More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0034 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0034  heat shock protein HtpX  100 
 
 
317 aa  635  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3417  heat shock protein HtpX  68.77 
 
 
313 aa  425  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4635  heat shock protein HtpX  69.16 
 
 
316 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3918  heat shock protein HtpX  65.11 
 
 
320 aa  401  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.03163  normal  0.594481 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0189  heat shock protein HtpX  68.14 
 
 
307 aa  403  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.160092  normal  0.264945 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0237  heat shock protein HtpX  70.66 
 
 
307 aa  403  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4243  heat shock protein HtpX  65.11 
 
 
320 aa  399  1e-110  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0774  heat shock protein HtpX  67.71 
 
 
315 aa  400  1e-110  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4296  protease heat shock protein  64.83 
 
 
342 aa  386  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3192  heat shock protein HtpX  66.36 
 
 
319 aa  386  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.349199  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0855  heat shock protein HtpX  65.55 
 
 
324 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4692  heat shock protein HtpX  68.24 
 
 
310 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3579  heat shock protein HtpX  64.8 
 
 
293 aa  373  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.421936  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0071  heat shock protein HtpX  64.14 
 
 
343 aa  369  1e-101  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000193104  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1813  heat shock protein HtpX  60.19 
 
 
325 aa  363  2e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1746  heat shock protein HtpX  60.19 
 
 
325 aa  363  2e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1090  heat shock protein HtpX  61.18 
 
 
321 aa  362  4e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119741  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1327  peptidase M48 Ste24p  67.84 
 
 
287 aa  361  9e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.533301  hitchhiker  3.42604e-10 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1232  heat shock protein HtpX  61.51 
 
 
299 aa  350  2e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2923  heat shock protein HtpX  60 
 
 
298 aa  344  1e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2206  heat shock protein HtpX  57.41 
 
 
300 aa  340  1e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.116706  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0554  heat shock protein HtpX  57.41 
 
 
300 aa  340  2e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0131  M48 family peptidase  61.29 
 
 
285 aa  330  2e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1939  peptidase M48, Ste24p  63.6 
 
 
316 aa  330  2e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0285  M48 family peptidase  60.71 
 
 
283 aa  328  6e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.543465  normal  0.0172766 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3512  heat shock protein HtpX  60.19 
 
 
309 aa  327  2e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.465022  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0154  M48 family peptidase  60.93 
 
 
285 aa  327  2e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.438309  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2356  M48 family peptidase  60.93 
 
 
285 aa  327  2e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0145  M48 family peptidase  60.93 
 
 
285 aa  327  2e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0163  M48 family peptidase  60.93 
 
 
285 aa  327  2e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2802  M48 family peptidase  60.93 
 
 
285 aa  327  2e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0349  M48 family peptidase  60.93 
 
 
285 aa  327  2e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2278  M48 family peptidase  60.93 
 
 
285 aa  327  2e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564612  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0038  M48 family peptidase  59.5 
 
 
285 aa  325  4e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0185  M48 family peptidase  59.71 
 
 
279 aa  324  1e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166167 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3406  M48 family peptidase  60.85 
 
 
306 aa  322  4e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3096  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3179  M48 family peptidase  60.22 
 
 
285 aa  322  8e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3062  M48 family peptidase  60.22 
 
 
285 aa  322  8e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4413  M48 family peptidase  59.86 
 
 
296 aa  320  2e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.631317 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3121  M48 family peptidase  59.86 
 
 
285 aa  320  2e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.19734 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3140  M48 family peptidase  59.5 
 
 
285 aa  318  9e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.911826  normal  0.757645 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3124  M48 family peptidase  59.5 
 
 
285 aa  318  9e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.840919  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2510  M48 family peptidase  59.5 
 
 
285 aa  318  9e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6475  M48 family peptidase  59.14 
 
 
285 aa  317  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0312  M48 family peptidase  59.43 
 
 
285 aa  317  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632212  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3563  M48 family peptidase  61.21 
 
 
286 aa  314  1e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0023  M48 family peptidase  60.22 
 
 
280 aa  313  2e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0093  M48 family peptidase  60.65 
 
 
279 aa  313  3e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.500994  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0074  M48 family peptidase  61.29 
 
 
286 aa  309  4e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123585  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0694  peptidase M48, Ste24p  60.96 
 
 
292 aa  308  6e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264807  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3675  M48 family peptidase  60.57 
 
 
286 aa  308  9e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3352  M48 family peptidase  60.57 
 
 
286 aa  307  2e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1567  M48 family peptidase  57.3 
 
