117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0015 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0015  amidohydrolase 3  100 
 
 
377 aa  744  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0974182 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0819  phosphonate metabolism protein PhnM  45.81 
 
 
380 aa  307  2e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.793377  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3334  amidohydrolase-like  43.08 
 
 
388 aa  303  3e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2257  amidohydrolase  44.74 
 
 
381 aa  303  3e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.208452  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2565  phosphonate metabolism protein PhnM  44.74 
 
 
381 aa  300  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3661  phosphonate metabolism protein PhnM  46.44 
 
 
379 aa  296  3e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.902619  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0860  PhnM protein  43.34 
 
 
379 aa  292  8e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0853  phosphonate metabolism protein PhnM  43.34 
 
 
379 aa  292  8e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2963  phosphonate metabolism protein PhnM  45.6 
 
 
386 aa  291  1e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.513647  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0826  phosphonate metabolism protein PhnM  46.18 
 
 
378 aa  289  5e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0583622  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2366  phosphonate metabolism protein PhnM  43.6 
 
 
379 aa  287  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2880  phosphonate metabolism protein PhnM  43.68 
 
 
381 aa  284  2e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1037  amidohydrolase  44.97 
 
 
380 aa  283  3e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6092  phosphonate metabolism protein PhnM  47 
 
 
385 aa  283  5e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1310  phosphonate metabolism protein PhnM  46.44 
 
 
379 aa  281  9e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.210169  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20430  phosphonate metabolism protein  45.6 
 
 
387 aa  282  9e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0119853  normal  0.758081 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2917  phosphonate metabolism protein PhnM  43.86 
 
 
383 aa  281  1e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0663819  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2189  phosphonate metabolism protein PhnM  42.82 
 
 
379 aa  280  4e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.300882  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2284  phnM protein, putative  43.16 
 
 
378 aa  279  6e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0628969  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1931  phosphonate metabolism protein PhnM  43.16 
 
 
378 aa  279  6e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.042135  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3779  phosphonate metabolism protein PhnM  44.47 
 
 
377 aa  278  8e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.714138  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1755  phosphonate metabolism protein PhnM  45.85 
 
 
387 aa  278  9e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.119299  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5946  phosphonate metabolism protein PhnM  43.7 
 
 
377 aa  276  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2688  phosphonate metabolism protein PhnM  43.19 
 
 
389 aa  274  2e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2185  putative phosphonate metabolism protein PhnM  43.09 
 
 
377 aa  270  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.377971  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4213  phosphonate metabolism protein PhnM  48.16 
 
 
378 aa  270  3e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.487252  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4421  phosphonate metabolism protein PhnM  45.57 
 
 
380 aa  269  6e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2908  phosphonate metabolism protein PhnM  48.68 
 
 
378 aa  267  3e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.579658  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2853  phosphonate metabolism PhnM  45.6 
 
 
434 aa  266  5e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3896  phosphonate metabolism protein PhnM  41.32 
 
 
378 aa  265  9e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03967  carbon-phosphorus lyase complex subunit  41.32 
 
 
378 aa  265  1e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5608  phosphonate metabolism protein PhnM  41.32 
 
 
378 aa  265  1e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3850  phosphonate metabolism protein PhnM  45.33 
 
 
378 aa  265  1e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.739872 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03927  hypothetical protein  41.32 
 
 
378 aa  265  1e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0299  phosphonate metabolism protein PhnM  41.42 
 
 
378 aa  264  2e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0893  phosphonate metabolism protein PhnM  41.84 
 
 
378 aa  264  2e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.291146  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4561  phosphonate metabolism protein PhnM  41.58 
 
 
378 aa  263  3e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4426  phosphonate metabolism protein PhnM  40.58 
 
 
374 aa  263  5e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4663  phosphonate metabolism protein PhnM  42.34 
 
 
379 aa  260  3e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00935004 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4336  phosphonate metabolism protein PhnM  41.05 
 
 
378 aa  260  3e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0756  phosphonate metabolism protein PhnM  42.56 
 
 
392 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2917  phosphonate metabolism protein PhnM  44.76 
 
 
373 aa  259  5e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3931  phosphonate metabolism protein PhnM  40.79 
 
 
378 aa  259  8e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4112  phosphonate metabolism protein PhnM  40.31 
 
 
374 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3883  phosphonate metabolism protein PhnM  41.67 
 
 
388 aa  256  4e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0287  phosphonate metabolism protein PhnM  41.13 
 
 
383 aa  256  5e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4649  phosphonate metabolism protein PhnM  40.79 
 
 
378 aa  255  7e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1314  phosphonate metabolism protein PhnM  41.05 
 
 
378 aa  254  1e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.350324  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0139  phosphonate metabolism PhnM  42.15 
 
