More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0038 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0038  sun protein  100 
 
 
471 aa  923  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.27971  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0031  Fmu (Sun) domain protein  56.82 
 
 
450 aa  459  1e-128  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0717  Fmu (Sun)  55.38 
 
 
450 aa  455  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.722352 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0197  Fmu (Sun)  55.23 
 
 
450 aa  446  1e-124  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0130363  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0325  putative ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  54.88 
 
 
450 aa  446  1e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235081  normal  0.145888 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0156  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  55.2 
 
 
450 aa  447  1e-124  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.400804  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0086  RNA methyltransferase  54.92 
 
 
450 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0025  Fmu (Sun)  55.33 
 
 
450 aa  441  1e-122  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1424  sun protein  52.64 
 
 
448 aa  414  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.204434 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2071  sun protein  51.99 
 
 
463 aa  411  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3418  Fmu (Sun)  49.89 
 
 
460 aa  390  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1747  sun protein  47.07 
 
 
465 aa  379  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1089  Fmu (Sun) domain-containing protein  48.55 
 
 
453 aa  379  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1814  sun protein  47.4 
 
 
465 aa  377  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.802421  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2963  Fmu (Sun) domain-containing protein  54.44 
 
 
447 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.270675  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1326  sun protein  54.02 
 
 
440 aa  366  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  5.16212e-10 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3191  Fmu (Sun) domain-containing protein  48.91 
 
 
470 aa  368  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.97576 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4295  Sun protein  49.1 
 
 
493 aa  365  1e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4242  Fmu (Sun) domain protein  49.33 
 
 
460 aa  362  6e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.198653 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3917  Fmu (Sun) domain protein  48.09 
 
 
462 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0687458  normal  0.615707 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0486  Fmu (Sun) domain protein  53.56 
 
 
454 aa  356  5e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0551  Fmu (Sun) domain-containing protein  53.73 
 
 
425 aa  349  5e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1027  Fmu (Sun) domain-containing protein  53.53 
 
 
459 aa  347  4e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537768  normal  0.0363239 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0522  Fmu (Sun) domain protein  52.86 
 
 
438 aa  342  6e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0621766  normal  0.207218 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5220  sun protein  53.78 
 
 
448 aa  342  8e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.02946  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3660  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  51.17 
 
 
438 aa  338  1e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.469225  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0072  putative ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  44.25 
 
 
456 aa  338  1e-91  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  1.55418e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4779  Fmu (Sun) domain-containing protein  47.81 
 
 
426 aa  325  1e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.849075  normal  0.940845 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2924  Fmu (Sun) domain-containing protein  47.51 
 
 
433 aa  300  3e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2720  Fmu (Sun) domain-containing protein  47.92 
 
 
535 aa  274  2e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  0.796536 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2765  Fmu (Sun) domain-containing protein  45.07 
 
 
410 aa  274  3e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3033  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  44.84 
 
 
443 aa  274  3e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.455858 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0627  Fmu (Sun) domain protein  46.49 
 
 
438 aa  272  1e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.114528 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2926  Fmu (Sun) domain-containing protein  44.24 
 
 
422 aa  268  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.351382  normal  0.0315958 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4040  Fmu (Sun)  43.44 
 
 
410 aa  266  5e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1940  Fmu (Sun) domain-containing protein  44.93 
 
 
422 aa  261  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2654  Fmu (Sun) domain-containing protein  51.33 
 
 
415 aa  254  3e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.105855  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0089  Fmu (Sun)  43.19 
 
 
424 aa  252  1e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3096  Fmu (Sun)  42.79 
 
 
419 aa  246  7e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1047  Fmu (Sun)  42.46 
 
 
437 aa  233  5e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.334338  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3668  sun protein  35.5 
 
 
452 aa  224  2e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6147  rRNA methyltransferase RsmB-like  41.55 
 
 
421 aa  224  3e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0080  sun protein  34.08 
 
 
436 aa  215  1e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0033  sun protein  35.62 
 
 
426 aa  213  5e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0617271 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  34.63 
 
 
443 aa  209  7e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  33.84 
 
 
449 aa  209  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  33.11 
 
 
446 aa  206  7e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0016  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  38.81 
 
