More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0005 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0005  inner-membrane translocator  100 
 
 
294 aa  565  1e-160  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.901395  hitchhiker  4.31174e-06 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1707  inner-membrane translocator  70.41 
 
 
294 aa  412  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.666506  normal  0.0117709 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0896  inner-membrane translocator  62.93 
 
 
295 aa  363  1e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5994  branched chain amino acid ABC transporter permease  40.55 
 
 
290 aa  220  2e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0717664 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1454  inner-membrane translocator  42.46 
 
 
288 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.566264  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1619  inner-membrane translocator  39.93 
 
 
290 aa  208  7e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.755467  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1581  inner-membrane translocator  38.54 
 
 
308 aa  204  2e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2425  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  42.11 
 
 
288 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.674149  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1438  inner-membrane translocator  41.75 
 
 
288 aa  203  3e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1533  inner-membrane translocator  41.75 
 
 
288 aa  202  6e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575934  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1928  inner-membrane translocator  40 
 
 
290 aa  201  9e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.45272  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0793  inner-membrane translocator  38.03 
 
 
290 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.806317  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3749  inner-membrane translocator  39.5 
 
 
295 aa  193  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1905  inner-membrane translocator  36.97 
 
 
290 aa  190  3e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.419507 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1563  inner-membrane translocator  40.56 
 
 
283 aa  189  6e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.27 
 
 
294 aa  189  6e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0336  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.27 
 
 
294 aa  189  7e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0313  inner-membrane translocator  35.46 
 
 
291 aa  186  5e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.477934 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3646  inner-membrane translocator  37.89 
 
 
287 aa  186  6e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.362219  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0862  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  37.23 
 
 
288 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0185519  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2006  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  39.16 
 
 
288 aa  178  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.766894  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1096  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.21 
 
 
287 aa  177  3e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1194  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.21 
 
 
287 aa  177  3e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.633758  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0142  inner-membrane translocator  38.87 
 
 
288 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1091  inner-membrane translocator  39.43 
 
 
325 aa  166  3e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0362  inner-membrane translocator  39.66 
 
 
296 aa  166  4e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1601  inner-membrane translocator  36.14 
 
 
287 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.549265  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5641  inner-membrane translocator  37.46 
 
 
289 aa  158  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  32.3 
 
 
300 aa  157  3e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1829  inner-membrane translocator  35.19 
 
 
289 aa  156  4e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  4.86818e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1139  inner-membrane translocator  34.39 
 
 
287 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2141  inner-membrane translocator  36.14 
 
 
292 aa  153  3e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.694846 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1501  inner-membrane translocator  35.31 
 
 
291 aa  152  8e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14327  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2366  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.77 
 
 
299 aa  151  1e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00045769  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0481  branched chain amino acid ABC transporter permease  31.47 
 
 
292 aa  151  1e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.53 
 
 
291 aa  148  1e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1892  branched-chain amino acid AbC-type transport system permease  31.42 
 
 
308 aa  147  2e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.339228  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2284  inner-membrane translocator  38.83 
 
 
285 aa  146  4e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4423  inner-membrane translocator  35.19 
 
 
288 aa  145  7e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.240774  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1099  inner-membrane translocator  33.11 
 
 
292 aa  145  7e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110891  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4442  inner-membrane translocator  36.86 
 
 
294 aa  145  7e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2534  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  34.88 
 
 
603 aa  145  7e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3936  inner-membrane translocator  34.88 
 
 
603 aa  145  8e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240526  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4925  inner-membrane translocator  32.53 
 
 
293 aa  145  8e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0402653  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3584  inner-membrane translocator  34.88 
 
 
603 aa  145  9e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2607  inner-membrane translocator  34.23 
 
 
308 aa  145  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00528539  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3254  inner-membrane translocator  34.23 
 
 
308 aa  145  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  33.8 
 
 
301 aa  144  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5318  inner-membrane translocator  35.23 
 
