More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0037 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_4774  adenylosuccinate synthetase  74.71 
 
 
430 aa  679  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114501  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2965  adenylosuccinate synthetase  75.41 
 
 
430 aa  687  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.125391  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3544  adenylosuccinate synthetase  74.01 
 
 
432 aa  658  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3159  adenylosuccinate synthetase  72.39 
 
 
432 aa  657  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7581  adenylosuccinate synthetase  75.58 
 
 
430 aa  669  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0962  Adenylosuccinate synthase  73.02 
 
 
430 aa  649  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.470264  normal  0.45689 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1007  Adenylosuccinate synthase  73.95 
 
 
431 aa  658  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0196756 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1231  adenylosuccinate synthetase  72.33 
 
 
429 aa  651  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0940  Adenylosuccinate synthase  73.02 
 
 
430 aa  650  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3089  adenylosuccinate synthetase  72.85 
 
 
432 aa  656  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126084  normal  0.070043 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2144  adenylosuccinate synthase  71.63 
 
 
430 aa  637  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1330  adenylosuccinate synthetase  74.71 
 
 
430 aa  679  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.396862  normal  0.220841 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0037  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 
448 aa  897  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.505248  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0262  adenylosuccinate synthase  74.65 
 
 
431 aa  667  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1627  adenylosuccinate synthetase  71.63 
 
 
533 aa  652  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4086  adenylosuccinate synthetase  74.48 
 
 
430 aa  677  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0852587 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3346  adenylosuccinate synthetase  73.78 
 
 
432 aa  662  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.474516  hitchhiker  0.00582802 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0999  adenylosuccinate synthase  72.85 
 
 
448 aa  651  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.595096  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5638  adenylosuccinate synthase  76.28 
 
 
430 aa  693  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.171619  normal  0.25149 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1850  adenylosuccinate synthetase  74.01 
 
 
430 aa  675  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6845  adenylosuccinate synthase  75.58 
 
 
430 aa  670  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1123  adenylosuccinate synthetase  76.16 
 
 
457 aa  694  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565795  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1683  adenylosuccinate synthetase  71.63 
 
 
429 aa  648  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.469628  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2616  adenylosuccinate synthetase  73.09 
 
 
432 aa  654  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199466  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3894  adenylosuccinate synthetase  74.25 
 
 
430 aa  674  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.108834  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2010  adenylosuccinate synthetase  71.16 
 
 
430 aa  625  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.34638  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1106  adenylosuccinate synthetase  72.03 
 
 
429 aa  627  1e-178  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0875  adenylosuccinate synthetase  71.4 
 
 
430 aa  625  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0366  adenylosuccinate synthetase  71.4 
 
 
430 aa  625  1e-178  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2742  adenylosuccinate synthetase  70.63 
 
 
431 aa  623  1e-177  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0436902 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1969  adenylosuccinate synthetase  69.2 
 
 
437 aa  618  1e-176  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.769944  normal  0.0974254 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0603  adenylosuccinate synthetase  69.23 
 
 
430 aa  615  1e-175  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3179  adenylosuccinate synthetase  69 
 
 
431 aa  612  1e-174  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0558  adenylosuccinate synthetase  69.14 
 
 
429 aa  612  1e-174  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00595695 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0285  adenylosuccinate synthetase  67.37 
 
 
429 aa  607  1e-172  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4682  adenylosuccinate synthetase  67.83 
 
 
429 aa  599  1e-170  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0658  adenylosuccinate synthetase  69.3 
 
 
428 aa  597  1e-169  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.163412  normal  0.505489 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0510  adenylosuccinate synthetase  66.28 
 
 
429 aa  581  1e-165  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.37093  normal  0.446838 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0475  adenylosuccinate synthetase  67.44 
 
 
429 aa  580  1e-164  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.636476  hitchhiker  0.00197029 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2683  adenylosuccinate synthetase  66.2 
 
 
429 aa  581  1e-164  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2784  adenylosuccinate synthetase  64.8 
 
 
429 aa  558  1e-158  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.436445  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0564  adenylosuccinate synthetase  52.56 
 
 
431 aa  501  1e-141  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1523  adenylosuccinate synthetase  55.76 
 
 
442 aa  499  1e-140  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  1.40547e-05  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0337  adenylosuccinate synthetase  54.85 
 
 
425 aa  496  1e-139  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.112659  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0461  adenylosuccinate synthetase  52.56 
 
 
430 aa  491  1e-138  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6199  adenylosuccinate synthase  59.03 
 
 
453 aa  488  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0247215 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5832  adenylosuccinate synthase  59.44 
 
 
432 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6675  adenylosuccinate synthase  59.44 
 
 
432 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.250077 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5997  adenylosuccinate synthase  58.88 
 
 
429 aa  481  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.140056  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5753  adenylosuccinate synthase  58.88 
 
 
429 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.590489 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6526  adenylosuccinate synthetase  58.74 
 
