250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0068 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0068  3'-5' exonuclease  100 
 
 
206 aa  422  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0047  3'-5' exonuclease  76.21 
 
 
204 aa  321  5e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0174  3'-5' exonuclease  74.27 
 
 
204 aa  316  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0419  3'-5' exonuclease  74.76 
 
 
204 aa  314  5e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0659  3'-5' exonuclease  75.24 
 
 
204 aa  314  6e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.265112 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0125  putative 3'-5' exonuclease family protein  75.24 
 
 
204 aa  313  1e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00602859  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0179  3'-5' exonuclease  72.12 
 
 
206 aa  309  2e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00803697  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0171  3'-5' exonuclease  69.71 
 
 
206 aa  296  1e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5125  3'-5' exonuclease  69.27 
 
 
207 aa  294  5e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0268839  normal  0.933758 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0155  3'-5' exonuclease  70.73 
 
 
204 aa  292  3e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.299764 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2609  3'-5' exonuclease  70.87 
 
 
204 aa  291  5e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5275  3'-5' exonuclease  67.48 
 
 
204 aa  290  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28449  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0196  3'-5' exonuclease  67.32 
 
 
203 aa  285  3e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.950897 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0572  3'-5' exonuclease  68.45 
 
 
204 aa  285  4e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5922  3'-5' exonuclease  66.18 
 
 
204 aa  283  1e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2425  3'-5' exonuclease  67.16 
 
 
209 aa  283  1e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0120  3'-5' exonuclease family protein  66.67 
 
 
205 aa  280  8e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0117  3'-5' exonuclease family protein  66.18 
 
 
205 aa  279  3e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0228  3'-5' exonuclease  65.85 
 
 
203 aa  277  7e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2497  3'-5' exonuclease  65.69 
 
 
209 aa  276  2e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.325432  normal  0.308179 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1152  ribonuclease D  67.48 
 
 
204 aa  275  5e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2813  3'-5' exonuclease  66.99 
 
 
204 aa  272  2e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0135  3'-5' exonuclease  64.73 
 
 
205 aa  272  3e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3589  3'-5' exonuclease  66.34 
 
 
203 aa  270  8e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2720  3'-5' exonuclease  64.71 
 
 
209 aa  270  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.149721  normal  0.0609935 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2775  3'-5' exonuclease  66.99 
 
 
204 aa  269  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1219  3'-5' exonuclease domain-containing protein  64.73 
 
 
206 aa  262  2e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  4.85799e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0027  3'-5' exonuclease  62.62 
 
 
204 aa  263  2e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.189554  normal  0.37885 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3464  3'-5' exonuclease  65.22 
 
 
208 aa  262  3e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1669  3'-5' exonuclease  63.29 
 
 
218 aa  260  1e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.335885  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0109  3'-5' exonuclease  62.62 
 
 
204 aa  260  1e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.378562  normal  0.35649 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4028  3'-5' exonuclease  64.73 
 
 
208 aa  259  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0333  3'-5' exonuclease  64.22 
 
 
210 aa  259  2e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.273167  normal  0.287022 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2903  3'-5' exonuclease  63.41 
 
 
205 aa  259  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.865613  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2343  3'-5' exonuclease  62.62 
 
 
205 aa  257  7e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.151538 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0120  ribonuclease D  63.29 
 
 
208 aa  255  3e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.818192  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3984  3'-5' exonuclease  63.46 
 
 
205 aa  254  7e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4358  3'-5' exonuclease  63.29 
 
 
208 aa  253  1e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00583903 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0015  3'-5' exonuclease  58.82 
 
 
206 aa  246  1e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3251  3'-5' exonuclease  60.68 
 
 
205 aa  247  1e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4954  3'-5' exonuclease  61.58 
 
 
205 aa  246  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.332898  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0529  3'-5' exonuclease family protein  57.71 
 
 
206 aa  239  2e-62  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0878  3'-5' exonuclease  54.59 
 
 
206 aa  230  9e-60  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1011  3'-5' exonuclease family protein  54.37 
 
 
204 aa  229  2e-59  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0881939  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0816  3'-5' exonuclease  55.39 
 
 
216 aa  228  5e-59  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00362431  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0327  3'-5' exonuclease  51.81 
 
 
213 aa  204  6e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0678  3'-5' exonuclease  53.03 
 
 
211 aa  197  8e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2246  3'-5' exonuclease  52.97 
 
 
217 aa  197  1e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.520239  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2509  3'-5' exonuclease  50.77 
 
 
209 aa  195  4e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1914  3'-5' exonuclease  50.78 
 
