More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0050 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0050  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
317 aa  634  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2468  cation diffusion facilitator family transporter  60.55 
 
 
295 aa  357  1e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  55.41 
 
 
296 aa  338  7e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5513  cation diffusion facilitator family transporter  58.95 
 
 
295 aa  333  2e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281094  normal  0.363198 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2658  cation diffusion facilitator family transporter  59.03 
 
 
295 aa  330  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3065  cation diffusion facilitator family transporter  57.64 
 
 
295 aa  328  5e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.686004  normal  0.910257 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0023  cation diffusion facilitator family transporter  57.68 
 
 
295 aa  327  1e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3290  cation diffusion facilitator family transporter  56.94 
 
 
295 aa  327  2e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0867  cation diffusion facilitator family transporter  59.73 
 
 
295 aa  317  2e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.851238 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3264  cation diffusion facilitator family transporter  57.99 
 
 
295 aa  316  4e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2384  cation diffusion facilitator family transporter  56.31 
 
 
295 aa  308  6e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.336168 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0463  cation efflux transporter  57.68 
 
 
295 aa  306  3e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632211  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1598  cation diffusion facilitator family transporter  56.9 
 
 
302 aa  305  8e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0607  cation diffusion facilitator family transporter  56.29 
 
 
309 aa  303  2e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212656  normal  0.0107339 
 
 
-
 
NC_004310  BR1568  cation efflux family protein  56.9 
 
 
302 aa  301  1e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1514  cation efflux family protein  56.9 
 
 
302 aa  301  1e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  57.72 
 
 
305 aa  299  5e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  53.31 
 
 
304 aa  297  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2115  cation diffusion facilitator family transporter  57 
 
 
295 aa  293  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.922775  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2198  cation diffusion facilitator family transporter  53.4 
 
 
293 aa  292  4e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.776966  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2809  cation diffusion facilitator family transporter  51.36 
 
 
304 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.252612  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  51.68 
 
 
302 aa  283  4e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1536  cation diffusion facilitator family transporter  49.15 
 
 
295 aa  272  6e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.503443  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2294  cation diffusion facilitator family transporter  53.68 
 
 
306 aa  269  6e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38282  normal  0.177312 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1013  metal cation efflux protein CzrB  47.84 
 
 
302 aa  268  7e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.323499  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1178  cation diffusion facilitator family transporter  51.23 
 
 
300 aa  266  5e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00185198  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2446  cation diffusion facilitator family transporter  47.39 
 
 
304 aa  256  5e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.526861  normal  0.400869 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1114  cation efflux protein  43.26 
 
 
305 aa  227  2e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1043  cation efflux protein  41.84 
 
 
320 aa  217  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2073  cation diffusion facilitator family transporter  43.59 
 
 
308 aa  213  4e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  42.49 
 
 
308 aa  210  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1801  cation efflux family protein  41.76 
 
 
376 aa  207  2e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0942158  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1439  cation efflux protein  39.49 
 
 
293 aa  206  3e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0109958  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1731  cation diffusion facilitator family transporter  41.76 
 
 
315 aa  202  8e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560975  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5864  cation diffusion facilitator family transporter  42.67 
 
 
300 aa  201  1e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.499716  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  37.41 
 
 
311 aa  199  6e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1770  cation diffusion facilitator family transporter  41.91 
 
 
315 aa  199  6e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  37.76 
 
 
311 aa  198  8e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1850  cation diffusion facilitator family transporter  41.91 
 
 
315 aa  198  1e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2025  cation diffusion facilitator family transporter  39.5 
 
 
313 aa  198  1e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0165078  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07750  cation diffusion facilitator family transporter  39.59 
 
 
330 aa  197  2e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0597  cation diffusion facilitator family transporter  41.39 
 
 
302 aa  196  5e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1021  cation diffusion facilitator family transporter  42.76 
 
 
346 aa  196  6e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0980  cation diffusion facilitator family transporter  39.57 
 
 
305 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1928  cation diffusion facilitator family transporter  43.61 
 
 
305 aa  189  5e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.479128  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3707  cation diffusion facilitator family transporter  39.54 
 
 
319 aa  189  7e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0354783  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0487  cation diffusion facilitator family transporter  39.54 
 
 
319 aa  188  9e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0225  cation diffusion facilitator family transporter  39.13 
 
 
312 aa  188  9e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2106  cation diffusion facilitator family transporter  42.28 
 
