271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0055 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0055  large conductance mechanosensitive channel protein  100 
 
 
140 aa  276  6e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.153997 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4693  large-conductance mechanosensitive channel  70.07 
 
 
138 aa  197  4e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2962  large-conductance mechanosensitive channel  69.34 
 
 
159 aa  193  7e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2630  large conductance mechanosensitive channel protein  71.43 
 
 
138 aa  192  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425108  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2641  large-conductance mechanosensitive channel  69.01 
 
 
143 aa  192  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00276841 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1928  large-conductance mechanosensitive channel  65.22 
 
 
139 aa  188  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.425698 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2603  large-conductance mechanosensitive channel  66.9 
 
 
143 aa  178  3e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.240683  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2261  large-conductance mechanosensitive channel  64.75 
 
 
139 aa  177  5e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0089  large conductance mechanosensitive channel protein  60.87 
 
 
142 aa  176  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1030  large conductance mechanosensitive channel protein  63.77 
 
 
139 aa  171  4e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.184236  normal  0.070135 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0253  large-conductance mechanosensitive channel  59.72 
 
 
145 aa  169  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410741  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0410  large-conductance mechanosensitive channel  60.14 
 
 
137 aa  167  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0318  large-conductance mechanosensitive channel  62.5 
 
 
138 aa  166  7e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384644  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0334  large-conductance mechanosensitive channel  61.76 
 
 
138 aa  166  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0803754  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3208  large conductance mechanosensitive channel protein  60.71 
 
 
141 aa  166  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0654251  normal  0.948556 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2607  large conductance mechanosensitive channel protein  61.15 
 
 
142 aa  163  7e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  0.681771 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2802  large conductance mechanosensitive channel protein  60 
 
 
141 aa  160  6e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.21352  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2579  large conductance mechanosensitive channel protein  60 
 
 
141 aa  160  6e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0225  large-conductance mechanosensitive channel  56.94 
 
 
145 aa  156  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6045  large conductance mechanosensitive channel protein  56.74 
 
 
163 aa  155  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0622  large conductance mechanosensitive channel protein  58.91 
 
 
144 aa  152  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0929  large-conductance mechanosensitive channel  60.28 
 
 
140 aa  150  5e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6128  large-conductance mechanosensitive channel  56.94 
 
 
143 aa  148  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.316261  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1951  large-conductance mechanosensitive channel  56.94 
 
 
143 aa  148  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5262  large-conductance mechanosensitive channel  56.25 
 
 
143 aa  148  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0455479  normal  0.24364 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1975  large-conductance mechanosensitive channel  56.94 
 
 
143 aa  148  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0443039 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0292  large-conductance mechanosensitive channel  53.24 
 
 
138 aa  147  4e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1865  large-conductance mechanosensitive channel  56.25 
 
 
143 aa  147  7e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.568071  hitchhiker  0.00372648 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1938  large-conductance mechanosensitive channel  56.25 
 
 
143 aa  147  7e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0820  large-conductance mechanosensitive channel  56.55 
 
 
151 aa  146  8e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.577469  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0166  large-conductance mechanosensitive channel  53.9 
 
 
142 aa  145  1e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.3696  normal  0.313526 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3310  large-conductance mechanosensitive channel  55.56 
 
 
143 aa  145  2e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00104042  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2000  large-conductance mechanosensitive channel  55.56 
 
 
143 aa  145  2e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2373  large-conductance mechanosensitive channel  55.56 
 
 
143 aa  145  2e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140991  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2415  large-conductance mechanosensitive channel  55.56 
 
 
143 aa  145  2e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258205  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1272  large-conductance mechanosensitive channel  55.56 
 
 
143 aa  145  2e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.404097  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2079  large-conductance mechanosensitive channel  55.56 
 
 
143 aa  145  2e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1501  large-conductance mechanosensitive channel  55.56 
 
 
143 aa  145  2e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917907  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0848  large-conductance mechanosensitive channel  53.28 
 
 
137 aa  144  3e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.231503  normal  0.69291 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2521  large-conductance mechanosensitive channel  55.56 
 
 
199 aa  145  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.334793  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0712  large-conductance mechanosensitive channel  54.86 
 
 
142 aa  144  5e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3652  large-conductance mechanosensitive channel  54.68 
 
 
134 aa  140  5e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.326365 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1538  large conductance mechanosensitive channel protein  52.45 
 
 
143 aa  139  1e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.580363  normal  0.302083 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1187  large conductance mechanosensitive channel protein  56.94 
 
 
143 aa  138  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2963  large conductance mechanosensitive channel protein  57.93 
 
 
142 aa  137  4e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232112  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0941  large conductance mechanosensitive channel protein  55.07 
 
 
137 aa  137  7e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.954406  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2379  large-conductance mechanosensitive channel  51.02 
 
 
146 aa  135  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.567154 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1381  large conductance mechanosensitive channel protein  49.64 
 
 
132 aa  134  3e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1318  large-conductance mechanosensitive channel  54.17 
 
 
143 aa  134  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.212571  hitchhiker  0.00243459 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0724  large-conductance mechanosensitive channel  50.34 
 
