79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0030 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0030  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  363  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal  0.937966 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5019  putative signal peptide  63.07 
 
 
179 aa  233  1e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00550365 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4385  hypothetical protein  66.3 
 
 
187 aa  231  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190463  normal  0.207076 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0195  hypothetical protein  69.68 
 
 
183 aa  218  5e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.32187 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5323  putative signal peptide  64.77 
 
 
179 aa  217  8e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.168368  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1790  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  61.88 
 
 
176 aa  206  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.859721  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1839  putative signal peptide  61.25 
 
 
176 aa  205  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2174  putative signal peptide  60.62 
 
 
176 aa  204  4e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.499891 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2381  MxaD gene product  53.41 
 
 
175 aa  173  1e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.1214  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3014  MxaD protein  55.13 
 
 
173 aa  168  5e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872014  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3114  MxaD protein  52.8 
 
 
178 aa  165  3e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2727  putative signal peptide  52.56 
 
 
177 aa  164  6e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.594423  normal  0.129354 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3046  MxaD protein  51.15 
 
 
181 aa  161  5e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0024  hypothetical protein  51.55 
 
 
183 aa  160  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8030  MxaD protein, putative  46.37 
 
 
177 aa  154  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.816578  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4200  MxaD protein, putative  44.32 
 
 
184 aa  146  1e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240812  normal  0.311145 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1840  hypothetical protein  45.66 
 
 
177 aa  139  2e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2175  hypothetical protein  43.93 
 
 
177 aa  135  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.286876  normal  0.507077 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4140  MxaD protein, putative  44.23 
 
 
176 aa  134  9e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809932  normal  0.962091 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1791  putative exported protein of unknown function  45.81 
 
 
178 aa  133  1e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.813923  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4622  MxaD protein, putative  43.59 
 
 
177 aa  132  2e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886356  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0851  hypothetical protein  50 
 
 
185 aa  132  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4508  MxaD protein, putative  43.59 
 
 
176 aa  132  4e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0789  MxaD protein, putative  40.46 
 
 
174 aa  127  8e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.28208  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1917  MxaD protein, putative  43.75 
 
 
176 aa  125  2e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.740927  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0481  MxaD protein, putative  42.86 
 
 
176 aa  123  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2125  MxaD gene product  44.3 
 
 
176 aa  112  2e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3003  MxaD protein, putative  33.71 
 
 
177 aa  103  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0105582  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1819  MxaD protein, putative  39.77 
 
 
195 aa  95.9  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2160  hypothetical protein  35.71 
 
 
181 aa  93.2  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2034  MxaD protein, putative  35.63 
 
 
167 aa  87.4  9e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1085  hypothetical protein  37.41 
 
 
161 aa  79  3e-14  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0939  hypothetical protein  32.39 
 
 
166 aa  78.6  4e-14  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2544  hypothetical protein  37.16 
 
 
157 aa  75.5  3e-13  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2419  MxaD protein  36.36 
 
 
168 aa  70.9  8e-12  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0515899  normal  0.905694 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1028  hypothetical protein  38.41 
 
 
157 aa  70.9  9e-12  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3117  hypothetical protein  36.81 
 
 
138 aa  70.9  1e-11  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3414  hypothetical protein  36.11 
 
 
138 aa  69.7  2e-11  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00102667  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5078  hypothetical protein  35.92 
 
 
138 aa  69.7  2e-11  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0127  hypothetical protein  33.9 
 
 
157 aa  69.3  2e-11  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  0.0306658 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4716  hypothetical protein  35.92 
 
 
138 aa  69.7  2e-11  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2543  hypothetical protein  34.69 
 
 
158 aa  69.7  2e-11  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3430  hypothetical protein  36.11 
 
 
138 aa  68.9  4e-11  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3464  hypothetical protein  36.11 
 
 
138 aa  68.9  4e-11  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.21504  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3211  hypothetical protein  36.11 
 
 
138 aa  68.9  4e-11  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3189  hypothetical protein  36.11 
 
 
138 aa  68.9  4e-11  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1831  XoxI  36.11 
 
 
138 aa  67.8  7e-11  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  3.6824e-06  normal  0.167338 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3521  hypothetical protein  33.57 
 
 
136 aa  67.4  1e-10  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396939  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3426  hypothetical protein  35.42 
 
 
138 aa  66.6  2e-10  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0586777  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4813  hypothetical protein  29.73 
 
 
145 aa  65.9  3e-10  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3442  hypothetical protein  36.3 
 
 
138 aa  65.9  3e-10  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3357  hypothetical protein  33.13 
 
 
164 aa  62  4e-09  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2028  hypothetical protein  35.56 
 
 
135 aa  61.6  6e-09  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6553  hypothetical protein  31.69 
 
 
138 aa  61.6  6e-09  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.476808 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6069  hypothetical protein  31.69 
 
 
138 aa  61.2  8e-09  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.724335 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5705  hypothetical protein  31.69 
 
 
138 aa  61.2  8e-09  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4812  hypothetical protein  23.38 
 
 
147 aa  57.4  1e-07  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2981  hypothetical protein  28.38 
 
 
149 aa  56.6  2e-07  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0938  hypothetical protein  26.4 
 
 
168 aa  54.3  8e-07  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.265623  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3994  hypothetical protein  28.47 
 
 
140 aa  54.3  1e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0672627  normal  0.158861 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2858  hypothetical protein  27.15 
 
 
142 aa  53.9  1e-06  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1841  Polyketide cyclase/dehydrase  33.11 
 
 
144 aa  52.8  3e-06  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.679614  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16740  hypothetical protein  28.86 
 
 
138 aa  52.4  4e-06  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0136684  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2463  hypothetical protein  27.89 
 
 
143 aa  49.3  3e-05  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00011136  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1659  MxaD protein  28.48 
 
 
162 aa  48.1  7e-05  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.332339  normal  0.0308895 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0519  hypothetical protein  27.97 
 
 
146 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0702  hypothetical protein  27.97 
 
 
146 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0756  hypothetical protein  27.97 
 
 
146 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.299244  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2105  hypothetical protein  27.97 
 
 
146 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2010  hypothetical protein  27.97 
 
 
146 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132855  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1657  hypothetical protein  27.97 
 
 
146 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.383566  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0592  hypothetical protein  27.97 
 
 
146 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0882  hypothetical protein  28.97 
 
 
146 aa  46.2  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.479556  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1581  hypothetical protein  28.66 
 
 
152 aa  45.4  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1029  hypothetical protein  27.27 
 
 
145 aa  43.5  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.870281  normal  0.0601496 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2238  hypothetical protein  31.52 
 
 
144 aa  43.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2761  hypothetical protein  27.27 
 
 
143 aa  42.7  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.264134  normal  0.221278 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2519  hypothetical protein  30 
 
 
145 aa  42  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.242712  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4793  hypothetical protein  26.14 
 
 
140 aa  41.6  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>