33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0067 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0067  hypothetical protein  100 
 
 
306 aa  614  1e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.690329  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0178  hypothetical protein  35.14 
 
 
258 aa  144  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0526761  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0418  hypothetical protein  38.66 
 
 
244 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0175  hypothetical protein  35.85 
 
 
256 aa  142  8e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0658  hypothetical protein  37.11 
 
 
243 aa  140  2e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.27994 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0124  hypothetical protein  35.35 
 
 
233 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0169027  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0048  protein of unknown function DUF1239  34.67 
 
 
246 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0172  hypothetical protein  33.83 
 
 
230 aa  130  3e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2721  protein of unknown function DUF1239  34.51 
 
 
252 aa  112  1e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.0594287 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2498  hypothetical protein  34.51 
 
 
252 aa  112  1e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.238493  normal  0.312198 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0150  hypothetical protein  31 
 
 
255 aa  111  2e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.211696  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0571  hypothetical protein  29.49 
 
 
241 aa  109  5e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5468  hypothetical protein  36.6 
 
 
239 aa  109  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.131274  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5274  hypothetical protein  35.12 
 
 
245 aa  109  7e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.357303  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_004310  BR0155  hypothetical protein  32.08 
 
 
217 aa  108  9e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0167  hypothetical protein  35 
 
 
237 aa  102  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0156  protein of unknown function DUF1239  34.03 
 
 
250 aa  102  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.535072 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2426  protein of unknown function DUF1239  34.04 
 
 
253 aa  101  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.289708  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0061  protein of unknown function DUF1239  30.39 
 
 
221 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5923  protein of unknown function DUF1239  34.74 
 
 
240 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0018  hypothetical protein  30.16 
 
 
222 aa  97.1  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000157484 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0045  protein of unknown function DUF1239  30.2 
 
 
221 aa  85.9  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.140568 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3670  hypothetical protein  31.58 
 
 
235 aa  85.5  1e-15  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0408  hypothetical protein  29.19 
 
 
221 aa  82  1e-14  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.47995  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0195  hypothetical protein  31.03 
 
 
239 aa  78.6  1e-13  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.296411  normal  0.846633 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1370  hypothetical protein  23.44 
 
 
214 aa  60.1  5e-08  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1691  hypothetical protein  29.26 
 
 
206 aa  58.9  9e-08  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3250  hypothetical protein  23.94 
 
 
214 aa  50.8  3e-05  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0013  hypothetical protein  23.31 
 
 
274 aa  46.6  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2773  hypothetical protein  28.47 
 
 
204 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0227  hypothetical protein  27.74 
 
 
198 aa  44.3  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2904  hypothetical protein  25.14 
 
 
231 aa  43.9  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.796329  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0108  hypothetical protein  25.34 
 
 
237 aa  42.4  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.760602 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>