More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0070 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2035  dihydroxy-acid dehydratase  75.81 
 
 
620 aa  939  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.871737  hitchhiker  2.66357e-08 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5178  dihydroxy-acid dehydratase  74.23 
 
 
613 aa  952  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2675  dihydroxy-acid dehydratase  84.5 
 
 
611 aa  1022  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.272323 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0485  dihydroxy-acid dehydratase  71.71 
 
 
616 aa  903  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.543148 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4452  dihydroxy-acid dehydratase  75.72 
 
 
619 aa  947  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.941603 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2756  dihydroxy-acid dehydratase  74.12 
 
 
646 aa  933  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4126  dihydroxy-acid dehydratase  71.31 
 
 
624 aa  905  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1121  dihydroxy-acid dehydratase  68.78 
 
 
615 aa  847  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.836437  hitchhiker  0.000632283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7305  dihydroxy-acid dehydratase  68.94 
 
 
617 aa  812  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.150096 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0348  dihydroxy-acid dehydratase  71.54 
 
 
615 aa  906  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4757  dihydroxy-acid dehydratase  71.54 
 
 
616 aa  907  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0890902  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4057  dihydroxy-acid dehydratase  71.71 
 
 
616 aa  903  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4231  dihydroxy-acid dehydratase  73.33 
 
 
616 aa  936  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.604372  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4137  dihydroxy-acid dehydratase  73.33 
 
 
616 aa  937  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.129603  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4149  dihydroxy-acid dehydratase  73.33 
 
 
616 aa  937  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5037  dihydroxy-acid dehydratase  75.08 
 
 
619 aa  940  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.458835  normal  0.533366 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2717  dihydroxy-acid dehydratase  79.42 
 
 
617 aa  1016  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.52758  normal  0.12218 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0066  dihydroxy-acid dehydratase  71.1 
 
 
610 aa  910  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4027  dihydroxy-acid dehydratase  75.4 
 
 
619 aa  944  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.905067  normal  0.428088 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3384  dihydroxy-acid dehydratase  75.24 
 
 
619 aa  943  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.137798 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0079  dihydroxy-acid dehydratase  70.78 
 
 
610 aa  909  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0445  dihydroxy-acid dehydratase  72.24 
 
 
616 aa  909  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2848  dihydroxy-acid dehydratase  83.52 
 
 
609 aa  1012  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.36735  normal  0.73575 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0336  dihydroxy-acid dehydratase  74.23 
 
 
613 aa  951  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4162  dihydroxy-acid dehydratase  72.24 
 
 
616 aa  906  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4282  dihydroxy-acid dehydratase  73.33 
 
 
616 aa  937  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3988  dihydroxy-acid dehydratase  73.33 
 
 
616 aa  936  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0097  dihydroxy-acid dehydratase  81.57 
 
 
613 aa  991  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5433  dihydroxyacid dehydratase  84.51 
 
 
613 aa  1041  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.535881  normal  0.212385 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1046  dihydroxy-acid dehydratase  79.42 
 
 
617 aa  1003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.641708  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2491  dihydroxy-acid dehydratase  72.85 
 
 
613 aa  924  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4205  dihydroxy-acid dehydratase  75.81 
 
 
612 aa  947  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3612  dihydroxy-acid dehydratase  71.89 
 
 
619 aa  910  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4012  dihydroxy-acid dehydratase  72.36 
 
 
616 aa  934  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0176086 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3925  dihydroxy-acid dehydratase  77.45 
 
 
612 aa  961  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1231  dihydroxy-acid dehydratase  67.8 
 
 
638 aa  842  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00143562  normal  0.953695 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5171  dihydroxy-acid dehydratase  65.43 
 
 
613 aa  776  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.72822  normal  0.406258 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3037  dihydroxy-acid dehydratase  73.14 
 
 
618 aa  931  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4656  dihydroxy-acid dehydratase  79.02 
 
 
617 aa  1003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.972576 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5002  dihydroxy-acid dehydratase  74.23 
 
 
613 aa  953  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.138711  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00413  dihydroxy-acid dehydratase  73.09 
 
 
599 aa  904  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0070  dihydroxy-acid dehydratase  100 
 
 
617 aa  1258  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0157  dihydroxy-acid dehydratase  71.87 
 
 
616 aa  905  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0112  dihydroxy-acid dehydratase  81.73 
 
 
611 aa  1009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4007  dihydroxy-acid dehydratase  71.31 
 
 
624 aa  906  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1909  dihydroxy-acid dehydratase  67.85 
 
 
619 aa  819  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103829  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0446  dihydroxy-acid dehydratase  75.65 
 
 
612 aa  958  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3737  dihydroxy-acid dehydratase  73.21 
 
 
614 aa  919  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  6.04474e-06 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2723  dihydroxy-acid dehydratase  80.59 
 
 
612 aa  1023  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1382  dihydroxy-acid dehydratase  74.45 
 
