21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0051 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0051  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  514  1e-145  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.514774 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4081  hypothetical protein  38.22 
 
 
267 aa  176  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0619  hypothetical protein  39.83 
 
 
266 aa  170  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0794565 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3512  hypothetical protein  34.78 
 
 
254 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3807  hypothetical protein  36.18 
 
 
254 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.18849  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0344  hypothetical protein  35.47 
 
 
267 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.123778  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0809  hypothetical protein  38.19 
 
 
253 aa  153  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2992  putative transmembrane protein  32.9 
 
 
236 aa  149  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6348  hypothetical protein  34.94 
 
 
253 aa  136  3e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.291018 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2455  hypothetical protein  30.28 
 
 
261 aa  130  2e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.928532  normal  0.405844 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5340  hypothetical protein  31.2 
 
 
253 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0236442  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4959  hypothetical protein  30.8 
 
 
253 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.07643  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5047  hypothetical protein  30.8 
 
 
253 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.713313  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0153  hypothetical protein  32.52 
 
 
309 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0221  hypothetical protein  25.83 
 
 
263 aa  67.4  2e-10  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0032159  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2130  hypothetical protein  24.39 
 
 
261 aa  67  3e-10  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.128783  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0576  hypothetical protein  28.23 
 
 
260 aa  64.7  1e-09  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1148  hypothetical protein  23.59 
 
 
257 aa  52.4  8e-06  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3012  hypothetical protein  20.59 
 
 
265 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0438797  decreased coverage  0.00331074 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3043  hypothetical protein  20.59 
 
 
275 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2997  hypothetical protein  20.59 
 
 
275 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.322506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>