More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0035 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0209  DNA mismatch repair protein MutS  56.32 
 
 
877 aa  885  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.784326 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0047  DNA mismatch repair protein MutS  60.51 
 
 
908 aa  1010  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.967716  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7642  DNA mismatch repair protein MutS  61.39 
 
 
910 aa  1055  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.532158 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1218  DNA mismatch repair protein MutS  58.76 
 
 
875 aa  901  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.318661  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0142  DNA mismatch repair protein MutS  59.13 
 
 
898 aa  1015  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2761  DNA mismatch repair protein MutS  52.08 
 
 
904 aa  759  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572948  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0614  DNA mismatch repair protein MutS  63.17 
 
 
907 aa  1088  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0490  DNA mismatch repair protein MutS  64.34 
 
 
888 aa  1076  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0032  DNA mismatch repair protein MutS  60.88 
 
 
880 aa  1009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2879  DNA mismatch repair protein MutS  58.76 
 
 
880 aa  900  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0260  DNA mismatch repair protein MutS  42.39 
 
 
804 aa  704  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.76262  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0913  DNA mismatch repair protein MutS  50.39 
 
 
882 aa  676  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0321  DNA mismatch repair protein MutS  62.45 
 
 
923 aa  1064  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.784021  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0008  DNA mismatch repair protein MutS  53.57 
 
 
904 aa  842  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0824  DNA mismatch repair protein MutS  42.48 
 
 
804 aa  703  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4649  DNA mismatch repair protein MutS  61.14 
 
 
916 aa  974  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.427089 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3293  DNA mismatch repair protein MutS  52.32 
 
 
858 aa  763  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0310827  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0621  DNA mismatch repair protein MutS  61.44 
 
 
905 aa  943  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.720679  normal  0.722964 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2655  DNA mismatch repair protein MutS  58.31 
 
 
876 aa  891  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.607224  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0363  DNA mismatch repair protein MutS  63.22 
 
 
882 aa  1073  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3541  DNA mismatch repair protein MutS  57.57 
 
 
929 aa  879  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7101  DNA mismatch repair protein MutS  62.54 
 
 
929 aa  947  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743761  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0423  DNA mismatch repair protein MutS  60.05 
 
 
883 aa  1014  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2326  DNA mismatch repair protein MutS  58.12 
 
 
925 aa  921  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.160487 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0299  DNA mismatch repair protein MutS  51.63 
 
 
873 aa  719  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.391446  normal  0.153174 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2791  DNA mismatch repair protein MutS  52.04 
 
 
864 aa  766  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.494407 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0030  DNA mismatch repair protein MutS  60.74 
 
 
915 aa  982  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  3.55609e-05 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3021  DNA mismatch repair protein MutS  54.96 
 
 
897 aa  838  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0190  DNA mismatch repair protein MutS  44.27 
 
 
820 aa  722  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1299  DNA mismatch repair protein MutS  54.12 
 
 
914 aa  970  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.141225  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4799  DNA mismatch repair protein MutS  61.43 
 
 
896 aa  965  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.720607 
 
 
-
 
NC_004310  BR0147  DNA mismatch repair protein MutS  59.13 
 
 
910 aa  1014  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3599  DNA mismatch repair protein MutS  58.46 
 
 
908 aa  947  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0035  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 
921 aa  1801  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.892203 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  44.1 
 
 
868 aa  652  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  1.77149e-05  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0513  DNA mismatch repair protein MutS  63.16 
 
 
907 aa  1068  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0827  DNA mismatch repair protein MutS  57.63 
 
 
878 aa  895  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.133627  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0528  DNA mismatch repair protein MutS  63.43 
 
 
911 aa  1060  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0799066  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2875  DNA mismatch repair protein MutS  55.68 
 
 
879 aa  897  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.928835 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1263  DNA mismatch repair protein MutS  56.08 
 
 
919 aa  925  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0902404 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4031  DNA mismatch repair protein MutS  60.45 
 
 
881 aa  996  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137829  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3466  DNA mismatch repair protein MutS  57.09 
 
 
877 aa  888  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4282  DNA mismatch repair protein MutS  61.37 
 
 
916 aa  971  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0159  DNA mismatch repair protein MutS  58.7 
 
 
910 aa  1011  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6533  DNA mismatch repair protein MutS  61.38 
 
 
962 aa  966  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948742  normal  0.317969 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0335  DNA mismatch repair protein MutS  41.95 
 
 
815 aa  630  1e-179  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.213975  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3341  DNA mismatch repair protein MutS  42.37 
 
