81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0080 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2271  transposase IS4 family protein  100 
 
 
451 aa  926  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.618073  normal  0.163793 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4878  transposase IS4 family protein  100 
 
 
451 aa  926  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.889581  normal  0.178611 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3254  transposase IS4 family protein  100 
 
 
451 aa  926  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.769506  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2000  transposase IS4 family protein  100 
 
 
451 aa  926  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0677  transposase IS4 family protein  92.46 
 
 
451 aa  834  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0416857  normal  0.365763 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0080  transposase IS4 family protein  100 
 
 
451 aa  926  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.627325  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3758  transposase, IS4 family protein  36.32 
 
 
397 aa  181  3e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.233858  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2354  transposase, IS4 family protein  36.32 
 
 
397 aa  181  3e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.198666  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2028  transposase, IS4 family protein  36.32 
 
 
397 aa  181  3e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0133  transposase, IS4 family protein  36.32 
 
 
397 aa  181  3e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0302843  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3756  transposase, IS4 family protein  36.05 
 
 
397 aa  180  4e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5331  IS4 family transposase  31.16 
 
 
441 aa  156  6e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.385872 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2153  transposase IS4 family protein  28.15 
 
 
468 aa  148  2e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2110  transposase IS4 family protein  28.15 
 
 
468 aa  148  2e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0566508 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1579  transposase IS4 family protein  28.15 
 
 
468 aa  148  2e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1453  transposase IS4 family protein  28.15 
 
 
468 aa  148  2e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.243782  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1258  transposase IS4 family protein  28.15 
 
 
468 aa  148  2e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  9.86472e-06 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0956  transposase IS4 family protein  28.15 
 
 
468 aa  148  2e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0821634  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2157  transposase IS4 family protein  28.15 
 
 
468 aa  148  2e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.360609  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2437  transposase IS4 family protein  28.15 
 
 
468 aa  148  2e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1019  transposase IS4 family protein  28.15 
 
 
468 aa  148  2e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.865831  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0019  transposase, IS4 family protein  27.48 
 
 
468 aa  145  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.148263  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0269  transposase, IS4 family protein  27.48 
 
 
468 aa  145  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0352  transposase, IS4 family protein  27.48 
 
 
468 aa  145  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0262  transposase, IS4 family protein  27.48 
 
 
468 aa  145  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0017  transposase, IS4 family protein  27.48 
 
 
468 aa  145  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0435  transposase, IS4 family protein  29.03 
 
 
433 aa  143  5e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.967999  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4092  transposase, IS4 family protein  29.03 
 
 
433 aa  143  5e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.819916  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0632  transposase, IS4 family protein  29.03 
 
 
433 aa  143  5e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0163  transposase, IS4 family protein  29.03 
 
 
433 aa  143  5e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0603  transposase IS4 family protein  29.77 
 
 
420 aa  139  7e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4308  transposase, IS4  29.16 
 
 
447 aa  137  5e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.661082  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2227  transposase, IS4 family protein  29.55 
 
 
448 aa  135  1e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3502  transposase, IS4 family protein  29.55 
 
 
448 aa  135  1e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0636  transposase IS4 family protein  31.03 
 
 
435 aa  134  4e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0983  transposase, IS4 family protein  28.01 
 
 
433 aa  134  4e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1626  transposase, IS4  28.02 
 
 
447 aa  133  6e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.982067  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2424  transposase, IS4  28.02 
 
 
447 aa  133  6e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2431  transposase IS1380 family protein  24.73 
 
 
494 aa  131  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1082  transposase IS4 family protein  27.49 
 
 
456 aa  117  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  1.05958e-05  normal  0.448539 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0088  transposase InsC3 for insertion sequence ISEc9  24.11 
 
 
420 aa  116  1e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0568317 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3975  transposase IS4 family protein  26.54 
 
 
447 aa  113  7e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.35264 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3978  transposase IS4 family protein  26.54 
 
 
447 aa  113  7e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.846338 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3757  transposase IS4 family protein  26.54 
 
 
447 aa  113  7e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00995603  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3973  transposase IS4 family protein  26.54 
 
 
447 aa  113  7e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.667634 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4167  transposase IS4 family protein  26.54 
 
 
447 aa  113  7e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4233  transposase IS4 family protein  26.54 
 
 
447 aa  113  7e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4247  transposase IS4 family protein  26.54 
 
 
447 aa  113  7e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.861289  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4643  transposase IS4 family protein  26.54 
 
 
447 aa  113  7e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4251  transposase IS4 family protein  26.54 
 
 
447 aa  113  7e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3754  transposase IS4 family protein  26.54 
 
 
447 aa  113  7e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.3144  normal  0.951777 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3737  transposase IS4 family protein  26.54 
 
 
447 aa  113  7e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3026  transposase IS4 family protein  26.54 
 
 
447 aa  113  7e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.00816022  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2473  transposase IS4 family protein  26.54 
 
 
447 aa  113  7e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0307213  normal  0.0396002 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0102  transposase IS4 family protein  26.54 
 
 
447 aa  113  7e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.849001 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3687  transposase IS4 family protein  26.54 
 
 
447 aa  113  7e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6188  transposase  32.61 
 
 
255 aa  93.2  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0097  transposase, IS4 family protein  28.51 
 
 
325 aa  74.7  3e-12  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1627  transposase, IS4  37.5 
 
 
111 aa  65.5  2e-09  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3389  hypothetical protein  36.99 
 
 
198 aa  63.5  7e-09  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.699751  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2484  hypothetical protein  38.89 
 
 
162 aa  60.5  7e-08  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0142982  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1632  transposase, IS4  29.15 
 
 
263 aa  59.3  1e-07  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0086  transposase (24)  30.71 
 
 
167 aa  55.1  2e-06  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1368  transposase, IS4 family protein  23.61 
 
 
451 aa  55.1  2e-06  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1144  transposase IS4 family protein  19.91 
 
 
472 aa  54.7  3e-06  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.17697  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4189  hypothetical protein  30 
 
 
182 aa  52.4  2e-05  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.524375 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1020  transposase IS4 family protein  19.67 
 
 
472 aa  52.4  2e-05  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.267624  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1221  transposase IS4 family protein  19.95 
 
 
472 aa  51.6  3e-05  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00383855 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7794  transposase IS4 family protein  24.42 
 
 
241 aa  51.2  4e-05  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1413  transposase IS4 family protein  19.72 
 
 
472 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1197  transposase IS4 family protein  19.63 
 
 
472 aa  49.3  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0181  transposase, IS4 family protein  30.69 
 
 
467 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3238  transposase, IS4 family protein  30.69 
 
 
467 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1405  transposase, IS4 family protein  30.69 
 
 
467 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1033  transposase, IS4 family protein  30.69 
 
 
467 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0784  transposase, IS4 family protein  30.69 
 
 
411 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0625  transposase, IS4 family protein  30.69 
 
 
467 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  5.61511e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0311  transposase, IS4 family protein  30.69 
 
 
469 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2628  transposase, IS4 family protein  30.69 
 
 
467 aa  45.1  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1324  hypothetical protein  28.44 
 
 
190 aa  43.5  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3133  transposase, IS4 family protein  29.7 
 
 
467 aa  43.1  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>