 
418 aa  206  9e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.398476  normal  0.248834 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0022  sun protein  34.16 
 
 
427 aa  206  1e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0022  sun protein  34.17 
 
 
428 aa  203  5e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00020  16S rRNA m(5)C 967 methyltransferase  33.86 
 
 
439 aa  202  8e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0039  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  32.75 
 
 
462 aa  202  1e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3605  16S rRNA methyltransferase B  37.95 
 
 
429 aa  202  1e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.44092 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3775  16S rRNA methyltransferase B  37.69 
 
 
429 aa  202  1e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0036  sun protein  35.01 
 
 
425 aa  201  2e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0437  16S rRNA methyltransferase B  35.15 
 
 
431 aa  201  3e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0652  sun protein  33.04 
 
 
451 aa  200  6e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00393  cytosine-C5-methylase  35.63 
 
 
427 aa  199  6e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0015  sun protein  33.65 
 
 
462 aa  199  9e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0800124 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3604  16S rRNA methyltransferase B  37.44 
 
 
429 aa  199  1e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.946908  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3712  16S rRNA methyltransferase B  37.44 
 
 
429 aa  199  1e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.199091 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0041  sun protein  34.67 
 
 
427 aa  199  1e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002055  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  35.48 
 
 
427 aa  199  1e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.881444  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0179  sun protein  37.77 
 
 
448 aa  198  2e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3677  16S rRNA methyltransferase B  37.44 
 
 
429 aa  198  2e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3405  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  37.8 
 
 
457 aa  198  2e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3720  16S rRNA methyltransferase B  35.35 
 
 
428 aa  197  4e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.773777  hitchhiker  0.0077943 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3139  sun protein  38.46 
 
 
463 aa  197  4e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.670033 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3738  sun protein  34.32 
 
 
427 aa  196  5e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223417 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0672  sun protein  33.04 
 
 
451 aa  196  6e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0363723  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2321  sun protein  38.15 
 
 
429 aa  196  7e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0104634  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  30.84 
 
 
443 aa  195  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3123  sun protein  38.52 
 
 
463 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.615938  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0085  sun protein  37.27 
 
 
436 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273968  hitchhiker  1.36476e-07 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2509  sun protein  38.52 
 
 
463 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.79792  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0053  sun protein  36.98 
 
 
437 aa  195  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2475  sun protein  35.35 
 
 
434 aa  194  3e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0018  sun protein  33.11 
 
 
440 aa  194  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0066  sun protein  37.5 
 
 
436 aa  193  5e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  5.06957e-07 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0029  sun protein  34.16 
 
 
426 aa  193  5e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0082  sun protein  37.5 
 
 
436 aa  193  7e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.254701 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0073  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  36.57 
 
 
444 aa  192  9e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  36.24 
 
 
448 aa  192  9e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0022  sun protein  33.11 
 
 
429 aa  191  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2845  sun protein  37.68 
 
 
431 aa  191  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.677129  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  35.1 
 
 
451 aa  191  2e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2271  sun protein  37.88 
 
 
451 aa  191  2e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00558383 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3061  sun protein  36.87 
 
 
462 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4513  16S rRNA methyltransferase B  36.15 
 
 
429 aa  191  3e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0528453  hitchhiker  4.68931e-05 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2869  sun protein  38.76 
 
 
433 aa  190  4e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3771  16S rRNA methyltransferase B  35.64 
 
 
429 aa  190  5e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.075284  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3584  16S rRNA methyltransferase B  35.64 
 
 
429 aa  190  5e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.287379  normal  0.154829 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0030  sun protein  33.79 
 
 
428 aa  190  6e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0425  sun protein  35.38 
 
 
429 aa  189  8e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3482  16S rRNA methyltransferase B  35.38 
 
 
429 aa  189  8e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066221  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03139  16S rRNA m5C967 methyltransferase, S-adenosyl-L-methionine-dependent  35.38 
 
 
429 aa  189  8e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0425  16S rRNA methyltransferase B  35.38 
 
 
429 aa  189  8e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.53016  hitchhiker  0.000468253 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03090  hypothetical protein  35.38 
 
 
429 aa  189  8e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0019  Sun protein  32.18 
 
 
445 aa  189  9e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3562  sun protein  36.97 
 
 
457 aa  189  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>