 
146 aa  133  6e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4613  large-conductance mechanosensitive channel  51.08 
 
 
136 aa  133  9e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000924287  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03141  large-conductance mechanosensitive channel  51.08 
 
 
136 aa  133  9e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3484  large-conductance mechanosensitive channel  51.08 
 
 
136 aa  133  9e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.175922  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0423  large-conductance mechanosensitive channel  51.08 
 
 
136 aa  133  9e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.465174  hitchhiker  1.68159e-05 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3774  large-conductance mechanosensitive channel  51.08 
 
 
136 aa  133  9e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0382022  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3586  large-conductance mechanosensitive channel  51.08 
 
 
136 aa  133  9e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515412  normal  0.131611 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0423  large conductance mechanosensitive channel protein  51.08 
 
 
136 aa  133  9e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03092  hypothetical protein  51.08 
 
 
136 aa  133  9e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41090  large-conductance mechanosensitive channel  50 
 
 
136 aa  132  1e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.629414  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3207  large-conductance mechanosensitive channel  53.47 
 
 
142 aa  132  2e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4276  large-conductance mechanosensitive channel  48.57 
 
 
148 aa  131  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.348387  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3677  large-conductance mechanosensitive channel  50.36 
 
 
136 aa  131  3e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4641  large conductance mechanosensitive channel protein  48.57 
 
 
148 aa  129  9e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5504  large-conductance mechanosensitive channel  55.86 
 
 
142 aa  129  1e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.215904 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4887  large-conductance mechanosensitive channel  50 
 
 
154 aa  128  2e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3339  large-conductance mechanosensitive channel  48.91 
 
 
136 aa  129  2e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0386  large conductance mechanosensitive channel protein  50.35 
 
 
143 aa  129  2e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.242536 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4507  large-conductance mechanosensitive channel  50 
 
 
139 aa  129  2e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2443  large-conductance mechanosensitive channel  51.72 
 
 
146 aa  128  2e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.954561  normal  0.582665 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2860  large-conductance mechanosensitive channel  52.08 
 
 
142 aa  128  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.219386 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3231  large-conductance mechanosensitive channel  52.52 
 
 
144 aa  128  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3793  large-conductance mechanosensitive channel  47.14 
 
 
137 aa  127  4e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.832034  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61050  large-conductance mechanosensitive channel  49.29 
 
 
137 aa  127  4e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4645  large-conductance mechanosensitive channel  49.29 
 
 
139 aa  127  4e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5255  large-conductance mechanosensitive channel  49.29 
 
 
137 aa  127  4e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.861371  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2930  large-conductance mechanosensitive channel  50.7 
 
 
141 aa  127  4e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2316  large-conductance mechanosensitive channel  53.74 
 
 
148 aa  127  4e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0475958  normal  0.500244 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2455  large-conductance mechanosensitive channel  50.35 
 
 
141 aa  127  5e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4639  large-conductance mechanosensitive channel  49.29 
 
 
139 aa  127  5e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3722  large-conductance mechanosensitive channel  47.86 
 
 
137 aa  126  9e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.459106  hitchhiker  0.00604869 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1871  large-conductance mechanosensitive channel  53.06 
 
 
148 aa  126  1e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0110608  normal  0.0250819 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1750  large conductance mechanosensitive channel protein  46.04 
 
 
133 aa  125  1e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3455  large conductance mechanosensitive channel protein  49.3 
 
 
142 aa  126  1e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0277457  normal  0.0882552 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0521  large-conductance mechanosensitive channel  47.45 
 
 
136 aa  125  1e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3511  large-conductance mechanosensitive channel  47.45 
 
 
136 aa  125  1e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0992  large-conductance mechanosensitive channel  48.57 
 
 
140 aa  126  1e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.158656  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0712  large-conductance mechanosensitive channel  52.9 
 
 
142 aa  126  1e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268263  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0437  large-conductance mechanosensitive channel  48.23 
 
 
133 aa  125  2e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000628379  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0435  large conductance mechanosensitive channel protein  46.48 
 
 
135 aa  125  2e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0520  large-conductance mechanosensitive channel  47.45 
 
 
136 aa  125  2e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0554  large-conductance mechanosensitive channel  47.83 
 
 
136 aa  125  3e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000110723  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0611  large-conductance mechanosensitive channel  50 
 
 
137 aa  124  4e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0263138  normal  0.217178 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3886  large-conductance mechanosensitive channel  50 
 
 
137 aa  124  4e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00283568  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3697  large-conductance mechanosensitive channel  53.15 
 
 
143 aa  123  7e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.93238  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0522  large-conductance mechanosensitive channel  45 
 
 
136 aa  123  8e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0312  large-conductance mechanosensitive channel  50.37 
 
 
134 aa  123  9e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.929299  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3333  large-conductance mechanosensitive channel  53.15 
 
 
141 aa  122  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.662595  hitchhiker  0.000286923 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3789  large-conductance mechanosensitive channel  49.64 
 
 
136 aa  122  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0352  large conductance mechanosensitive channel protein  46.53 
 
 
141 aa  123  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.559193  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3672  large conductance mechanosensitive channel protein  51.43 
 
 
140 aa  122  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>