 
634 aa  962  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.469767  hitchhiker  3.62711e-05 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0292  dihydroxy-acid dehydratase  72.4 
 
 
616 aa  920  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2694  dihydroxy-acid dehydratase  75.88 
 
 
619 aa  954  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2538  dihydroxy-acid dehydratase  67.8 
 
 
612 aa  854  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1936  dihydroxy-acid dehydratase  66.67 
 
 
630 aa  809  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18850  dihydroxyacid dehydratase  65.96 
 
 
610 aa  818  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0332663  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08850  dihydroxy-acid dehydratase  66.12 
 
 
614 aa  814  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1268  dihydroxy-acid dehydratase  68.39 
 
 
617 aa  836  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.044318  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6024  dihydroxy-acid dehydratase  66.94 
 
 
614 aa  828  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4029  dihydroxy-acid dehydratase  71.71 
 
 
616 aa  914  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.451048  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0141  dihydroxy-acid dehydratase  72.2 
 
 
616 aa  918  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03598  hypothetical protein  73.33 
 
 
616 aa  936  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  4.82952e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3773  dihydroxy-acid dehydratase  73.01 
 
 
616 aa  924  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125005  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2305  dihydroxy-acid dehydratase  75.88 
 
 
619 aa  954  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.270143  hitchhiker  3.64232e-08 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4268  dihydroxy-acid dehydratase  65.16 
 
 
616 aa  778  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0784946  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4218  dihydroxy-acid dehydratase  72.36 
 
 
616 aa  914  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1151  dihydroxy-acid dehydratase  75.65 
 
 
623 aa  976  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2866  dihydroxy-acid dehydratase  65.85 
 
 
613 aa  815  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1130  dihydroxy-acid dehydratase  68.51 
 
 
620 aa  833  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000175823 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4359  dihydroxy-acid dehydratase  66.99 
 
 
614 aa  839  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0445663  normal  0.0917232 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2292  dihydroxy-acid dehydratase  78.61 
 
 
615 aa  1001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.809008  normal  0.0178596 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0419  dihydroxy-acid dehydratase  66.83 
 
 
632 aa  826  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.176558 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7332  Dihydroxy-acid dehydratase  69.26 
 
 
612 aa  865  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2390  dihydroxy-acid dehydratase  68.51 
 
 
620 aa  834  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1344  dihydroxy-acid dehydratase  67.26 
 
 
618 aa  827  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0122991  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002038  dihydroxy-acid dehydratase  73.38 
 
 
613 aa  932  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3232  dihydroxy-acid dehydratase  64.45 
 
 
614 aa  768  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1459  dihydroxy-acid dehydratase  79.48 
 
 
612 aa  1019  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.141377 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1404  dihydroxy-acid dehydratase  67.86 
 
 
619 aa  815  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03310  Dihydroxy-acid dehydratase  73.54 
 
 
612 aa  927  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4294  dihydroxy-acid dehydratase  72.03 
 
 
616 aa  929  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4129  dihydroxy-acid dehydratase  72.2 
 
 
616 aa  930  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04017  dihydroxy-acid dehydratase  72.37 
 
 
579 aa  843  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0675998  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4114  dihydroxy-acid dehydratase  72.2 
 
 
616 aa  929  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4235  dihydroxy-acid dehydratase  72.36 
 
 
616 aa  931  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.866608  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4186  dihydroxy-acid dehydratase  72.2 
 
 
616 aa  931  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3851  dihydroxy-acid dehydratase  73.05 
 
 
612 aa  913  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1648  dihydroxy-acid dehydratase  81.92 
 
 
618 aa  1040  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1965  dihydroxy-acid dehydratase  56.48 
 
 
589 aa  678  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2797  dihydroxy-acid dehydratase  84.5 
 
 
611 aa  1036  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.830059  normal  0.958543 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5205  dihydroxy-acid dehydratase  73.01 
 
 
616 aa  936  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2715  dihydroxy-acid dehydratase  75.89 
 
 
617 aa  959  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.794  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1361  dihydroxy-acid dehydratase  78.99 
 
 
612 aa  1014  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0137226  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0988  dihydroxy-acid dehydratase  76.05 
 
 
618 aa  952  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2414  dihydroxy-acid dehydratase  79.45 
 
 
611 aa  1009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0395754  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0578  dihydroxy-acid dehydratase  77.76 
 
 
635 aa  1014  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.104527  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1829  dihydroxy-acid dehydratase  82.54 
 
 
609 aa  1014  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184703  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3368  dihydroxy-acid dehydratase  64.47 
 
 
619 aa  789  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3418  dihydroxy-acid dehydratase  66.08 
 
 
620 aa  822  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2902  dihydroxy-acid dehydratase  84.34 
 
 
611 aa  1038  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.25896 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3234  dihydroxy-acid dehydratase  83.41 
 
 
616 aa  1047  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00391519 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>