264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0047 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_1217  AAA ATPase central domain protein  57.27 
 
 
565 aa  635  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  2.55374e-05  hitchhiker  1.81039e-08 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0262  AAA family ATPase  58.45 
 
 
558 aa  657  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.673428  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2165  ATPase  60.14 
 
 
560 aa  672  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18070  ATPase, AAA superfamily  60.18 
 
 
585 aa  695  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1175  ATPase central domain-containing protein  57.42 
 
 
574 aa  669  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.700331  normal  0.728429 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1771  AAA ATPase central domain protein  60.57 
 
 
570 aa  684  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0047  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 
608 aa  1248  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1499  ATPase, AAA family  57.43 
 
 
553 aa  625  1e-178  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.790722  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2338  ATPase central domain-containing protein  55.4 
 
 
571 aa  623  1e-177  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1077  ATPase central domain-containing protein  52.11 
 
 
567 aa  595  1e-169  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0956592 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0274  AAA family ATPase  39.75 
 
 
547 aa  388  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0342467 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4172  AAA ATPase, central region  39.96 
 
 
540 aa  353  6e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6755  ATPase central domain-containing protein  39.37 
 
 
540 aa  353  7e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.313237 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4152  AAA ATPase central domain protein  34.29 
 
 
534 aa  242  1e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06718  AAA family ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05752)  38.16 
 
 
822 aa  147  4e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03615  conserved hypothetical protein  40.7 
 
 
1049 aa  121  5e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.391595  normal  0.0454206 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08153  conserved hypothetical protein  27.47 
 
 
697 aa  119  1e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.677221 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01591  conserved hypothetical protein  44.44 
 
 
924 aa  117  9e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.181362  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07091  hypothetical protein  35.29 
 
 
753 aa  116  1e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0972  AAA family ATPase  30 
 
 
743 aa  82  3e-14  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0755  AAA ATPase central domain protein  29.1 
 
 
725 aa  80.9  7e-14  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1049  elongation factor P  32.96 
 
 
432 aa  79.3  2e-13  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1500  AAA ATPase central domain protein  29.82 
 
 
639 aa  79  2e-13  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1952  AAA ATPase central domain protein  29.83 
 
 
656 aa  78.2  4e-13  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.248161 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0165  putative ATPase protein  35.71 
 
 
772 aa  77  9e-13  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0869  AAA ATPase family protein  30.16 
 
 
352 aa  76.6  1e-12  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  1.65138e-05  normal  0.784704 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1499  AAA ATPase central domain protein  27.27 
 
 
744 aa  75.9  2e-12  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1669  AAA ATPase central domain protein  31.21 
 
 
450 aa  75.9  2e-12  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4356  hypothetical protein  29.8 
 
 
652 aa  75.1  4e-12  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00948823  normal  0.0832553 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2275  AAA ATPase, central region  32.68 
 
 
771 aa  74.7  5e-12  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0746104  hitchhiker  0.00641076 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2559  AAA ATPase central domain protein  31.21 
 
 
450 aa  73.9  9e-12  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1651  ATPase central domain-containing protein  28.72 
 
 
653 aa  73.2  1e-11  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0496762 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3054  ATPase central domain-containing protein  30.19 
 
 
725 aa  72.4  2e-11  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000821112 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1879  AAA ATPase  26.06 
 
 
787 aa  72.4  2e-11  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1734  AAA ATPase central domain protein  30.5 
 
 
697 aa  72  3e-11  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.168086 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2234  AAA ATPase, central region  35.56 
 
 
766 aa  72  3e-11  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218503  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3136  AAA ATPase, central region  33.1 
 
 
478 aa  70.9  6e-11  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0853  AAA ATPase  29.41 
 
 
305 aa  70.9  7e-11  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4150  AAA ATPase central domain protein  29.47 
 
 
665 aa  70.5  8e-11  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0362  ATPase central domain-containing protein  29.84 
 
 
448 aa  70.1  1e-10  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4054  AAA ATPase, central region  26.71 
 
 
299 aa  70.1  1e-10  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0357172 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2830  ATPase central domain-containing protein  31.21 
 
 
657 aa  69.7  1e-10  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1882  ATPase central domain-containing protein  31.61 
 
 
617 aa  68.9  2e-10  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2524  AAA ATPase central domain protein  28.57 
 
 
656 aa  69.7  2e-10  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4120  AAA ATPase central domain protein  30.46 
 
 
466 aa  69.3  2e-10  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0052109  hitchhiker  0.000242019 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1020  AAA ATPase central domain protein  29.21 
 
 
646 aa  69.3  2e-10  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1819  ATPase central domain-containing protein  33.1 
 
 
662 aa  69.3  2e-10  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.760352  normal  0.277502 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0659  AAA ATPase central domain protein  27.68 
 
 
442 aa  69.7  2e-10  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0372478  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3602  AAA ATPase, central region  28.41 
 
 
448 aa  68.6  3e-10  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  5.7004e-08 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1305  AAA ATPase central domain protein  30.36 
 
 
731 aa  68.9  3e-10  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.596818  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3267  ATPase central domain-containing protein  34.06 
 
