More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0065 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0065  ABC transporter related  100 
 
 
310 aa  624  1e-178  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127578  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0122  putative ABC transporter ATP-binding protein  78.06 
 
 
336 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.069577  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0174  ABC transporter, ATPase subunit  78.06 
 
 
332 aa  380  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0176  ABC transporter related  76.79 
 
 
333 aa  376  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102512  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0416  ABC transporter related  76.79 
 
 
317 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0157  ABC transporter, ATP-binding protein  77.22 
 
 
277 aa  373  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0152  ABC transporter, ATP-binding protein  77.22 
 
 
254 aa  374  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0336404  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0169  ABC transporter related  74.6 
 
 
279 aa  372  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0177  ABC transporter related  73.98 
 
 
317 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.32716  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0656  ABC transporter related  75.11 
 
 
314 aa  368  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.30871 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0050  ABC transporter related  73.44 
 
 
316 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161692  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0568  ABC transporter related  73.17 
 
 
311 aa  364  1e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3668  ABC transporter related  71.15 
 
 
261 aa  362  5e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1145  ABC transporter related  73.17 
 
 
282 aa  356  2e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0734842  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0016  ABC transporter related  72.87 
 
 
270 aa  356  3e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00016595 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5470  ABC transporter related  72.4 
 
 
283 aa  356  3e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279643  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1368  ABC transporter, ATP-binding protein  70.61 
 
 
264 aa  356  3e-97  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.569741  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2183  ABC transporter related  69.43 
 
 
282 aa  352  3e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392022  normal  0.686559 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0158  ABC transporter related  68.13 
 
 
321 aa  351  7e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.44909 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2428  ABC transporter related  69.63 
 
 
289 aa  351  1e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.047746  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2500  ABC transporter related  75.11 
 
 
289 aa  350  2e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0376779  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2723  ABC transporter related  75.11 
 
 
290 aa  350  2e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.569692  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0047  ABC transporter related  72.15 
 
 
258 aa  348  6e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.132774 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0063  ABC transporter related  72.15 
 
 
258 aa  347  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0405  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  68.15 
 
 
268 aa  346  3e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0011  ABC transporter component  63.64 
 
 
288 aa  343  2e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0193  ABC transporter related  73.28 
 
 
267 aa  343  3e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.572314  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0337  ABC transporter related  69.11 
 
 
263 aa  338  9e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.155837 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4957  ABC transporter related  65.29 
 
 
256 aa  332  4e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2906  ABC transporter related  66.67 
 
 
258 aa  321  9e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.20972  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1673  ABC transporter related  63.39 
 
 
264 aa  320  2e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2771  ABC transporter related  61.57 
 
 
253 aa  315  5e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1156  ABC transporter, ATPase subunit  62.34 
 
 
253 aa  314  1e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2817  ABC transporter related  62.34 
 
 
253 aa  314  1e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3000  ABC transporter related  64.85 
 
 
271 aa  312  5e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.148105 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3585  ATPase  60.56 
 
 
254 aa  311  6e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4262  ABC transporter related  61.25 
 
 
241 aa  311  7e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2605  ABC transporter related  63.95 
 
 
244 aa  311  7e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.675994 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0106  ABC transporter related  63.18 
 
 
253 aa  311  9e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.995719 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12800  LPS transport protein LptB  60.83 
 
 
241 aa  311  9e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0225  ABC transporter related  59.92 
 
 
249 aa  311  1e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0296  ABC transporter related  64.56 
 
 
267 aa  310  2e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4452  ABC transporter, ATP-binding protein  61.25 
 
 
241 aa  310  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0858  ABC transporter-like  60.42 
 
 
241 aa  309  3e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320929  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4146  ABC transporter  60.83 
 
 
241 aa  309  4e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0024  ABC transporter related  61.25 
 
 
252 aa  308  7e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00950535  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57930  putative ATP-binding component of ABC transporter  60.42 
 
 
241 aa  308  8e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0960  ABC transporter related  60.83 
 
 
241 aa  308  9e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0992  ABC transporter related  60.83 
 
 
241 aa  308  1e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0953  ABC transporter ATP-binding protein  60.83 
 