 
858 aa  614  1e-174  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.285192  unclonable  4.11572e-08 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  42.43 
 
 
872 aa  615  1e-174  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  1.38373e-07  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  41.85 
 
 
880 aa  609  1e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1299  DNA mismatch repair protein MutS  41.24 
 
 
859 aa  605  1e-172  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.537227  hitchhiker  4.08163e-09 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  43.66 
 
 
878 aa  608  1e-172  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  42.4 
 
 
871 aa  605  1e-172  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  41.06 
 
 
861 aa  604  1e-171  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  41.71 
 
 
855 aa  604  1e-171  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  40.98 
 
 
870 aa  604  1e-171  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.01093e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  40.72 
 
 
859 aa  603  1e-171  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0834  DNA mismatch repair protein MutS  42.76 
 
 
884 aa  602  1e-170  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0978  DNA mismatch repair protein MutS  42.76 
 
 
884 aa  602  1e-170  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  42.31 
 
 
854 aa  600  1e-170  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  42.05 
 
 
863 aa  595  1e-169  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  39.4 
 
 
869 aa  597  1e-169  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  3.95311e-05 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  40.47 
 
 
872 aa  598  1e-169  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  37.93 
 
 
870 aa  596  1e-169  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  39.64 
 
 
856 aa  597  1e-169  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  42.37 
 
 
891 aa  598  1e-169  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1282  DNA mismatch repair protein MutS  44.8 
 
 
862 aa  594  1e-168  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1207  DNA mismatch repair protein MutS  40.67 
 
 
862 aa  593  1e-168  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3263  DNA mismatch repair protein MutS  38.92 
 
 
889 aa  591  1e-167  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0653  DNA mismatch repair protein MutS  41.29 
 
 
881 aa  592  1e-167  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  41.13 
 
 
861 aa  592  1e-167  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1166  DNA mismatch repair protein MutS  41.53 
 
 
863 aa  590  1e-167  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  40.72 
 
 
856 aa  590  1e-167  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1195  DNA mismatch repair protein MutS  40.9 
 
 
861 aa  588  1e-166  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3431  DNA mismatch repair protein MutS  41.06 
 
 
856 aa  587  1e-166  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  39.27 
 
 
875 aa  588  1e-166  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  40.62 
 
 
889 aa  587  1e-166  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  41.13 
 
 
861 aa  587  1e-166  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2247  DNA mismatch repair protein MutS  44.48 
 
 
882 aa  587  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136567  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  41.57 
 
 
882 aa  586  1e-166  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3751  DNA mismatch repair protein MutS  42.7 
 
 
855 aa  584  1e-165  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3270  DNA mismatch repair protein MutS  40.44 
 
 
856 aa  583  1e-165  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.820026  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1111  DNA mismatch repair protein MutS  41.35 
 
 
922 aa  583  1e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.88674  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1246  DNA mismatch repair protein MutS  40.5 
 
 
856 aa  584  1e-165  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  unclonable  8.30859e-12 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2957  DNA mismatch repair protein MutS  41.76 
 
 
854 aa  583  1e-165  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3142  DNA mismatch repair protein MutS  41.71 
 
 
852 aa  584  1e-165  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  39.15 
 
 
873 aa  584  1e-165  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  42.05 
 
 
869 aa  584  1e-165  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1146  DNA mismatch repair protein MutS  41.43 
 
 
858 aa  584  1e-165  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0005  DNA mismatch repair protein MutS  39.1 
 
 
856 aa  583  1e-165  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  40.51 
 
 
856 aa  583  1e-165  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0632  DNA mismatch repair protein MutS  40 
 
 
855 aa  582  1e-165  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0530533  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  41.92 
 
 
854 aa  583  1e-165  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0879  DNA mismatch repair protein MutS  38.32 
 
 
859 aa  579  1e-164  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1619  DNA mismatch repair protein MutS  42.92 
 
 
897 aa  581  1e-164  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.510747 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002517  DNA mismatch repair protein MutS  39.71 
 
 
853 aa  580  1e-164  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.919799  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  39.33 
 
 
859 aa  582  1e-164  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3734  DNA mismatch repair protein MutS  39.4 
 
 
883 aa  582  1e-164  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648477  decreased coverage  5.82755e-10 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3337  DNA mismatch repair protein MutS  42.16 
 
 
854 aa  581  1e-164  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  40.38 
 
 
856 aa  582  1e-164  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3424  DNA mismatch repair protein MutS  40.94 
 
 
851 aa  578  1e-163  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>