2.40583e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0744  nitrogenase reductase  64.62 
 
 
274 aa  338  6e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0098  nitrogenase reductase  58.91 
 
 
275 aa  338  9e-92  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.380897  normal  0.0345089 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0065  nitrogenase reductase  58.55 
 
 
275 aa  336  3e-91  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4043  nitrogenase iron protein  59.85 
 
 
273 aa  334  1e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0162942 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1201  nitrogenase iron protein  59.85 
 
 
273 aa  333  2e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0658  nitrogenase reductase  57.45 
 
 
275 aa  332  3e-90  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0493156  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1803  nitrogenase reductase  57.45 
 
 
275 aa  332  4e-90  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.736404  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1434  nitrogenase iron protein  58.76 
 
 
283 aa  331  8e-90  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4046  nitrogenase iron protein  56.16 
 
 
275 aa  317  2e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.316801  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0237  Nitrogenase  52.21 
 
 
272 aa  286  4e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.848648  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2083  nitrogenase  50.75 
 
 
270 aa  278  1e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1616  NifH/frxC-family protein  48.91 
 
 
276 aa  276  4e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0793  nitrogenase  49.63 
 
 
280 aa  270  2e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00476725  normal  0.0446468 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1937  nitrogenase  51.84 
 
 
272 aa  268  6e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.894359  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0165  nitrogenase iron protein subunit NifH  50 
 
 
268 aa  261  1e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1224  nitrogenase reductase-like protein  47.76 
 
 
278 aa  258  8e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>