 
603 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0891799  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7434  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  32.87 
 
 
287 aa  144  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1258  inner-membrane translocator  32.4 
 
 
291 aa  144  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.241594  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4332  inner-membrane translocator  36 
 
 
308 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3535  inner-membrane translocator  32.28 
 
 
291 aa  144  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.152281  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0852  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.76 
 
 
289 aa  144  2e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.416371  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3304  inner-membrane translocator  34.6 
 
 
289 aa  143  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2588  inner-membrane translocator  32.33 
 
 
290 aa  143  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0534  inner-membrane translocator  33.22 
 
 
290 aa  143  4e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  unclonable  1.79103e-08 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2127  inner-membrane translocator  32.43 
 
 
292 aa  141  1e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172623  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3624  inner-membrane translocator  36.21 
 
 
308 aa  142  1e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5101  inner-membrane translocator  34.4 
 
 
603 aa  141  1e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.208256  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1949  inner-membrane translocator  33.09 
 
 
292 aa  141  1e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.926324  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0728  inner-membrane translocator  32.77 
 
 
303 aa  141  1e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2492  inner-membrane translocator  32.9 
 
 
304 aa  140  2e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.366827  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0487  inner-membrane translocator  31.92 
 
 
307 aa  140  2e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0359  inner-membrane translocator  34.35 
 
 
300 aa  140  3e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3552  inner-membrane translocator  35.42 
 
 
289 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2751  inner-membrane translocator  32.53 
 
 
301 aa  139  4e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1664  inner-membrane translocator  33.58 
 
 
292 aa  139  4e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0598  inner-membrane translocator  33.99 
 
 
304 aa  139  4e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34105  normal  0.520758 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0229  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  32.66 
 
 
308 aa  139  5e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.689889 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0399  branched chain amino acid ABC transporter permease  31.58 
 
 
294 aa  139  6e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.615306  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3973  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  31.92 
 
 
308 aa  138  8e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5269  inner-membrane translocator  34.88 
 
 
308 aa  139  8e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0245  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  31.92 
 
 
308 aa  138  8e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4431  inner-membrane translocator  34.88 
 
 
308 aa  139  8e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.964764  hitchhiker  0.00013091 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3667  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  31.92 
 
 
308 aa  138  8e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.344938  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2253  inner-membrane translocator  32.88 
 
 
301 aa  139  8e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1387  inner-membrane translocator  32.3 
 
 
294 aa  138  9e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4946  inner-membrane translocator  35.22 
 
 
308 aa  138  9e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3619  inner-membrane translocator  34.43 
 
 
305 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4918  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein BraD  33.33 
 
 
304 aa  138  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1848  inner-membrane translocator  33.33 
 
 
292 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.623579  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3349  inner-membrane translocator  34.88 
 
 
319 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5018  inner-membrane translocator  34.88 
 
 
319 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2139  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  36.07 
 
 
308 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2885  putative ABC transporter permiase component  32.97 
 
 
277 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0257829 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0220  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  34.83 
 
 
290 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168677  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0773  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.07 
 
 
308 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2555  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.07 
 
 
293 aa  137  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.1036  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1581  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.58 
 
 
289 aa  137  2e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000593948  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0644  inner-membrane translocator  32.98 
 
 
290 aa  137  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3837  inner-membrane translocator  35.19 
 
 
287 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622329  normal  0.114435 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0863  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.07 
 
 
308 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.21729  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0652  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  34.88 
 
 
319 aa  137  3e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276019  normal  0.481307 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0259  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.53 
 
 
301 aa  136  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1838  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  35.74 
 
 
308 aa  136  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0260  inner-membrane translocator  31.69 
 
 
287 aa  136  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2082  inner-membrane translocator  33.11 
 
 
289 aa  135  6e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.936766  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0447  inner-membrane translocator  36.68 
 
 
290 aa  135  7e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1479  inner-membrane translocator  33.33 
 
 
302 aa  135  9e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>