 
315 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  38.11 
 
 
311 aa  187  1e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1334  cation diffusion facilitator family transporter  41.14 
 
 
312 aa  186  6e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.215207  hitchhiker  0.000886879 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5667  cation diffusion facilitator family transporter  38.91 
 
 
328 aa  184  2e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0729  cation diffusion facilitator family transporter  38.57 
 
 
304 aa  181  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3146  cation efflux family protein  40.14 
 
 
296 aa  175  7e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440371  hitchhiker  0.000651912 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2873  cation diffusion facilitator family transporter  40.23 
 
 
314 aa  175  9e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4333  cation efflux protein  33.56 
 
 
297 aa  175  1e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1206  cation diffusion facilitator family transporter  39.35 
 
 
316 aa  174  2e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4790  cation efflux family protein  34.15 
 
 
297 aa  172  6e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4244  cation diffusion facilitator family transporter  40.07 
 
 
339 aa  172  6e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.337864 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2804  cation diffusion facilitator family transporter  40.64 
 
 
303 aa  171  2e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4669  cation diffusion facilitator family transporter  38.93 
 
 
332 aa  162  8e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  33.21 
 
 
309 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4099  cation diffusion facilitator family transporter  37.86 
 
 
304 aa  160  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  34.47 
 
 
307 aa  159  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0446  cation diffusion facilitator family transporter  36.79 
 
 
328 aa  159  8e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.48861  normal  0.265047 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3750  cation diffusion facilitator family transporter  32.3 
 
 
326 aa  157  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220836  hitchhiker  0.0009443 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  33.46 
 
 
323 aa  156  5e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0432  cation diffusion facilitator family transporter  34.08 
 
 
331 aa  156  6e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0470  cation diffusion facilitator family transporter  34.31 
 
 
337 aa  154  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457303  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1683  cation diffusion facilitator family transporter  36.63 
 
 
308 aa  153  3e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  6.76071e-08  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12610  putative transporter  33.09 
 
 
298 aa  153  3e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.686969  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1661  cation diffusion facilitator family transporter  33.56 
 
 
331 aa  153  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2568  cation diffusion facilitator family transporter  31.02 
 
 
332 aa  150  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1146  putative transporter  32.36 
 
 
298 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2000  cation diffusion facilitator family transporter  38.58 
 
 
285 aa  147  3e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.7679  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0724  cation diffusion facilitator family transporter  33.68 
 
 
315 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  1.52803e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0646  cation diffusion facilitator family transporter  33.94 
 
 
289 aa  146  4e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.186266  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0400  cation diffusion facilitator family transporter  29.5 
 
 
327 aa  145  9e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4937  cation efflux protein  33.69 
 
 
298 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0526  cation diffusion facilitator family transporter  37.41 
 
 
327 aa  144  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  31.89 
 
 
328 aa  144  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0047  cation diffusion facilitator family transporter  34.72 
 
 
325 aa  143  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.408108  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4774  cation diffusion facilitator family transporter  34.77 
 
 
290 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00437993 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2581  cation diffusion facilitator family transporter  36.12 
 
 
325 aa  142  8e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1113  hypothetical protein  33.57 
 
 
307 aa  141  2e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.416676  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2871  cation efflux protein  32.99 
 
 
317 aa  141  2e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4650  cation diffusion facilitator family transporter  34.53 
 
 
290 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.188299 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  31.54 
 
 
285 aa  140  3e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  1.34664e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3741  cation diffusion facilitator family transporter  30 
 
 
292 aa  139  4e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2262  ferrous iron efflux protein F  30.48 
 
 
302 aa  139  5e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  8.96639e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4355  ferrous iron efflux protein F  31.09 
 
 
300 aa  136  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.363052 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4103  ferrous iron efflux protein F  31.09 
 
 
300 aa  136  5e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03749  hypothetical protein  31.09 
 
 
300 aa  136  5e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4070  cation diffusion facilitator family transporter  31.09 
 
 
300 aa  136  5e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5369  ferrous iron efflux protein F  31.09 
 
 
300 aa  136  5e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4448  ferrous iron efflux protein F  31.09 
 
 
300 aa  136  5e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4145  ferrous iron efflux protein F  31.09 
 
 
300 aa  136  5e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03800  ferrous iron efflux protein F  31.09 
 
 
300 aa  136  5e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.769582  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4392  ferrous iron efflux protein F  31.72 
 
 
300 aa  135  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4459  ferrous iron efflux protein F  31.72 
 
 
300 aa  135  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.709567  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>