111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0017 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0017  ChaC family protein  100 
 
 
212 aa  433  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.189731 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5214  ChaC family protein  63.01 
 
 
192 aa  213  1e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.608281  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0947  ChaC-like protein  62.07 
 
 
192 aa  211  9e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219888  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0580  ChaC-like protein  61.27 
 
 
194 aa  210  1e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4863  ChaC-like protein  61.82 
 
 
198 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0372933  normal  0.225643 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0838  ChaC-like protein  61.49 
 
 
192 aa  207  6e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1180  putative cation transport protein chaC-related  56.68 
 
 
196 aa  205  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0671  ChaC-like protein  60 
 
 
194 aa  204  9e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.85299  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3248  ChaC family protein  56.89 
 
 
181 aa  177  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0922711 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1586  ChaC family protein  52.44 
 
 
182 aa  176  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.672833 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4445  ChaC family protein  55.42 
 
 
181 aa  172  3e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.318121  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3560  ChaC family protein  52.63 
 
 
173 aa  170  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4031  transporter  50 
 
 
179 aa  163  1e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3576  ChaC family protein  48.24 
 
 
176 aa  162  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.017221 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3869  ChaC family protein  48.24 
 
 
176 aa  161  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.177325 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3535  ChaC family protein  55.09 
 
 
174 aa  160  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.025306 
 
 
-
 
NC_004310  BR1991  cation transport protein, putative  48.84 
 
 
186 aa  159  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1916  putative cation transport protein  48.84 
 
 
190 aa  159  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2547  ChaC family protein  48.02 
 
 
189 aa  157  8e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0990  ChaC family protein  47.98 
 
 
192 aa  154  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1406  ChaC family protein  47.09 
 
 
184 aa  149  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.190446  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3087  ChaC-like protein  50 
 
 
177 aa  148  6e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2942  putative cation transport protein  47.31 
 
 
180 aa  145  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0771654 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3223  ChaC family protein  46.2 
 
 
192 aa  144  9e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.770321  normal  0.203555 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3259  ChaC-like protein  47.31 
 
 
180 aa  143  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2776  ChaC-like protein  45.2 
 
 
258 aa  139  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2210  ChaC family protein  41.67 
 
 
182 aa  132  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.956018 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2287  ChaC-like protein  43.71 
 
 
182 aa  130  1e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.216291  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1038  ChaC-like protein  44.64 
 
 
180 aa  130  1e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0963  ChaC family protein  43.11 
 
 
182 aa  129  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.128703  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1612  ChaC family protein  43.68 
 
 
178 aa  119  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2030  ChaC family protein  41.1 
 
 
231 aa  115  4e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.625962  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2443  ChaC family protein  40.12 
 
 
252 aa  115  4e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.344458  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2801  ChaC family protein  41.07 
 
 
187 aa  115  5e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.356438  normal  0.415796 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5704  ChaC family protein  37.93 
 
 
225 aa  115  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.891612 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2097  ChaC-like protein  39.52 
 
 
175 aa  113  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.866958  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6012  ChaC family protein  39.88 
 
 
245 aa  112  4e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.296192  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0602  ChaC family protein  41.32 
 
 
210 aa  112  4e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0409  ChaC family protein  40.46 
 
 
219 aa  112  4e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.196689 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0993  ChaC family protein  40.85 
 
 
237 aa  112  5e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.321257  normal  0.796007 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3332  ChaC family protein  42.26 
 
 
245 aa  112  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.171445 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0627  putative ChaC-like protein  41.32 
 
 
237 aa  112  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3941  ChaC family protein  37.28 
 
 
208 aa  111  1e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0236923  normal  0.174216 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4923  ChaC-like protein  39.55 
 
 
247 aa  110  1e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1922  chaC protein  36.53 
 
 
231 aa  111  1e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.522557  normal  0.0428933 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2428  ChaC family protein  36.53 
 
 
238 aa  110  1e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.216984  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1368  chaC protein  36.53 
 
 
238 aa  110  1e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0977707  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1879  ChaC family protein  38.32 
 
 
197 aa  110  1e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.681402  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1179  ChaC family protein  39.43 
 
 
231 aa  110  2e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.984381 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2749  ChaC family protein  41.72 
 
