More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0087 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_2325  SufS subfamily cysteine desulfurase  77.62 
 
 
414 aa  671  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.553712  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2837  SufS subfamily cysteine desulfurase  77.37 
 
 
415 aa  670  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00234776  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2745  cysteine desulfurase, SufS subfamily  77.24 
 
 
415 aa  669  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0087  SufS subfamily cysteine desulfurase  100 
 
 
420 aa  862  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5928  cysteine desulfurase  77.13 
 
 
413 aa  670  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3969  cysteine desulfurase  77.48 
 
 
415 aa  674  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0413583  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2459  SufS subfamily cysteine desulfurase  78.1 
 
 
415 aa  671  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.117109  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2990  SufS subfamily cysteine desulfurase  77.86 
 
 
428 aa  669  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398941  normal  0.104458 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1661  cysteine desulphurases, SufS  77.13 
 
 
414 aa  671  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278494  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0101  SufS subfamily cysteine desulfurase  68.32 
 
 
414 aa  585  1e-166  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.724967 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  67.33 
 
 
413 aa  582  1e-165  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3980  SufS subfamily cysteine desulfurase  66.83 
 
 
418 aa  584  1e-165  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.970806 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4348  cysteine desulfurase, SufS subfamily  66.83 
 
 
418 aa  584  1e-165  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  67.48 
 
 
413 aa  583  1e-165  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4466  SufS subfamily cysteine desulfurase  68.61 
 
 
419 aa  579  1e-164  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.523936 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5106  SufS subfamily cysteine desulfurase  66.83 
 
 
413 aa  579  1e-164  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  67.16 
 
 
414 aa  581  1e-164  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  67.25 
 
 
413 aa  569  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2103  cysteine desulfurase, SufS subfamily  67.49 
 
 
413 aa  570  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.105912 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  66.5 
 
 
416 aa  565  1e-160  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4460  cysteine desulfurase, SufS subfamily  66 
 
 
426 aa  566  1e-160  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.572328  normal  0.26876 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1465  SufS subfamily cysteine desulfurase  64.27 
 
 
413 aa  563  1e-159  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204095  normal  0.0534707 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  66.09 
 
 
414 aa  562  1e-159  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  65.93 
 
 
414 aa  560  1e-158  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  65.43 
 
 
414 aa  557  1e-157  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  62.77 
 
 
414 aa  553  1e-156  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1249  cysteine desulfurase  59.51 
 
 
406 aa  500  1e-140  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.491768  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  56.3 
 
 
414 aa  497  1e-139  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0431  putative selenocysteine lyase  59.75 
 
 
406 aa  494  1e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2356  SufS subfamily cysteine desulfurase  59.26 
 
 
406 aa  493  1e-138  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2088  SufS subfamily cysteine desulfurase  59.75 
 
 
406 aa  494  1e-138  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.519115 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  58.62 
 
 
408 aa  489  1e-137  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2355  SufS subfamily cysteine desulfurase  59.01 
 
 
407 aa  482  1e-135  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.331891  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1623  cysteine desulfurase  58.02 
 
 
406 aa  475  1e-133  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0344832 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  55.8 
 
 
414 aa  475  1e-133  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  56.97 
 
 
451 aa  473  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  53.06 
 
 
420 aa  473  1e-132  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3970  SufS subfamily cysteine desulfurase  56.44 
 
 
403 aa  467  1e-130  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.615432  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.61 
 
 
408 aa  465  1e-130  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1319  SufS subfamily cysteine desulfurase  56.03 
 
 
413 aa  464  1e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0340803  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2570  cysteine desulfurase  54.28 
 
 
422 aa  464  1e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  51.97 
 
 
419 aa  459  1e-128  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.73 
 
 
412 aa  452  1e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  3.85676e-08  unclonable  1.52095e-15 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  53.58 
 
 
418 aa  454  1e-126  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.76 
 
 
404 aa  451  1e-126  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  52.12 
 
 
405 aa  451  1e-126  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.42 
 
 
429 aa  449  1e-125  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1863  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.7 
 
 
416 aa  450  1e-125  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  52.12 
 
 
405 aa  451  1e-125  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2269  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.07 
 
 
414 aa  448  1e-124  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216373  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0699  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.59 
 
 
419 aa  444  1e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  53.98 
 
 
427 aa  439  1e-122  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1549  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.81 
 
 
673 aa  436  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0186902 
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  51.51 
 
 
404 aa  435  1e-121  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.37 
 
 
419 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2493  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.63 
 
 
605 aa  435  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.62 
 
 
419 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.12 
 
 
657 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3637  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.71 
 
 
678 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51832  normal  0.140258 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3312  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.7 
 
 
415 aa  432  1e-120  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0757647 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1698  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.35 
 
 
417 aa  434  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.74 
 
 
416 aa  432  1e-120  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  49.39 
 
 
425 aa  432  1e-120  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52 
 
 
406 aa  432  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2748  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  50.99 
 
 
407 aa  429  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488866  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.01 
 
 
404 aa  431  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0728  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.86 
 
 
421 aa  429  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.88575  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1427  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.72 
 
 
664 aa  429  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  7.69952e-06 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2446  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  50.74 
 
 
407 aa  426  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854402  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51 
 
 
406 aa  426  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.24 
 
 
672 aa  425  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0228689 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1338  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.24 
 
 
674 aa  425  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.986463 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  49 
 
 
404 aa  426  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0023  putative cysteine desulfurase  51.49 
 
 
661 aa  427  1e-118  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.493291 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0997  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.36 
 
 
418 aa  426  1e-118  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537591  normal  0.129667 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0124  cysteine desulphurases, SufS  49.26 
 
 
688 aa  422  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1552  cysteine desulphurases, SufS  49.39 
 
 
682 aa  422  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.39 
 
 
429 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1236  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.22 
 
 
413 aa  424  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0906  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.11 
 
 
425 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.601083 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16690  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  50.12 
 
 
604 aa  422  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.88 
 
 
429 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.75 
 
 
406 aa  423  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.63 
 
 
420 aa  425  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0488  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.99 
 
 
774 aa  422  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21000  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  50.12 
 
 
604 aa  421  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.32 
 
 
415 aa  424  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0617  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.25 
 
 
621 aa  421  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000358817  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.39 
 
 
429 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  49.87 
 
 
420 aa  421  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0199  putative cysteine desulfurase  53.69 
 
 
660 aa  420  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.75031  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1818  SufS family cysteine desulfurase  53.44 
 
 
660 aa  420  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.295345  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.46 
 
 
414 aa  421  1e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0933  putative cysteine desulfurase  53.69 
 
 
671 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0754  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.12 
 
 
608 aa  419  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1407  putative cysteine desulfurase  53.69 
 
 
660 aa  420  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0362  selenocysteine lyase  53.44 
 
 
685 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.556152  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  50.5 
 
 
406 aa  419  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3517  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.75 
 
 
650 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  50.5 
 
 
406 aa  419  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>