69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0060 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0060  phospholipase/carboxylesterase  100 
 
 
226 aa  448  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.885579  normal  0.31865 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4839  phospholipase/Carboxylesterase  72 
 
 
232 aa  328  4e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1148  phospholipase/Carboxylesterase  67.26 
 
 
239 aa  300  1e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5584  phospholipase/carboxylesterase  67.56 
 
 
231 aa  298  4e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1368  phospholipase/Carboxylesterase  69.96 
 
 
239 aa  289  2e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4055  phospholipase/carboxylesterase  71.11 
 
 
242 aa  288  3e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.342724  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1208  phospholipase/carboxylesterase  69.06 
 
 
239 aa  285  5e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.12535 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6756  phospholipase/carboxylesterase  60.71 
 
 
225 aa  277  8e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.847027  normal  0.369639 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4173  phospholipase/carboxylesterase  57.33 
 
 
225 aa  259  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741665  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0063  phospholipase/carboxylesterase  45.89 
 
 
227 aa  167  9e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.982882  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2287  phospholipase/Carboxylesterase  43.72 
 
 
263 aa  153  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.191504  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1773  phospholipase/Carboxylesterase  42.73 
 
 
239 aa  151  8e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4614  phospholipase/Carboxylesterase  41.23 
 
 
238 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.376672 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3855  phospholipase/Carboxylesterase  43.92 
 
 
226 aa  134  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0335  phospholipase/carboxylesterase  34.5 
 
 
357 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.64094  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0548  phospholipase/Carboxylesterase  34.1 
 
 
358 aa  79  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.185297  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1052  phospholipase/carboxylesterase  34.18 
 
 
365 aa  79  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0490  hypothetical protein  32.37 
 
 
357 aa  72.4  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.637254  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3106  putative lipoprotein  34.62 
 
 
341 aa  72.4  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1106  hypothetical protein  31.43 
 
 
355 aa  72  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.117901 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3487  hypothetical protein  28.78 
 
 
332 aa  56.2  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3966  phospholipase/carboxylesterase  24.39 
 
 
795 aa  54.3  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3399  phospholipase/Carboxylesterase  29.53 
 
 
886 aa  53.1  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0843548  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3127  phospholipase/Carboxylesterase  27.04 
 
 
314 aa  53.1  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2257  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  22.41 
 
 
270 aa  52.8  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4488  phospholipase/Carboxylesterase  23.44 
 
 
204 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.332778 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3866  hypothetical protein  35.63 
 
 
302 aa  51.2  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178954  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4424  phospholipase/Carboxylesterase  23.44 
 
 
204 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2261  putative esterase/lipase/thioesterase  29.48 
 
 
361 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.0820217 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5020  phospholipase/Carboxylesterase  25.14 
 
 
563 aa  48.9  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.780509  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1590  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  30.23 
 
 
353 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255211  normal  0.12664 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2408  carbohydrate esterase family 1 protein  27.27 
 
 
316 aa  47.8  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.211104  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2860  carboxylesterase Est2  36.27 
 
 
321 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.79214  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0297  lpqC, putative  27.71 
 
 
306 aa  47  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433259  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0373  polyhydroxybutyrate depolymerase  30.87 
 
 
357 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0880654  hitchhiker  0.00622899 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0080  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  27.64 
 
 
286 aa  47  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1204  phospholipase/carboxylesterase  25.85 
 
 
335 aa  46.6  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.299935  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3270  esterase, PHB depolymerase  33.33 
 
 
372 aa  46.2  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3402  carboxylesterase  25.48 
 
 
220 aa  46.2  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3857  PHB depolymerase family esterase  33.77 
 
 
414 aa  45.4  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5113  esterase, PHB depolymerase  29.17 
 
 
370 aa  45.4  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0713  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  29.71 
 
 
287 aa  45.4  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0313  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.83 
 
 
518 aa  45.1  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1272  Carboxylesterase  25.9 
 
 
220 aa  44.3  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0282  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.13 
 
 
518 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3990  Poly (3-hydroxybutyrate ) depolymerase  33.33 
 
 
396 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2306  phospholipase/carboxylesterase  29.7 
 
 
235 aa  44.3  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412885  hitchhiker  0.00320087 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1400  phospholipase/Carboxylesterase  24.19 
 
 
325 aa  44.3  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07050  hypothetical protein  32.2 
 
 
322 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0696  phospholipase/Carboxylesterase  27.93 
 
 
218 aa  43.5  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3420  phospholipase/Carboxylesterase  23.76 
 
 
205 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1419  lipolytic protein  30.82 
 
 
383 aa  43.1  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.252701  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1772  esterase/lipase protein  31.65 
 
 
344 aa  43.1  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1983  phospholipase/Carboxylesterase  25.51 
 
 
217 aa  43.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0573653  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3344  PHB depolymerase family esterase  34.15 
 
 
429 aa  43.1  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.335799  normal  0.68562 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4485  phospholipase/Carboxylesterase  25.67 
 
 
212 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2297  phospholipase/carboxylesterase  27.45 
 
 
238 aa  42.7  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.563406  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1493  phospholipase/Carboxylesterase  24.67 
 
 
317 aa  42.7  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.030471  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0941  phospholipase/carboxylesterase  28.66 
 
 
552 aa  42.4  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.443784 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1208  phospholipase/Carboxylesterase  23.7 
 
 
223 aa  42.4  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1462  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.2 
 
 
680 aa  42  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_92448  predicted protein  28.21 
 
 
359 aa  42  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.492816  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3306  phospholipase/carboxylesterase family protein  23.16 
 
 
240 aa  42.4  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.703144  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2640  hypothetical protein  25.56 
 
 
469 aa  42  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.123616  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0531  phospholipase/carboxylesterase  32.29 
 
 
221 aa  42  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1475  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.94 
 
 
326 aa  42  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.617097  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00180  conserved hypothetical protein  26.19 
 
 
340 aa  41.6  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1240  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  27.32 
 
 
370 aa  42  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.194401 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2781  hypothetical protein  33.33 
 
 
796 aa  41.6  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.216427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>