76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0066 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0066  OstA family protein  100 
 
 
230 aa  453  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.297106  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0123  hypothetical protein  53.07 
 
 
225 aa  166  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0308315  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0176  OstA-like protein  50 
 
 
221 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.435721  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0177  OstA-like protein  47.74 
 
 
228 aa  158  5e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0249318  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0657  OstA-like protein  48.15 
 
 
219 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.292624 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0049  OstA family protein  52.02 
 
 
221 aa  155  7e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162045  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0173  OstA-like protein  50.57 
 
 
227 aa  150  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.65593 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0417  OstA-like protein  47.37 
 
 
225 aa  147  2e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5924  OstA family protein  35.71 
 
 
239 aa  111  1e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.657817  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0168  OstA family protein  35.59 
 
 
216 aa  108  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0151  hypothetical protein  37.57 
 
 
216 aa  107  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0300186  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0156  hypothetical protein  37.65 
 
 
204 aa  107  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0570  OstA family protein  43.23 
 
 
212 aa  105  6e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3669  OstA-like protein  37.38 
 
 
186 aa  103  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0046  OstA family protein  37.58 
 
 
211 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5469  OstA family protein  39.62 
 
 
223 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.12141  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2427  OstA family protein  37.2 
 
 
250 aa  100  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0150816  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2499  OstA family protein  36.81 
 
 
242 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0667889  normal  0.241313 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2722  OstA family protein  36.31 
 
 
246 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.475694  normal  0.0622049 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0062  OstA family protein  33.84 
 
 
204 aa  96.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0017  OstA family protein  34.46 
 
 
186 aa  94.4  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000148492 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0157  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  36.84 
 
 
207 aa  91.7  9e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.503776 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0406  cell envelope biogenesis protein YhbN  34.98 
 
 
187 aa  91.3  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1369  OstA family protein  36.43 
 
 
200 aa  90.5  2e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.524769  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1155  OstA-like protein  36.36 
 
 
163 aa  87.8  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2816  OstA family protein  36.36 
 
 
163 aa  87.8  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.402903  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3586  OstA family protein  36.91 
 
 
170 aa  82  7e-15  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0194  cell envelope biogenesis YhbN  35.46 
 
 
197 aa  80.1  3e-14  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.106383  normal  0.827244 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2772  OstA family protein  33.55 
 
 
168 aa  79.3  4e-14  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5273  OstA family protein  41.03 
 
 
285 aa  77  2e-13  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2905  OstA family protein  30.91 
 
 
173 aa  72.4  5e-12  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358104  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2071  OstA family protein  31.21 
 
 
199 aa  71.2  1e-11  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0437606  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0107  OstA family protein  33.99 
 
 
180 aa  70.1  2e-11  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.587032 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0226  OstA-like protein  31.79 
 
 
160 aa  66.6  3e-10  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3249  OstA-like protein  32.41 
 
 
184 aa  66.6  3e-10  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2168  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  32.7 
 
 
182 aa  65.1  9e-10  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2606  OstA family protein  33.72 
 
 
161 aa  64.3  2e-09  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4956  OstA family protein  29.65 
 
 
196 aa  63.9  2e-09  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2341  OstA-like protein  31.21 
 
 
191 aa  62.8  5e-09  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.239355 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0336  OstA family protein  30.43 
 
 
362 aa  61.6  1e-08  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0497543  normal  0.164761 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1889  hypothetical protein  29.53 
 
 
167 aa  57.8  1e-07  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1672  OstA family protein  40.21 
 
 
323 aa  57.8  1e-07  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3336  OstA family protein  30.25 
 
 
179 aa  56.6  3e-07  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1281  OstA-like protein  28.19 
 
 
169 aa  56.6  3e-07  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  5.2201e-08 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2791  OstA-like protein  26.95 
 
 
275 aa  54.3  2e-06  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.127705  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0972  OstA family protein  27.22 
 
 
174 aa  52.8  5e-06  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  1.11121e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2713  OstA family protein  28.49 
 
 
188 aa  52.8  5e-06  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0025  OstA-like protein  27.7 
 
 
144 aa  51.2  1e-05  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00942039  normal  0.387287 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0877  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  52.27 
 
 
180 aa  50.8  2e-05  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  1.1507e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0728  OstA-like protein  26.58 
 
 
180 aa  49.7  4e-05  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0206  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  24.63 
 
 
179 aa  49.3  5e-05  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0152  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  28.19 
 
 
175 aa  49.3  5e-05  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.301086  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0535  OstA-like family protein  26.09 
 
 
177 aa  48.9  7e-05  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.872333  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0012  hypothetical protein  27.33 
 
 
323 aa  47.4  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.541863  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12810  LPS transport protein LptA  28.47 
 
 
184 aa  47  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5033  hypothetical protein  56.76 
 
 
175 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0234887  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57920  hypothetical protein  56.76 
 
 
175 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2974  OstA family protein  27.33 
 
 
169 aa  46.2  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  2.75423e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0872  OstA family protein  27.12 
 
 
181 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0206259  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3027  hypothetical protein  28.48 
 
 
182 aa  45.4  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2635  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  28.48 
 
 
182 aa  45.4  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.317916  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4314  OstA family protein  25.68 
 
 
186 aa  45.4  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.257817 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0140  OstA-like protein  35.85 
 
 
176 aa  44.7  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0508  OstA family protein  26.14 
 
 
198 aa  43.9  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.346357  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0954  hypothetical protein  44.74 
 
 
174 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0993  cell envelope biogenesis YhbN  44.74 
 
 
174 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0961  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  44.74 
 
 
174 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4261  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  44.74 
 
 
174 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0974  OstA-like protein  24.34 
 
 
180 aa  43.9  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0368  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  28.47 
 
 
174 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.166234 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3708  OstA family protein  32.94 
 
 
214 aa  43.5  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.14713 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1940  hypothetical protein  31.13 
 
 
166 aa  43.1  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.946021  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3392  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  25.45 
 
 
162 aa  42  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4487  OstA-like protein  31.76 
 
 
205 aa  42.4  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.149914 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1603  OstA family protein  29.25 
 
 
181 aa  42  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0859  OstA-like protein  26.09 
 
 
181 aa  41.6  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.492596  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>