 
210 aa  110  2e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0164562  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1050  ChaC family protein  40.72 
 
 
231 aa  110  2e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0448868 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2613  ChaC family protein  41.72 
 
 
205 aa  110  2e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.303262  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2056  ChaC family protein  37.72 
 
 
197 aa  109  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.013556  normal  0.320486 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0825  ChaC-like protein  37.57 
 
 
280 aa  109  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0341641  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5034  ChaC family protein  40.72 
 
 
216 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6024  ChaC-like protein  41.1 
 
 
210 aa  108  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12793  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2405  ChaC family protein  35.93 
 
 
238 aa  108  6e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  1.81734e-05 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1385  chaC protein  35.93 
 
 
238 aa  108  6e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1326  chaC protein  35.93 
 
 
238 aa  108  6e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.158462  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5272  ChaC family protein  41.32 
 
 
216 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5792  ChaC family protein  38.75 
 
 
263 aa  108  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000625495 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0304  ChaC-like protein  40.61 
 
 
222 aa  108  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.758482 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0222  ChaC-related protein  40.12 
 
 
210 aa  108  7e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2354  ChaC family protein  40.12 
 
 
210 aa  108  7e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0705  ChaC family protein  40.12 
 
 
210 aa  108  7e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.664903  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0720  ChaC family protein  40.12 
 
 
210 aa  108  7e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2434  ChaC family protein  40.12 
 
 
210 aa  108  7e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0886  hypothetical protein  40.12 
 
 
210 aa  108  7e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1264  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2724  ChaC family protein  40.12 
 
 
210 aa  108  7e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1701  chaC protein  35.93 
 
 
231 aa  108  8e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5239  ChaC-related protein  40.61 
 
 
222 aa  108  9e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5452  ChaC-like protein  39.39 
 
 
222 aa  107  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00716931 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0729  ChaC family protein  38.2 
 
 
249 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.740634  normal  0.753503 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0588  ChaC-related protein  39.52 
 
 
210 aa  107  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5120  ChaC family protein  41.07 
 
 
216 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1794  ChaC family protein  36.21 
 
 
224 aa  107  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0288596  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2084  ChaC-like protein  40.49 
 
 
210 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.704281  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2920  ChaC family protein  38.69 
 
 
242 aa  106  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.508921 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0799  ChaC family protein  39.88 
 
 
249 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496231  normal  0.444522 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2724  ChaC family protein  40.49 
 
 
210 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.516909  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2696  ChaC family protein  40.49 
 
 
210 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0640331  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2633  ChaC-like protein  34.33 
 
 
259 aa  105  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0613681  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01196  regulatory protein for cation transport  34.73 
 
 
238 aa  105  5e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01206  hypothetical protein  34.73 
 
 
238 aa  105  5e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0782  hypothetical protein  36.18 
 
 
248 aa  105  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.498186  normal  0.106018 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5351  ChaC family protein  35.98 
 
 
236 aa  105  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.755468  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5211  ChaC family protein  40.12 
 
 
185 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337451  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2926  uncharacterized protein involved in cation transport  36.53 
 
 
218 aa  103  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.426229  normal  0.932836 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3553  ChaC-like protein  38.1 
 
 
182 aa  103  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.148315  normal  0.245974 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0056  ChaC family protein  39.63 
 
 
247 aa  102  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.857973  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3710  ChaC family protein  35.71 
 
 
242 aa  101  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1758  ChaC family protein  34.52 
 
 
226 aa  101  9e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2265  ChaC family protein  33.91 
 
 
228 aa  101  9e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118123  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2988  ChaC family protein  36.05 
 
 
203 aa  100  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.213159  normal  0.132092 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2888  ChaC-like protein  34.94 
 
 
228 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.512939 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2330  ChaC family protein  33.33 
 
 
231 aa  99  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2571  ChaC family protein  32.18 
 
 
228 aa  97.4  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1214  ChaC family protein  40 
 
 
236 aa  96.7  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.296415  normal  0.688682 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2918  ChaC family protein  32.76 
 
 
246 aa  96.3  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1135  cation transporter  36.05 
 
 
172 aa  88.6  6e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.673266  normal  0.863519 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>