 
380 aa  254  2e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.119407  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4025  PhnM protein  41.05 
 
 
378 aa  250  2e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0515  phosphonate metabolism protein PhnM  39.53 
 
 
378 aa  251  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3700  phosphonate metabolism protein PhnM  41.05 
 
 
378 aa  251  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4095  phosphonate metabolism PhnM  40.87 
 
 
384 aa  249  4e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0403567 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1280  phosphonate metabolism PhnM  41.36 
 
 
384 aa  249  4e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0119955  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5842  putative metal-dependent hydrolase involved in phosphonate metabolism  43.31 
 
 
385 aa  249  6e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3566  phosphonate metabolism protein PhnM  41.05 
 
 
378 aa  249  7e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2592  phosphonate metabolism protein PhnM  44.12 
 
 
377 aa  249  7e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1183  phosphonate metabolism protein PhnM  44.12 
 
 
377 aa  249  7e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2406  alkylphosphonate utilization operon protein PhnM  44.12 
 
 
377 aa  249  7e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.854839  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3305  phosphonate metabolism protein PhnM  44.12 
 
 
377 aa  249  7e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.853553  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3351  phosphonate metabolism protein PhnM  43.85 
 
 
377 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3339  phosphonate metabolism protein PhnM  43.85 
 
 
377 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3831  phosphonate metabolism PhnM  41.15 
 
 
384 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.597425  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0322  phosphonate metabolism protein PhnM  43.85 
 
 
377 aa  247  3e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3695  phosphonate metabolism PhnM  41.78 
 
 
380 aa  243  3e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.557897 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4774  phosphonate metabolism protein PhnM  42.38 
 
 
380 aa  237  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.807086  normal  0.597497 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0581  phosphonate metabolism protein PhnM  38.32 
 
 
378 aa  226  4e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0485  phosphonate metabolism protein PhnM  37.8 
 
 
378 aa  224  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2088  amidohydrolase-like  35.09 
 
 
387 aa  207  3e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5003  phosphonate metabolism protein PhnM  35.36 
 
 
382 aa  206  4e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.849449  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3686  phosphonate metabolism protein PhnM  34.29 
 
 
387 aa  191  1e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0223  amidohydrolase 3  35.62 
 
 
382 aa  192  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4043  amidohydrolase 3  35.62 
 
 
382 aa  192  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2290  amidohydrolase-like protein  34.9 
 
 
384 aa  188  1e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.533306  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0466  phosphonate metabolism protein  37.77 
 
 
399 aa  185  1e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.618772  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0430  phosphonate metabolism protein  37.77 
 
 
399 aa  185  1e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0233  amidohydrolase  33.7 
 
 
452 aa  174  3e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3506  amidohydrolase  36.41 
 
 
406 aa  172  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4192  amidohydrolase:amidohydrolase-like  33.67 
 
 
405 aa  165  1e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0760  amidohydrolase 3  34.2 
 
 
408 aa  162  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00298442  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2288  amidohydrolase 3  33.07 
 
 
410 aa  160  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4082  phosphonate metabolism PhnM  37.27 
 
 
397 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.123064  normal  0.0758016 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3818  phosphonate metabolism PhnM  36.81 
 
 
397 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00668671  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4150  amidohydrolase 3  33.07 
 
 
410 aa  159  6e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1093  phosphonate metabolism protein PhnM  34.99 
 
 
389 aa  153  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.255627  hitchhiker  0.00301436 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1239  phosphonate metabolism protein PhnM  34.53 
 
 
389 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.788895  hitchhiker  0.000230339 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0507  Amidohydrolase 3  36.93 
 
 
391 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.162002 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1585  phosphonate metabolism protein PhnM  35.73 
 
 
402 aa  151  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5860  putative metal-dependent hydrolase involved in phosphonate metabolism  35.49 
 
 
395 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.323528  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0770  phosphonate metabolism protein PhnM  35.01 
 
 
397 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0494  Amidohydrolase 3  35.69 
 
 
391 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.229543 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4184  amidohydrolase:amidohydrolase-like  36.73 
 
 
408 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.767243  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4434  phosphonate metabolism PhnM  34.86 
 
 
396 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3905  Amidohydrolase 3  29.76 
 
 
388 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.955259  normal  0.347183 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0768  amidohydrolase 3  37.01 
 
 
407 aa  137  3e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3856  Amidohydrolase 3  29.76 
 
 
388 aa  137  3e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2157  metal-dependent hydrolase  35.78 
 
 
589 aa  135  1e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3357  alkylphosphonate utilization protein PhnM, putative  35.59 
 
 
380 aa  134  4e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0602  amidohydrolase 3  33.61 
 
 
385 aa  123  5e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.188787  normal  0.301393 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2917  hypothetical protein  35.73 
 
 
385 aa  115  1e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.738577 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>