49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0020 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0020  hypothetical protein  100 
 
 
300 aa  594  1e-169  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.275341  normal  0.580582 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1152  protein of unknown function DUF218  50.51 
 
 
245 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.104953  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4865  hypothetical protein  46.84 
 
 
240 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.765936  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0578  hypothetical protein  48.17 
 
 
241 aa  191  1e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0669  hypothetical protein  49.17 
 
 
238 aa  189  4e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.126167  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1593  hypothetical protein  47.83 
 
 
208 aa  188  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.434005 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0945  hypothetical protein  45.16 
 
 
241 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.238786  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0836  hypothetical protein  46.81 
 
 
240 aa  184  2e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.891978  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1178  hypothetical protein  47.06 
 
 
221 aa  180  3e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.665154 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5216  protein of unknown function DUF218  42.13 
 
 
241 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3091  protein of unknown function DUF218  46.27 
 
 
234 aa  174  1e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.322539  normal  0.57374 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0986  hypothetical protein  40.51 
 
 
302 aa  171  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2982  hypothetical protein  45.69 
 
 
258 aa  170  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2865  hypothetical protein  45.77 
 
 
283 aa  169  6e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1921  hypothetical protein  40.98 
 
 
300 aa  167  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1995  hypothetical protein  40.98 
 
 
212 aa  166  4e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.368022  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2193  hypothetical protein  48.82 
 
 
245 aa  165  7e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123189  normal  0.691165 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2545  hypothetical protein  42.36 
 
 
232 aa  164  1e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3574  protein of unknown function DUF218  44.64 
 
 
238 aa  164  2e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0583825 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3867  protein of unknown function DUF218  43.11 
 
 
238 aa  162  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.420451  normal  0.0728404 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4029  hypothetical protein  44.62 
 
 
246 aa  162  8e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3089  hypothetical protein  43.89 
 
 
218 aa  155  5e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.99224  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2985  protein of unknown function DUF218  46.39 
 
 
234 aa  153  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208738  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3219  hypothetical protein  43.03 
 
 
207 aa  134  1e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.175029  normal  0.346292 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2376  hypothetical protein  37.7 
 
 
195 aa  127  3e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0665662 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0098  hypothetical protein  34.81 
 
 
202 aa  125  7e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3256  hypothetical protein  41.89 
 
 
226 aa  125  9e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.143218  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3082  hypothetical protein  39.66 
 
 
218 aa  102  9e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  3.8787e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3011  hypothetical protein  37.87 
 
 
177 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3070  protein of unknown function DUF218  40.34 
 
 
213 aa  98.2  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00556969  normal  0.0219592 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2890  hypothetical protein  38.38 
 
 
176 aa  97.4  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.743347  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0699  hypothetical protein  37.29 
 
 
182 aa  96.3  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.514208  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2281  protein of unknown function DUF218  35.09 
 
 
198 aa  91.3  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00040439  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2396  hypothetical protein  34.97 
 
 
198 aa  90.1  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  4.1288e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1055  protein of unknown function DUF218  30.98 
 
 
195 aa  89  8e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.73108e-09 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2322  hypothetical protein  31.19 
 
 
200 aa  88.2  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.78714e-15  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2233  hypothetical protein  32.98 
 
 
199 aa  89  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0295734  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3157  hypothetical protein  33.67 
 
 
199 aa  88.6  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  2.53328e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3208  protein of unknown function DUF218  30.89 
 
 
196 aa  83.2  4e-15  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  3.49402e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0467  hypothetical protein  28.97 
 
 
264 aa  63.9  3e-09  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3378  hypothetical protein  30.14 
 
 
206 aa  50.1  5e-05  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.620452  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3653  hypothetical protein  28.87 
 
 
191 aa  49.3  7e-05  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0369  Bme2 protein  29.56 
 
 
205 aa  47  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16316  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0426  Bme2 protein  28.93 
 
 
205 aa  45.8  0.0008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0911545  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0844  hypothetical protein  22.16 
 
 
219 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.527132  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2970  protein of unknown function DUF218  28.81 
 
 
211 aa  44.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.606259  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2653  protein of unknown function DUF218  31.01 
 
 
199 aa  43.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0732  hypothetical protein  27.65 
 
 
211 aa  42.7  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0764  hypothetical protein  31.58 
 
 
212 aa  42.4  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0330031 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>