77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0021 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0021  hypothetical protein  100 
 
 
333 aa  642  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.873886  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3573  cell division protein  43.75 
 
 
337 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0668  hypothetical protein  46.38 
 
 
323 aa  241  1e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113157  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0577  hypothetical protein  46.05 
 
 
314 aa  241  1e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3866  cell division protein  43.89 
 
 
337 aa  239  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546597  normal  0.0832044 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2981  hypothetical protein  44.92 
 
 
322 aa  238  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1996  hypothetical protein  42.67 
 
 
333 aa  233  3e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1922  hypothetical protein  42.67 
 
 
333 aa  233  3e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4866  hypothetical protein  45.87 
 
 
323 aa  232  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21924  normal  0.378133 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0363  hypothetical protein  44.74 
 
 
343 aa  231  9e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.920625  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0944  hypothetical protein  48.18 
 
 
326 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5217  protein of unknown function DUF214  45.54 
 
 
328 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.339696  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4028  cell division protein  44.11 
 
 
316 aa  229  6e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0985  hypothetical protein  40.26 
 
 
347 aa  225  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2544  hypothetical protein  46.05 
 
 
339 aa  222  5e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1153  hypothetical protein  44.98 
 
 
317 aa  217  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.377262  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2517  protein of unknown function DUF214  44.56 
 
 
349 aa  215  7e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3090  hypothetical protein  42.86 
 
 
329 aa  215  8e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1177  cell division ABC transporter (membrane component)  43.38 
 
 
319 aa  215  9e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.54345 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0835  hypothetical protein  46.03 
 
 
327 aa  215  9e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.618544  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2194  hypothetical protein  51.27 
 
 
316 aa  209  4e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.265729  normal  0.707188 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3090  hypothetical protein  44.55 
 
 
326 aa  209  5e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.613654 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2864  hypothetical protein  44.55 
 
 
326 aa  209  5e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2984  protein of unknown function DUF214  44.52 
 
 
323 aa  204  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.620769  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0099  FtsX family protein  33.88 
 
 
324 aa  199  4e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1594  hypothetical protein  42.12 
 
 
327 aa  185  1e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.473332 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3255  hypothetical protein  34.74 
 
 
298 aa  140  2e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.97977  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0477  hypothetical protein  34.11 
 
 
300 aa  123  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3218  hypothetical protein  36.7 
 
 
297 aa  122  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.368988  normal  0.343443 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3499  hypothetical protein  36.17 
 
 
297 aa  119  5e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.770772 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0700  hypothetical protein  34.82 
 
 
311 aa  118  1e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3055  protein of unknown function DUF214  37.26 
 
 
297 aa  113  5e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2388  hypothetical protein  35.19 
 
 
300 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0734  cell division protein FtsX  35.19 
 
 
300 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2452  hypothetical protein  34.36 
 
 
300 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.123322  normal  0.165854 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2016  hypothetical protein  37.29 
 
 
309 aa  104  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.938763  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3083  hypothetical protein  33.07 
 
 
308 aa  92.4  8e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00150828  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3012  hypothetical protein  32.01 
 
 
303 aa  85.9  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752793  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2375  hypothetical protein  30.72 
 
 
301 aa  67.8  3e-10  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.202349 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3071  protein of unknown function DUF214  31.61 
 
 
345 aa  57  5e-07  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0933054  normal  0.0269654 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4782  cell division protein FtsX  28.96 
 
 
352 aa  57  5e-07  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3745  cell division protein FtsX  28.96 
 
 
352 aa  57  5e-07  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03264  hypothetical protein  28.96 
 
 
352 aa  57  5e-07  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0254  cell division protein FtsX  28.96 
 
 
352 aa  56.6  5e-07  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3860  cell division protein FtsX  28.96 
 
 
352 aa  56.6  5e-07  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2891  hypothetical protein  27.6 
 
 
301 aa  56.6  5e-07  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.650198  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03311  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  28.96 
 
 
352 aa  57  5e-07  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3661  cell division protein FtsX  28.96 
 
 
352 aa  57  5e-07  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3944  cell division protein FtsX  28.96 
 
 
352 aa  57  5e-07  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0253  protein insertion ABC transporter, inner membrane subunit FtsX  28.96 
 
 
352 aa  57  5e-07  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4063  cell division protein FtsX  25.83 
 
 
321 aa  56.6  6e-07  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3866  cell division protein FtsX  27.11 
 
 
351 aa  55.5  1e-06  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0223  cell division protein FtsX  27.27 
 
 
317 aa  55.5  1e-06  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0710231 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0101  cell division protein FtsX  25.41 
 
 
322 aa  54.3  3e-06  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.270699  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3977  cell division protein FtsX  24.24 
 
 
317 aa  53.9  4e-06  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.199267  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0241  cell division protein FtsX  24.24 
 
 
317 aa  53.9  4e-06  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.159478  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0579  cell division protein FtsX  24.24 
 
 
317 aa  53.9  4e-06  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00250347  normal  0.512774 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3761  cell division protein FtsX  26.98 
 
 
351 aa  53.1  7e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3838  cell division protein FtsX  26.98 
 
 
351 aa  52.8  9e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3940  cell division protein FtsX  26.98 
 
 
351 aa  52.8  9e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3771  cell division protein FtsX  26.98 
 
 
351 aa  52.8  9e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3881  cell division protein FtsX  26.98 
 
 
351 aa  52.8  9e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276809  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1995  protein of unknown function DUF214  27.61 
 
 
301 aa  52  1e-05  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.774133  normal  0.0157399 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3672  protein of unknown function DUF214  33.97 
 
 
315 aa  52  1e-05  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0095  cell division protein FtsX  25.74 
 
 
322 aa  51.6  2e-05  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3875  cell division protein FtsX  28.16 
 
 
323 aa  48.5  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.939193  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3607  cell division protein FtsX  22.8 
 
 
333 aa  48.5  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00806007  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0058  cell division protein FtsX  24.57 
 
 
316 aa  46.6  0.0005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.105068  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1553  cell division protein FtsX  24.72 
 
 
312 aa  46.2  0.0007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.119843  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1705  protein of unknown function DUF214  23.18 
 
 
290 aa  45.1  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.702845  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5109  hypothetical protein  26.09 
 
 
341 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2987  cell division protein FtsX  27.6 
 
 
330 aa  45.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.238508  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5159  hypothetical protein  25.6 
 
 
341 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2243  cell division protein  30.69 
 
 
312 aa  43.9  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.410507  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4982  hypothetical protein  26.09 
 
 
341 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2154  hypothetical protein  31.91 
 
 
312 aa  43.5  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.903191  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0245  cell division protein FtsX  24.88 
 
 
295 aa  42.7  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>