More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0001 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0001  chromosomal replication initiation protein  100 
 
 		 506 aa  1019    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0129481  hitchhiker  0.0000000143408 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0001  chromosomal replication initiation protein  57.32 
 
 		 475 aa  556  1e-157  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.216398 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0001  chromosomal replication initiation protein  58.74 
 
 		 473 aa  557  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0001  chromosomal replication initiation protein  58.33 
 
 		 472 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.583954  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0001  chromosomal replication initiation protein  58.3 
 
 		 475 aa  551  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0001  chromosomal replication initiation protein  57.72 
 
 		 472 aa  551  1e-156  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0001  chromosomal replication initiation protein  57.11 
 
 		 475 aa  550  1e-155  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0001  chromosomal replication initiation protein  57.52 
 
 		 472 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0001  chromosomal replication initiation protein  54.95 
 
 		 506 aa  521  1e-146  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0003  chromosomal replication initiation protein  54.82 
 
 		 510 aa  513  1e-144  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  unclonable  0.0000000244231  normal  0.247706 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0002  chromosomal replication initiation protein  52.83 
 
 		 501 aa  502  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0002  chromosomal replication initiation protein  52.51 
 
 		 498 aa  504  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0001  chromosomal replication initiation protein  53.05 
 
 		 494 aa  500  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.852723  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0002  chromosomal replication initiation protein  52.43 
 
 		 501 aa  495  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.536334 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0001  chromosomal replication initiation protein  52.43 
 
 		 501 aa  495  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0001  chromosomal replication initiation protein  52.62 
 
 		 499 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00640124  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0391  chromosomal replication initiation protein  48 
 
 		 524 aa  433  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246214  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0001  chromosomal replication initiation protein  47.68 
 
 		 479 aa  430  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0301114  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0001  chromosomal replication initiation protein  47.08 
 
 		 516 aa  424  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.962631  hitchhiker  0.00495499 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0001  chromosomal replication initiation protein  46.88 
 
 		 516 aa  425  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0192779 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0002  chromosomal replication initiation protein  46.8 
 
 		 481 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0480088  hitchhiker  0.0000132312 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0003  chromosomal replication initiation protein  47.2 
 
 		 520 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.0000273847  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0001  chromosomal replication initiation protein  47.37 
 
 		 496 aa  404  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00276825  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1279  chromosomal replication initiation protein  45.53 
 
 		 524 aa  405  1e-111  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000504678  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0001  chromosomal replication initiation protein  47.07 
 
 		 496 aa  402  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.0000869739  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0003  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.23 
 
 		 519 aa  385  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118183  unclonable  1.2245600000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0001  chromosomal replication initiation protein  41.28 
 
 		 482 aa  370  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2833  chromosomal replication initiation protein  40.48 
 
 		 448 aa  370  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0001  chromosomal replication initiation protein  42.6 
 
 		 509 aa  368  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.05 
 
 		 477 aa  363  5.0000000000000005e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3373  chromosomal replication initiation protein  40.08 
 
 		 460 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0002  chromosomal replication initiation protein  40.12 
 
 		 461 aa  351  2e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.020385  hitchhiker  0.000000603983 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1342  chromosomal replication initiation protein  40.33 
 
 		 455 aa  346  5e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0011  chromosomal replication initiation protein  40.33 
 
 		 455 aa  346  5e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0001  chromosomal replication initiation protein  37.77 
 
 		 470 aa  338  9.999999999999999e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0703594  normal  0.628106 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0270  chromosomal replication initiation protein  37.5 
 
 		 452 aa  336  5e-91  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.43885  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0809  chromosomal replication initiation protein  37.7 
 
 		 464 aa  335  7.999999999999999e-91  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.54082  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0001  chromosomal replication initiation protein  36.36 
 
 		 460 aa  333  5e-90  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.335135  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0259  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.95 
 
 		 474 aa  325  1e-87  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.310271  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.06 
 
 		 482 aa  321  1.9999999999999998e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000460391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0001  chromosomal replication initiation protein  36.9 
 
 		 477 aa  315  9.999999999999999e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.839498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0001  chromosomal replication initiation protein  44.7 
 
 		 475 aa  301  2e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0001  chromosomal replication initiation protein  37.72 
 
 		 495 aa  299  1e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0001  chromosomal replication initiation protein  34.59 
 
 		 524 aa  290  5.0000000000000004e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0237228  normal  0.131634 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0001  chromosomal replication initiation protein  36.61 
 
 		 487 aa  287  2.9999999999999996e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.775334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0001  chromosomal replication initiation protein  35.19 
 
 		 462 aa  286  5e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000281438  unclonable  0.0000000118337 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.01 
 
 		 516 aa  286  8e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000003522  unclonable  0.00000000000722922 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0006  chromosomal replication initiation protein  36.12 
 
 		 462 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000403403  unclonable  0.000000000136332 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0001  chromosomal replication initiation protein  37.3 
 
