295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0025 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0025  ABC-2 type transporter  100 
 
 
290 aa  573  1e-163  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2186  ABC-2 type transporter  76.17 
 
 
297 aa  427  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.189047 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1802  ABC-2 type transporter  75.81 
 
 
293 aa  427  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.454939 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1851  ABC-2 type transporter  75.81 
 
 
297 aa  425  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.894723 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5312  ABC-2 type transporter  76.1 
 
 
292 aa  424  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.91396  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5008  ABC-2 type transporter  75.37 
 
 
290 aa  419  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0701746  normal  0.113041 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2716  ABC-2 type transporter  74.11 
 
 
297 aa  415  1e-115  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.722099  normal  0.404026 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0010  ABC-2 type transporter  69.34 
 
 
280 aa  375  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2587  ABC multidrug efflux transporter, inner membrane subunit  67.72 
 
 
286 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0030  ABC-2 type transporter  73.33 
 
 
272 aa  372  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1245  ABC-2 type transporter  68.73 
 
 
292 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0464218  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0249  hypothetical protein  65.95 
 
 
281 aa  364  1e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5948  ABC transporter permease  65.05 
 
 
284 aa  361  8e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0673459  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1936  ABC-2 type transporter  69.08 
 
 
286 aa  361  1e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1281  ABC transporter, permease protein  65.89 
 
 
267 aa  332  3e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.640698  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3931  ABC-2 type transporter  62.55 
 
 
263 aa  326  4e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.284935  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0010  ABC-2 type transporter  62.83 
 
 
277 aa  323  2e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0265688  normal  0.974707 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2668  putative ABC-2 type transporter  61.15 
 
 
263 aa  310  3e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.149875  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2613  ABC-2 type transporter  56.7 
 
 
270 aa  299  4e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.937981  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2667  ABC transporter  63.14 
 
 
263 aa  298  6e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0137793  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1861  ABC-2 type transporter  58.3 
 
 
258 aa  298  9e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3096  ABC-2 type transporter  62.75 
 
 
263 aa  296  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3136  ABC-2 type transporter  62.35 
 
 
263 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1894  putative daunorubicin resistance ABC transporter, permease protein  58.96 
 
 
260 aa  288  7e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00976323  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2261  ABC-2 type transporter  58.37 
 
 
260 aa  288  9e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.121091  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1945  ABC-2 type transporter  60.84 
 
 
263 aa  278  7e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0850168  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2845  ABC-2 type transporter  57.2 
 
 
269 aa  276  2e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0354167  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1796  ABC-2 type transporter  55.12 
 
 
280 aa  239  3e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16393e-06 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3036  ABC-2 type transporter  53.41 
 
 
295 aa  239  4e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0723  ABC-2 type transporter  52.31 
 
 
272 aa  238  9e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0756908 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4979  ABC-2 type transporter  53.36 
 
 
274 aa  227  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2590  efflux ABC transporter, permease protein  51.99 
 
 
275 aa  199  5e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.717698  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  30.38 
 
 
284 aa  116  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  31.76 
 
 
270 aa  115  6e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  29.82 
 
 
264 aa  114  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2893  ABC-2 type transporter  30.77 
 
 
270 aa  112  9e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  30.56 
 
 
288 aa  111  2e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  30.66 
 
 
254 aa  110  2e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  32.71 
 
 
251 aa  107  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  29.17 
 
 
253 aa  100  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  28.31 
 
 
250 aa  99.8  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4739  ABC-2 type transporter  28.09 
 
 
285 aa  97.8  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  28.64 
 
 
281 aa  97.8  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0559  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  30.8 
 
 
264 aa  96.7  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.58 
 
 
249 aa  91.3  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.51 
 
 
249 aa  91.3  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  26.61 
 
 
254 aa  89.4  6e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0037  ABC-2 type transporter  28.19 
 
 
255 aa  89  9e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.51 
 
 
249 aa  88.2  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4031  ABC-2 type transporter  27.35 
 
 
289 aa  86.7  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.246164  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  25.43 
 