 
241 aa  308  1e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5034  ABC transporter ATP-binding protein  60 
 
 
241 aa  306  2e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0268647  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  61.92 
 
 
243 aa  306  3e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2125  ABC transporter related  64.29 
 
 
241 aa  306  3e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0871  ABC transporter related  60 
 
 
241 aa  305  6e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0818606  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0673  ABC transporter related  61.69 
 
 
262 aa  305  6e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125229  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03192  ABC-type transport system ATPase component  58.33 
 
 
241 aa  305  9e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3107  ABC transporter, ATP-binding protein  59.76 
 
 
258 aa  304  1e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  59.76 
 
 
258 aa  304  1e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0075  ABC transporter, ATP-binding protein  59.76 
 
 
258 aa  304  1e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0582  ABC transporter, ATP-binding protein  59.76 
 
 
258 aa  304  1e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0766  ABC transporter system, ATP-binding protein  59.76 
 
 
258 aa  304  1e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.857207  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0598  ABC transporter, ATP-binding protein  59.76 
 
 
258 aa  304  1e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2943  ABC transporter, ATP-binding protein  59.76 
 
 
258 aa  304  1e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02228  ABC transporter ATP-binding protein  63.87 
 
 
239 aa  303  2e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.622323  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0487  ABC transporter, ATP-binding protein  59.36 
 
 
258 aa  303  3e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.635199  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4121  ABC transporter, ATPase subunit  58.96 
 
 
261 aa  303  3e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  60 
 
 
241 aa  303  3e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0597  ABC transporter related  58.96 
 
 
261 aa  303  3e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0435549 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0251  ATPase  61.25 
 
 
244 aa  302  4e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2176  ABC transporter related  59.36 
 
 
258 aa  302  4e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0525  ABC transporter related  58.96 
 
 
258 aa  300  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3178  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  57.98 
 
 
241 aa  300  1e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2790  ABC transporter related  58.96 
 
 
258 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.015078  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2801  ABC transporter related  58.96 
 
 
258 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.312589 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2117  ABC transporter related  59 
 
 
244 aa  301  1e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002404  lipopolysaccharide ABC transporter ATP-binding protein LptB  60 
 
 
241 aa  300  2e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.052444  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1937  ABC transporter related  58.75 
 
 
244 aa  300  2e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0327  ABC transporter related  58.96 
 
 
260 aa  300  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.945249  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2108  ABC transporter, ATP-binding protein  59.58 
 
 
241 aa  300  2e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0465  ABC transporter related  61.04 
 
 
264 aa  300  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0288  ATPase  60 
 
 
244 aa  299  3e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.017076 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1911  ABC transporter related  59.13 
 
 
255 aa  299  3e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2546  ABC transporter related  59.83 
 
 
244 aa  298  5e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.651086  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0418  ABC transporter-related protein  61.32 
 
 
263 aa  298  6e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757416  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4486  ABC transporter related  62.04 
 
 
268 aa  298  7e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0534  ATPase component ABC-type transport system  60.25 
 
 
240 aa  298  9e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2850  ABC transporter related  58.17 
 
 
258 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6120  ABC transporter, ATPase subunit  58.17 
 
 
258 aa  297  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668552  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0868  ABC transporter related  60.78 
 
 
254 aa  296  2e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1616  ABC transporter related  59.52 
 
 
255 aa  296  2e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2167  ABC transporter related  60.34 
 
 
247 aa  296  2e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0347  ABC transporter related  62.45 
 
 
255 aa  296  3e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2714  ABC transporter related  61.67 
 
 
241 aa  296  3e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0757  ABC transporter ATP-binding protein  61.67 
 
 
240 aa  296  3e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.943257  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2225  ABC transporter related  57.66 
 
 
259 aa  296  3e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2708  ABC transporter related  58.17 
 
 
258 aa  296  4e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0148157 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2170  ABC transporter-related protein  58.75 
 
 
244 aa  295  6e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.529851  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1939  hypothetical protein  60.76 
 
 
241 aa  295  6e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4542  ABC transporter, ATP-binding protein  57.68 
 
 
246 aa  295  6e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0085  ABC transporter related  61.51 
 
 
268 aa  295  7e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>