 
286 aa  290  2e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.601696  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1776  M48 family peptidase  52.92 
 
 
288 aa  290  3e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3569  peptidase M48, Ste24p  57.03 
 
 
285 aa  284  2e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  5.38861e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3243  peptidase M48, Ste24p  54.77 
 
 
282 aa  283  3e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  8.73344e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0889  HtpX-2 peptidase  53.87 
 
 
287 aa  280  2e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1819  peptidase M48 Ste24p  54.04 
 
 
283 aa  280  2e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0199  peptidase M48, Ste24p  54.48 
 
 
287 aa  279  5e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.535846  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0243  M48 family peptidase  53.19 
 
 
280 aa  278  9e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0244  M48 family peptidase  52.48 
 
 
280 aa  275  8e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1269  peptidase M48, Ste24p  50.71 
 
 
282 aa  274  2e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0144  HtpX-2 peptidase  52.84 
 
 
281 aa  273  3e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.824625 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1935  peptidase M48 Ste24p  55.59 
 
 
284 aa  270  2e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  1.18842e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2282  peptidase M48 Ste24p  55.94 
 
 
284 aa  269  4e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42182e-06 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0890  peptidase M48 Ste24p  52.04 
 
 
296 aa  269  6e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  2.09809e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0879  peptidase M48 Ste24p  51.11 
 
 
295 aa  268  8e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1612  peptidase M48 Ste24p  54.72 
 
 
280 aa  267  2e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.686402  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0554  peptidase M48 Ste24p  54.69 
 
 
285 aa  265  5e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  1.77743e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0969  peptidase M48 Ste24p  55.59 
 
 
280 aa  265  8e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.697815 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3280  peptidase M48 Ste24p  55.59 
 
 
280 aa  265  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.458589  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3358  peptidase M48 Ste24p  52.07 
 
 
297 aa  263  2e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  5.41499e-07  hitchhiker  0.000159799 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0856  M48 family peptidase  56.39 
 
 
287 aa  263  4e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000166966  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1145  peptidase M48, Ste24p  56.18 
 
 
285 aa  262  5e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.13626e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3260  peptidase M48 Ste24p  50.51 
 
 
294 aa  262  7e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.741815 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0368  peptidase M48 Ste24p  46.85 
 
 
282 aa  258  6e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  1.732e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4120  peptidase M48 Ste24p  49.65 
 
 
296 aa  258  8e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0421  peptidase M48, Ste24p  46.98 
 
 
279 aa  258  1e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  5.40856e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1156  HtpX-2 peptidase  55.26 
 
 
287 aa  256  3e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  1.34347e-15  normal  0.0135663 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3276  peptidase M48 Ste24p  48.06 
 
 
285 aa  255  6e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0502019  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1928  peptidase M48, Ste24p  50.94 
 
 
296 aa  254  2e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0879  M48 family peptidase  44.98 
 
 
288 aa  251  1e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.631833  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1982  peptidase M48, Ste24p  51.88 
 
 
294 aa  250  2e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.333894  normal  0.247951 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0946  peptidase M48 Ste24p  48.41 
 
 
285 aa  250  3e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.401164 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0233  peptidase M48 Ste24p  51.07 
 
 
281 aa  243  3e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.471539 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1082  HtpX-2 peptidase  51.53 
 
 
285 aa  239  4e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0750  peptidase M48, Ste24p  46.32 
 
 
286 aa  238  1e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0193162  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10573  heat shock protein HtpX  46.45 
 
 
286 aa  237  2e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1579  M48 family peptidase  44.98 
 
 
289 aa  235  6e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.988956  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0511  heat shock protein HtpX  44.33 
 
 
285 aa  235  9e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1397  heat shock protein HtpX  44.68 
 
 
285 aa  234  1e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.809815  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1274  peptidase M48, Ste24p  46.62 
 
 
279 aa  233  2e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1239  heat shock protein HtpX  44.24 
 
 
285 aa  233  4e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1445  peptidase M48  46.59 
 
 
289 aa  233  4e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2779  heat shock protein HtpX  45.04 
 
 
289 aa  232  6e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0145109 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0626  heat shock protein HtpX  44.64 
 
 
284 aa  232  7e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3384  peptidase M48 Ste24p  46.1 
 
 
283 aa  231  8e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1386  heat shock protein HtpX  43.88 
 
 
285 aa  232  8e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.759716  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0088  heat shock protein HtpX  46.42 
 
 
289 aa  231  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.565985  normal  0.068582 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1342  M48 family peptidase  47.39 
 
 
286 aa  230  2e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000392563  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>