 		 498 aa  282  9e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0001  chromosomal replication initiation protein  34.13 
 
 		 452 aa  282  1e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0001  chromosomal replication initiation protein  34.13 
 
 		 452 aa  282  1e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00010  chromosomal replication initiation protein  36.88 
 
 		 478 aa  281  2e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.499294  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0001  chromosomal replication initiation protein  34.66 
 
 		 462 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000998931  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0001  chromosomal replication initiation protein  34.66 
 
 		 462 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000257358  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0001  chromosomal replication initiation protein  34.66 
 
 		 462 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000157699  unclonable  0.0000121376 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0001  chromosomal replication initiation protein  34.66 
 
 		 462 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000562887  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0009  chromosomal replication initiation protein  34.06 
 
 		 460 aa  280  5e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000281375  unclonable  0.0000000000600935 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0001  chromosomal replication initiation protein  36.57 
 
 		 451 aa  280  6e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.000000764641  normal  0.435321 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0001  chromosomal replication initiation protein  34.86 
 
 		 461 aa  280  6e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000263579  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0001  chromosomal replication initiation protein  33.73 
 
 		 451 aa  279  7e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123931  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0001  chromosomal replication initiation protein  33.73 
 
 		 451 aa  279  7e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00187127  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2507  chromosomal replication initiation protein  34.91 
 
 		 472 aa  279  9e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251721  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0001  chromosomal replication initiation protein  35.26 
 
 		 462 aa  278  1e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000211976  n/a   
 
 
 
NC_009438  Sputcn32_0001  chromosomal replication initiation protein  35.06 
 
 		 461 aa  278  1e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000051  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0001  chromosomal replication initiation protein  33.86 
 
 		 460 aa  279  1e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000179736  unclonable  0.0000000000313535 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0001  chromosomal replication initiation protein  33.86 
 
 		 460 aa  279  1e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000724276  unclonable  0.0000176 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0008  chromosomal replication initiation protein  33.86 
 
 		 460 aa  277  3e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0001  chromosomal replication initiation protein  34.46 
 
 		 461 aa  277  3e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000102323  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.28 
 
 		 461 aa  277  4e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.926832  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1227  chromosomal replication initiation protein  36.84 
 
 		 449 aa  276  9e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.174697  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0001  chromosomal replication initiation protein  35.53 
 
 		 507 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00366311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0001  chromosomal replication initiation protein  37.08 
 
 		 487 aa  274  3e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000189853  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0001  chromosomal replication initiation protein  35.6 
 
 		 511 aa  274  3e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.424003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0001  chromosomal replication initiation protein  35.05 
 
 		 494 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0001  chromosomal replication initiation protein  35.28 
 
 		 455 aa  273  7e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.632445  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0001  chromosomal replication initiation protein  33.47 
 
 		 452 aa  273  7e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0001  chromosomal replication initiation protein  33.86 
 
 		 459 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000781636  unclonable  0.00000344978 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.8 
 
 		 474 aa  270  4e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00208216  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.64 
 
 		 455 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.738178 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4050  chromosomal replication initiation protein  34.14 
 
 		 466 aa  267  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0553543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.24 
 
 		 463 aa  267  4e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.6 
 
 		 483 aa  266  4e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000328329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4066  chromosomal replication initiation protein  34.14 
 
 		 466 aa  267  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000844177  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4123  chromosomal replication initiation protein  34.14 
 
 		 466 aa  267  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00889574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4172  chromosomal replication initiation protein  34.14 
 
 		 466 aa  267  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.049293  normal  0.324603 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4177  chromosomal replication initiation protein  34.34 
 
 		 462 aa  266  5e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4153  chromosomal replication initiation protein  34.34 
 
 		 462 aa  266  5e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.6269e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0001  initiation of chromosome replication  32.19 
 
 		 436 aa  266  5e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0001  chromosomal replication initiation protein  33.8 
 
 		 467 aa  266  7e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000185056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4230  chromosomal replication initiation protein  34.14 
 
 		 466 aa  266  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00725647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0009  chromosomal replication initiation protein  34.13 
 
 		 468 aa  265  1e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00184157  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  31.17 
 
 		 449 aa  265  1e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.8 
 
 		 467 aa  265  2e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000136922  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  36.09 
 
 		 451 aa  265  2e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5130  chromosomal replication initiation protein  34.34 
 
 		 467 aa  265  2e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000558594  normal  0.0494414 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4067  chromosomal replication initiation protein  33.8 
 
 		 467 aa  265  2e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000102031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4223  chromosomal replication initiation protein  33.8 
 
 		 467 aa  265  2e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000066194  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0136  chromosomal replication initiation protein  32.67 
 
 		 452 aa  265  2e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000582235  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3915  chromosomal replication initiation protein  33.8 
 
 		 467 aa  265  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000126813  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4212  chromosomal replication initiation protein  33.8 
 
 		 467 aa  265  2e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000201887  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>