 
254 aa  86.3  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.61 
 
 
249 aa  85.9  8e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.3 
 
 
255 aa  85.9  8e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2499  ABC-2 transporter component  28.33 
 
 
276 aa  85.5  9e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  29.91 
 
 
249 aa  85.1  1e-15  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2221  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  26.34 
 
 
273 aa  85.1  1e-15  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000454003  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1125  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.58 
 
 
260 aa  85.1  1e-15  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.742933  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  28.95 
 
 
260 aa  85.1  1e-15  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  5.66487e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  27.06 
 
 
249 aa  84.3  2e-15  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  25.33 
 
 
256 aa  84  2e-15  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0215  ABC-2 type transporter  28.88 
 
 
275 aa  84  3e-15  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.716105  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  25.82 
 
 
290 aa  84  3e-15  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0242  ABC-2 type transporter  29.2 
 
 
278 aa  81.6  1e-14  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  28.5 
 
 
256 aa  80.5  3e-14  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0427  ABC-2 type transporter  29.73 
 
 
278 aa  80.1  4e-14  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.469533  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  23.5 
 
 
256 aa  79.3  6e-14  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  9.32687e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  23.96 
 
 
256 aa  79.3  7e-14  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0230  ABC-2 type transporter  28.45 
 
 
256 aa  79  8e-14  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.83 
 
 
253 aa  79  1e-13  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  28.02 
 
 
261 aa  78.2  2e-13  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  25 
 
 
251 aa  76.3  6e-13  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  24.49 
 
 
253 aa  75.1  1e-12  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  23.89 
 
 
253 aa  74.7  2e-12  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2171  ABC-2 type transporter  29.73 
 
 
256 aa  74.3  2e-12  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2328  transporter, putative  29.84 
 
 
246 aa  73.6  4e-12  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.117528  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  23.98 
 
 
253 aa  72.8  6e-12  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1034  ABC-2 type transporter  27.8 
 
 
256 aa  72.4  9e-12  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.150436 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  23.93 
 
 
289 aa  72.4  9e-12  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1789  ABC-2 type transporter  26.98 
 
 
261 aa  71.6  1e-11  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0380  ABC-2 type transporter  20.8 
 
 
280 aa  70.9  2e-11  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0685  ABC transporter, permease protein  26.77 
 
 
277 aa  71.2  2e-11  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.537478  normal  0.14182 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1766  multidrug ABC transporter, permease protein  27.31 
 
 
242 aa  69.7  5e-11  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2013  ABC-2 type transporter  26.91 
 
 
256 aa  70.1  5e-11  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  1.19274e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  25.69 
 
 
261 aa  69.3  7e-11  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  2.33601e-06  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  27.88 
 
 
257 aa  69.3  7e-11  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2515  ABC transporter, permease protein  27.93 
 
 
278 aa  68.9  9e-11  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1561  ABC-2 type transporter  25.11 
 
 
252 aa  68.2  1e-10  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.403911  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0251  ABC-2 type transporter  26.03 
 
 
255 aa  65.5  9e-10  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.452318 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0966  ABC-2 type transporter  26.03 
 
 
259 aa  65.5  1e-09  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0945  ABC transporter related  25.96 
 
 
665 aa  63.2  5e-09  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2794  hypothetical protein  22.61 
 
 
276 aa  61.6  1e-08  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0995371 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2056  ABC-2 type transporter  24.66 
 
 
241 aa  61.2  2e-08  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.794734  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3518  ABC-2 type transporter  27.57 
 
 
298 aa  60.8  3e-08  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2588  ABC-2 type transporter  27.57 
 
 
298 aa  60.8  3e-08  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3261  ABC-2 type transporter  24.53 
 
 
249 aa  60.5  3e-08  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3547  ABC-2 type transporter  28.63 
 
 
259 aa  60.1  4e-08  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.369986 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1342  ABC-2 type transporter  26.76 
 
 
279 aa  60.1  4e-08  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.333729  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1079  ABC-2 type transporter  27.63 
 
 
296 aa  60.1  4e-08  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4873  ABC-2 type transporter  25.59 
 
 
298 aa  59.7  6e-08  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  24.05 
 
 
293 aa  59.3  7e-08  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>