 
209 aa  194  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.194823 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3799  3'-5' exonuclease  48.99 
 
 
209 aa  191  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1621  3'-5' exonuclease  48.48 
 
 
207 aa  189  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.169628  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1147  3'-5' exonuclease  48.7 
 
 
210 aa  181  5e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1118  3'-5' exonuclease  48.7 
 
 
210 aa  181  5e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1922  3'-5' exonuclease  50.79 
 
 
214 aa  179  2e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0431536  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0407  3'-5' exonuclease  50.83 
 
 
214 aa  177  9e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.23143  normal  0.475558 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17051  putative ribonuclease D  47.42 
 
 
214 aa  176  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17921  putative ribonuclease D  44.44 
 
 
211 aa  172  2e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1676  putative ribonuclease D  45.32 
 
 
211 aa  172  4e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17761  putative ribonuclease D  42.58 
 
 
211 aa  170  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20321  putative ribonuclease D  45.03 
 
 
214 aa  167  9e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17711  putative ribonuclease D  40.38 
 
 
213 aa  166  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.606229  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1157  putative ribonuclease D  44.5 
 
 
214 aa  166  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22631  putative ribonuclease D  45.86 
 
 
212 aa  156  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.528712 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1164  3'-5' exonuclease  39.51 
 
 
550 aa  94.7  8e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0638405  normal  0.521406 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2365  ribonuclease D  37.04 
 
 
392 aa  94.7  8e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1310  ribonuclease D  37.28 
 
 
393 aa  94.4  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0761558  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1102  ribonuclease D  33.71 
 
 
381 aa  92.8  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.447104 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2378  ribonuclease D  32.45 
 
 
388 aa  92.4  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0306951  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2915  ribonuclease D  35.19 
 
 
384 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.71174 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3141  ribonuclease D  35.19 
 
 
384 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.579669 
 
 
-
 
NC_004310  BR0750  ribonuclease D  33.71 
 
 
385 aa  90.1  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0744  ribonuclease D  33.71 
 
 
385 aa  90.1  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1588  ribonuclease D  32 
 
 
384 aa  89.7  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2546  ribonuclease D  31.01 
 
 
389 aa  89.7  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5131  ribonuclease D  34.57 
 
 
389 aa  89  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2073  ribonuclease D  35.29 
 
 
386 aa  88.6  6e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2542  ribonuclease D  32.57 
 
 
385 aa  88.2  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0208  ribonuclease D  31.03 
 
 
405 aa  86.7  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.790947 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0799  ribonuclease D  29.12 
 
 
383 aa  86.3  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.42118  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4526  ribonuclease D  33.97 
 
 
394 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780043  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1249  ribonuclease D  31.43 
 
 
381 aa  85.5  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.606694  normal  0.0871939 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1474  ribonuclease D  31.06 
 
 
385 aa  85.1  7e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.366853  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0506  ribonuclease D  33.54 
 
 
395 aa  84.7  9e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.967739 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3138  ribonuclease D  32.89 
 
 
382 aa  84.3  1e-15  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.340789 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3039  ribonuclease D  33.53 
 
 
384 aa  84  1e-15  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.178838  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0323  RNase D  31.55 
 
 
375 aa  84  2e-15  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.85777e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3861  ribonuclease D (RNase D)  29.56 
 
 
384 aa  80.5  2e-14  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.623671  normal  0.66998 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1838  ribonuclease D  31.25 
 
 
386 aa  80.1  2e-14  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.529278  normal  0.0732716 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2949  ribonuclease D  27.46 
 
 
392 aa  79.3  3e-14  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.967436  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1582  3'-5' exonuclease  30.18 
 
 
385 aa  79.3  3e-14  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0042  ribonuclease D  27.44 
 
 
395 aa  79.3  3e-14  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00728921  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3324  ribonuclease D  31.76 
 
 
427 aa  78.2  8e-14  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.342463  normal  0.392849 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1389  ribonuclease D  28.4 
 
 
388 aa  78.2  9e-14  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.465016 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2494  ribonuclease D  28.42 
 
 
382 aa  78.2  9e-14  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.121397  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0736  ribonuclease D  31.17 
 
 
381 aa  77.4  1e-13  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0989413  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0679  ribonuclease D  30.06 
 
 
385 aa  77  2e-13  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1971  ribonuclease D  30.06 
 
 
385 aa  77  2e-13  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1734  ribonuclease D  31.64 
 
 
381 aa  76.3  3e-13  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.312389  decreased coverage  0.00186691 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1337  ribonuclease D  29.34 
 
 
405 aa  76.3  3e-13  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.118451  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>