 
795 aa  68.6  3e-10  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115516 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0150  AAA ATPase central domain protein  31.87 
 
 
775 aa  68.2  4e-10  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.172395  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2115  AAA ATPase central domain protein  31.1 
 
 
773 aa  67.8  5e-10  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00930684  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5978  AAA ATPase central domain protein  23.92 
 
 
1085 aa  67  9e-10  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3794  AAA ATPase, central region  30.23 
 
 
369 aa  67  9e-10  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.437647  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1791  AAA ATPase central domain protein  34.96 
 
 
773 aa  66.6  1e-09  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3934  AAA ATPase central domain protein  29.08 
 
 
450 aa  66.6  1e-09  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2455  putative ATPase  31.91 
 
 
441 aa  66.6  1e-09  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0571186  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5237  AAA ATPase central domain protein  25.5 
 
 
459 aa  65.9  2e-09  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.368199  hitchhiker  9.02621e-09 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1864  AAA ATPase central domain protein  29.38 
 
 
678 aa  65.5  3e-09  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0342  AAA ATPase central domain protein  25.89 
 
 
781 aa  64.7  5e-09  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1753  ATPase central domain-containing protein  30.46 
 
 
450 aa  64.7  5e-09  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.215663  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0859  AAA ATPase  32.41 
 
 
634 aa  64.7  5e-09  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1961  putative ATPase protein  34.68 
 
 
771 aa  64.7  5e-09  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.242778  normal  0.909939 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1943  AAA ATPase central domain protein  25.22 
 
 
619 aa  64.3  6e-09  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00697304  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2996  AAA ATPase, central region  30.17 
 
 
478 aa  64.3  6e-09  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2559  AAA ATPase  28.23 
 
 
444 aa  63.9  7e-09  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  4.94228e-06 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1120  AAA ATPase central domain protein  31.61 
 
 
711 aa  63.9  7e-09  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.986172  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1259  AAA ATPase central domain protein  31.36 
 
 
573 aa  63.9  8e-09  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.636785  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5257  AAA ATPase central domain protein  31.03 
 
 
749 aa  63.5  9e-09  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1822  ATPase central domain-containing protein  29.79 
 
 
622 aa  63.5  1e-08  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2009  AAA ATPase central domain protein  30.71 
 
 
1193 aa  63.2  1e-08  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3811  ATPase central domain-containing protein  28.02 
 
 
788 aa  63.5  1e-08  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0112  ATPase central domain-containing protein  33.08 
 
 
789 aa  62.8  2e-08  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.181464 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3168  ATPase central domain-containing protein  27.66 
 
 
434 aa  62.4  2e-08  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0578626  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4397  AAA ATPase central domain protein  32.86 
 
 
687 aa  62.4  2e-08  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1642  AAA-family ATPase  29.73 
 
 
308 aa  62.8  2e-08  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2258  AAA ATPase central domain protein  30.82 
 
 
680 aa  62.4  3e-08  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226213  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0172  ATPase central domain-containing protein  34.09 
 
 
387 aa  62.4  3e-08  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1893  AAA ATPase central domain protein  32.14 
 
 
698 aa  61.6  4e-08  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00103439  normal  0.0680609 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0240  ATPase central domain-containing protein  33.33 
 
 
753 aa  61.6  4e-08  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0025  AAA ATPase central domain protein  29.41 
 
 
443 aa  61.2  5e-08  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5393  AAA ATPase central domain protein  30.94 
 
 
682 aa  60.8  7e-08  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0827  AAA ATPase, central region  26.45 
 
 
697 aa  60.8  7e-08  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.934037  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2442  ATPase central domain-containing protein  32.91 
 
 
388 aa  60.5  9e-08  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1971  ATPase central domain-containing protein  34.53 
 
 
390 aa  59.7  1e-07  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.68669  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0938  ATPase central domain-containing protein  29.07 
 
 
671 aa  60.5  1e-07  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2297  AAA ATPase, central region  28.12 
 
 
228 aa  60.1  1e-07  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.754524 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0166  AAA ATPase, central region  30.87 
 
 
789 aa  59.3  2e-07  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3114  ATPase central domain-containing protein  34.35 
 
 
698 aa  58.9  3e-07  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.020083  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0401  ATPase, AAA family protein  24.18 
 
 
570 aa  58.9  3e-07  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1081  AAA ATPase, central region  31.65 
 
 
360 aa  58.9  3e-07  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0426  ATPase, AAA family protein  24.18 
 
 
570 aa  58.5  4e-07  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0291  AAA ATPase  25.34 
 
 
370 aa  58.5  4e-07  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00325104  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1579  ATPase, AAA family protein  24.03 
 
 
570 aa  58.2  4e-07  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3738  ATPase central domain-containing protein  31.65 
 
 
387 aa  57.8  6e-07  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0137  AAA ATPase central domain protein  27.08 
 
 
577 aa  57.4  7e-07  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00294  ATPase, AAA family protein  36.21 
 
 
676 aa  57.8  7e-07  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1140  ATPase central domain-containing protein  27.51 
 
 
372 aa  57.4  8e-07  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1549  ATPase, AAA family protein  23.16 
 
 
570 aa  56.6  1e-06  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.974713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>