More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0044 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0044  ABC transporter related  100 
 
 
253 aa  512  1e-144  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0268  ABC transporter related  38.89 
 
 
265 aa  201  8e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00395976  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  42.74 
 
 
255 aa  201  8e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0357  ABC transporter related  43.85 
 
 
261 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0857  ABC transporter related  43.08 
 
 
257 aa  201  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3102  ABC transporter related protein  42.17 
 
 
256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  41.5 
 
 
255 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  40.64 
 
 
255 aa  199  5e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0684  ABC transporter related protein  41.73 
 
 
255 aa  198  6e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.003005  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  41.02 
 
 
271 aa  198  7.999999999999999e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1864  ABC transporter related  38.15 
 
 
251 aa  198  7.999999999999999e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  40 
 
 
270 aa  198  7.999999999999999e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0935  ABC transporter related  42.4 
 
 
259 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000526687  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  41.18 
 
 
255 aa  196  3e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  39.37 
 
 
259 aa  196  3e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1864  ABC transporter related  41.8 
 
 
599 aa  194  8.000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3326  ABC transporter related  45.21 
 
 
291 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.407703 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  41.27 
 
 
255 aa  194  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1674  ABC transporter related  41.37 
 
 
251 aa  194  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3070  ABC transporter related  44.44 
 
 
291 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.958787  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2495  ABC transporter related protein  43.55 
 
 
271 aa  193  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.503368  normal  0.0315467 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2127  ABC transporter related  37.75 
 
 
250 aa  193  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  41.37 
 
 
256 aa  193  3e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  40.16 
 
 
257 aa  192  5e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0837  ABC transporter related  41.57 
 
 
255 aa  192  5e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0761  ABC transporter-related protein  38.43 
 
 
258 aa  192  6e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105936 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  38.89 
 
 
263 aa  191  7e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  39.76 
 
 
255 aa  191  1e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  38.96 
 
 
257 aa  190  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  41.73 
 
 
271 aa  190  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0890  ABC transporter related  43.82 
 
 
262 aa  190  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  42.75 
 
 
276 aa  190  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3819  ABC transporter related  41.83 
 
 
262 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0171499  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0475  ABC transporter related  42.19 
 
 
256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2268  ABC transporter related  44.35 
 
 
262 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.434627  decreased coverage  0.00162775 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3147  ABC transporter related  38.06 
 
 
307 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  40.47 
 
 
258 aa  189  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  40.16 
 
 
259 aa  189  5e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0402  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.13 
 
 
254 aa  189  5e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.869027  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0638  ABC transporter related protein  40.4 
 
 
260 aa  188  5.999999999999999e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0293111  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  41.27 
 
 
261 aa  188  7e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4755  ABC transporter related  39.2 
 
 
258 aa  188  8e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.96 
 
 
256 aa  187  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1820  ABC transporter-related protein  37.9 
 
 
250 aa  187  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0591  ABC transporter related  39.52 
 
 
258 aa  187  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.682257  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1506  ABC transporter related  42.4 
 
 
595 aa  187  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0407  ABC transporter-like protein  42.53 
 
 
273 aa  186  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1481  ABC transporter related  42.69 
 
 
259 aa  187  2e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0289  ABC transporter related  42.97 
 
 
612 aa  187  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92204  normal  0.8343 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0802  ABC transporter related  38.46 
 
 
588 aa  186  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1697  ABC transporter related  40.48 
 
 
593 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.777579  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3374  ABC transporter related  37.72 
 
 
302 aa  186  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  36.23 
 
 
284 aa  186  4e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2474  ABC transporter related  39.84 
 
 
257 aa  186  4e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1385  ABC transporter related  38.96 
 
 
256 aa  186  4e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3902  ABC transporter related  40.21 
 
 
308 aa  185  6e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6585  inner-membrane translocator  42.17 
 
 
611 aa  185  6e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  39.44 
 
 
283 aa  185  6e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3978  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  40.56 
 
 
254 aa  185  6e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.1221  decreased coverage  0.00203887 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2395  ABC transporter related  44.15 
 
 
295 aa  185  7e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00705338 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0908  inner-membrane translocator:ABC transporter related  43.5 
 
 
951 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0412388  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1426  ABC transporter related protein  41.37 
 
 
253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.259365  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1260  ABC transporter related  37.65 
 
 
256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2186  ABC transporter related protein  38.55 
 
 
250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6414  ABC transporter related  39.04 
 
 
258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.476451  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1877  ABC transporter-related protein  36.8 
 
 
260 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4332  ABC transporter related  41.57 
 
 
278 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.02881  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1290  ABC transporter related  36.76 
 
 
257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2103  ABC transporter related  36.76 
 
 
257 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4794  ABC transporter related  44.44 
 
 
259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.130359  normal  0.133792 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1125  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.45 
 
 
258 aa  183  3e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334087  normal  0.177035 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2251  ABC transporter related  44.62 
 
 
296 aa  182  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.876454  normal  0.416828 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2520  ABC transporter related  39.11 
 
 
258 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5827  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  38.71 
 
 
258 aa  182  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.467339  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  39.11 
 
 
258 aa  182  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1884  ABC transporter related  39.11 
 
 
258 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2495  ABC transporter related  39.11 
 
 
258 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1673  ABC transporter related  36.59 
 
 
284 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0064  ABC transporter related  42.21 
 
 
265 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.220859 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3325  ABC transporter related  40.97 
 
 
354 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.268059  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3658  ABC transporter related  39.76 
 
 
254 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0824  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  38.71 
 
 
257 aa  182  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.381559  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4306  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.47 
 
 
255 aa  182  6e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  38.19 
 
 
275 aa  181  7e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  38.19 
 
 
275 aa  181  7e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  38.19 
 
 
275 aa  181  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1406  ABC transporter related  42.51 
 
 
254 aa  181  8.000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.260319  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  38.74 
 
 
264 aa  181  8.000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  38.65 
 
 
293 aa  181  8.000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2316  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.86 
 
 
261 aa  181  9.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2168  ABC transporter related  41.7 
 
 
274 aa  181  9.000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3796  ABC transporter related  37.85 
 
 
265 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.477228  normal  0.17284 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  42 
 
 
268 aa  181  1e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3142  ABC transporter related  38.31 
 
 
257 aa  181  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0168533  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2710  ABC transporter related  36.86 
 
 
260 aa  181  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.868345  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0694  inner-membrane translocator, ABC transporter related  41.46 
 
 
583 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0267  ABC transporter related  38 
 
 
598 aa  181  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.59454  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3771  ABC transporter related protein  39.22 
 
 
294 aa  181  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.417118  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3362  ABC transporter related  36.86 
 
 
260 aa  181  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.557965 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50550  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.09 
 
 
255 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.013767 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>