 
432 aa  484  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.768523 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2007  adenylosuccinate synthetase  56.31 
 
 
431 aa  472  1e-132  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00017376  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1978  adenylosuccinate synthetase  55.81 
 
 
432 aa  472  1e-132  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3379  adenylosuccinate synthetase  55.99 
 
 
436 aa  473  1e-132  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5326  adenylosuccinate synthase  58.97 
 
 
432 aa  473  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0668634 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2974  adenylosuccinate synthetase  54.27 
 
 
435 aa  469  1e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0607  adenylosuccinate synthetase  53.92 
 
 
432 aa  468  1e-130  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.272974 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0676  adenylosuccinate synthetase  51.69 
 
 
446 aa  462  1e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.678663  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2661  adenylosuccinate synthetase  53.85 
 
 
431 aa  462  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5009  adenylosuccinate synthetase  53.44 
 
 
458 aa  461  1e-128  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.470264  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0578  adenylosuccinate synthetase  55.12 
 
 
432 aa  460  1e-128  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.206e-11 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1434  adenylosuccinate synthetase  52.97 
 
 
459 aa  460  1e-128  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.104272  normal  0.451204 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1281  adenylosuccinate synthetase  52.17 
 
 
446 aa  460  1e-128  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0903  Adenylosuccinate synthase  55.5 
 
 
430 aa  460  1e-128  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.546302  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5667  adenylosuccinate synthetase  54.21 
 
 
430 aa  456  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3793  adenylosuccinate synthetase  53.6 
 
 
432 aa  455  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4680  adenylosuccinate synthetase  53.97 
 
 
430 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3648  adenylosuccinate synthetase  53.36 
 
 
432 aa  455  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0694  adenylosuccinate synthetase  53.6 
 
 
432 aa  455  1e-127  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07600  Adenylosuccinate synthetase  53.27 
 
 
430 aa  458  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1583  adenylosuccinate synthetase  53.2 
 
 
440 aa  456  1e-127  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.147694  unclonable  2.27018e-07 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65230  adenylosuccinate synthetase  53.97 
 
 
430 aa  455  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4889  adenylosuccinate synthetase  53.5 
 
 
430 aa  453  1e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0250802  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4941  adenylosuccinate synthetase  53.5 
 
 
430 aa  453  1e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00348011 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0436  adenylosuccinate synthetase  53.83 
 
 
432 aa  454  1e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  unclonable  4.72279e-08 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4765  adenylosuccinate synthetase  53.5 
 
 
430 aa  453  1e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1282  adenylosuccinate synthetase  54.55 
 
 
431 aa  452  1e-126  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2180  adenylosuccinate synthetase  53.36 
 
 
432 aa  453  1e-126  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.34883e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0641  adenylosuccinate synthetase  53.38 
 
 
431 aa  449  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143682 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1985  adenylosuccinate synthetase  53.55 
 
 
444 aa  449  1e-125  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133256  normal  0.151418 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1181  adenylosuccinate synthetase  52.11 
 
 
458 aa  450  1e-125  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.4333 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1939  adenylosuccinate synthetase  52.93 
 
 
431 aa  449  1e-125  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0176  adenylosuccinate synthetase  51.18 
 
 
427 aa  449  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1101  adenylosuccinate synthetase  52.33 
 
 
458 aa  451  1e-125  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.415884  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0577  adenylosuccinate synthetase  53.5 
 
 
430 aa  451  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0540  adenylosuccinate synthetase  53.13 
 
 
432 aa  449  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.311763  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4937  adenylosuccinate synthetase  53.27 
 
 
430 aa  450  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0497  adenylosuccinate synthetase  52.44 
 
 
432 aa  449  1e-125  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0330  adenylosuccinate synthetase  53.85 
 
 
431 aa  451  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  52.45 
 
 
430 aa  449  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2772  adenylosuccinate synthetase  52.98 
 
 
438 aa  450  1e-125  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0735  adenylosuccinate synthetase  53.72 
 
 
431 aa  445  1e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000671232  hitchhiker  0.000922598 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2198  adenylosuccinate synthetase  52.52 
 
 
443 aa  447  1e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3592  adenylosuccinate synthetase  53.26 
 
 
431 aa  445  1e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  8.97035e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0750  adenylosuccinate synthetase  53.49 
 
 
431 aa  447  1e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  6.82785e-07  hitchhiker  0.00737735 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3162  adenylosuccinate synthetase  52.11 
 
 
458 aa  446  1e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2029  adenylosuccinate synthetase  50.93 
 
 
429 aa  445  1e-124  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00381049  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0528  adenylosuccinate synthetase  53.97 
 
 
429 aa  447  1e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650318  normal  0.308275 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0705  adenylosuccinate synthetase  53.72 
 
 
431 aa  445  1e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00343177  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3716  adenylosuccinate synthetase  53.13 
 
 
432 aa  448  1e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316289  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>