More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD1035 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  WD1035  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 
425 aa  877    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0692  serine hydroxymethyltransferase  68.93 
 
 
421 aa  613  9.999999999999999e-175  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.414357  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0311  serine hydroxymethyltransferase  67.72 
 
 
420 aa  595  1e-169  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0055  serine hydroxymethyltransferase  62.8 
 
 
424 aa  549  1e-155  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2530  serine hydroxymethyltransferase  62.26 
 
 
439 aa  549  1e-155  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0758  serine hydroxymethyltransferase  62.02 
 
 
438 aa  548  1e-155  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3354  serine hydroxymethyltransferase  61.63 
 
 
432 aa  550  1e-155  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0554425  normal  0.88347 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0821  serine hydroxymethyltransferase  61.93 
 
 
431 aa  546  1e-154  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0765  serine hydroxymethyltransferase  62.02 
 
 
438 aa  546  1e-154  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0354  serine hydroxymethyltransferase  61.78 
 
 
431 aa  545  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0389221  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3366  serine hydroxymethyltransferase  61.59 
 
 
434 aa  541  1e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113105  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2908  serine hydroxymethyltransferase  60.82 
 
 
438 aa  541  1e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000280655  hitchhiker  0.00545149 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3303  serine hydroxymethyltransferase  61.84 
 
 
424 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.282627  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3956  serine hydroxymethyltransferase  61.35 
 
 
434 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.237015 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3171  serine hydroxymethyltransferase  61.11 
 
 
434 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188905  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0823  serine hydroxymethyltransferase  61.45 
 
 
431 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2481  serine hydroxymethyltransferase  61.2 
 
 
431 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.938329  normal  0.172432 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3495  serine hydroxymethyltransferase  61.11 
 
 
434 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2113  serine hydroxymethyltransferase  60.24 
 
 
424 aa  539  9.999999999999999e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332542  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0218  serine hydroxymethyltransferase  63.29 
 
 
419 aa  539  9.999999999999999e-153  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0240245  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1585  serine hydroxymethyltransferase  61.3 
 
 
424 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.592814  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  61.2 
 
 
437 aa  539  9.999999999999999e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3546  serine hydroxymethyltransferase  61.26 
 
 
424 aa  537  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0740  serine hydroxymethyltransferase  61.59 
 
 
424 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0471  serine hydroxymethyltransferase  61.84 
 
 
424 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4822  serine hydroxymethyltransferase  61.02 
 
 
424 aa  535  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2106  serine hydroxymethyltransferase  61.59 
 
 
424 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1006  serine hydroxymethyltransferase  61.84 
 
 
424 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8588  serine hydroxymethyltransferase  60.98 
 
 
420 aa  537  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5063  serine hydroxymethyltransferase  60.87 
 
 
424 aa  537  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0644659  normal  0.0156096 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0710  serine hydroxymethyltransferase  61.84 
 
 
424 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2659  serine hydroxymethyltransferase  60.98 
 
 
440 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.719136  normal  0.877467 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1579  serine hydroxymethyltransferase  61.2 
 
 
431 aa  535  1e-151  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0816  serine hydroxymethyltransferase  60.82 
 
 
431 aa  535  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.38724 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0828  serine hydroxymethyltransferase  61.59 
 
 
424 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1979  serine hydroxymethyltransferase  61.84 
 
 
424 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00954911  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6867  glycine hydroxymethyltransferase  59.42 
 
 
431 aa  531  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.592385 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0629  serine hydroxymethyltransferase  60.33 
 
 
432 aa  532  1e-150  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.1109  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0571  serine hydroxymethyltransferase  60.77 
 
 
424 aa  532  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000232  serine hydroxymethyltransferase  62.8 
 
 
431 aa  532  1e-150  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1868  serine hydroxymethyltransferase  60.87 
 
 
424 aa  533  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2671  serine hydroxymethyltransferase  60.72 
 
 
433 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163758  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5200  serine hydroxymethyltransferase  60.53 
 
 
424 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05971  serine hydroxymethyltransferase  62.08 
 
 
431 aa  530  1e-149  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5022  serine hydroxymethyltransferase  60.77 
 
 
424 aa  531  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.903187 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1177  serine hydroxymethyltransferase  60.58 
 
 
432 aa  528  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0289619  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0920  serine hydroxymethyltransferase  60 
 
 
427 aa  528  1e-149  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.455334  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1727  serine hydroxymethyltransferase  61.45 
 
 
433 aa  529  1e-149  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.130178 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3004  serine hydroxymethyltransferase  60.96 
 
 
432 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21133  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2634  serine hydroxymethyltransferase  60.48 
 
 
433 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5085  serine hydroxymethyltransferase  60.53 
 
 
424 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.750126 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1814  serine hydroxymethyltransferase  61.93 
 
 
434 aa  531  1e-149  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4497  serine hydroxymethyltransferase  60.53 
 
 
424 aa  530  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2110  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 
434 aa  528  1e-148  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0870  glycine hydroxymethyltransferase  62.44 
 
 
424 aa  526  1e-148  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1266  serine hydroxymethyltransferase  60.58 
 
 
432 aa  526  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0458809  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2240  serine hydroxymethyltransferase  58.94 
 
 
436 aa  526  1e-148  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.435156  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1610  serine hydroxymethyltransferase  60.72 
 
 
429 aa  525  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3283  serine hydroxymethyltransferase  60.29 
 
 
424 aa  528  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1225  serine hydroxymethyltransferase  60.48 
 
 
433 aa  527  1e-148  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2991  serine hydroxymethyltransferase  60 
 
 
439 aa  523  1e-147  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.406931  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0952  serine hydroxymethyltransferase  61.02 
 
 
435 aa  523  1e-147  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3047  serine hydroxymethyltransferase  59.22 
 
 
434 aa  520  1e-146  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.302237  normal  0.92083 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1827  serine hydroxymethyltransferase  60.14 
 
 
430 aa  520  1e-146  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.752619  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2123  serine hydroxymethyltransferase  62.32 
 
 
432 aa  520  1e-146  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.607283  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2305  serine hydroxymethyltransferase  58.7 
 
 
434 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4649  serine hydroxymethyltransferase  60.96 
 
 
434 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.863224  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3104  serine hydroxymethyltransferase  61.2 
 
 
433 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.425727  decreased coverage  0.00549191 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5759  glycine hydroxymethyltransferase  57.49 
 
 
431 aa  513  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2283  glycine hydroxymethyltransferase  61.3 
 
 
425 aa  508  1e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90339 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0169  serine hydroxymethyltransferase  57.73 
 
 
422 aa  509  1e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3135  serine hydroxymethyltransferase  59.19 
 
 
434 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1131  serine hydroxymethyltransferase  60.72 
 
 
438 aa  508  1e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.584691  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3844  serine hydroxymethyltransferase  58.07 
 
 
431 aa  505  9.999999999999999e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.988817  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1887  Glycine hydroxymethyltransferase  58.11 
 
 
419 aa  505  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.409267  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3404  serine hydroxymethyltransferase  60.48 
 
 
433 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5297  serine hydroxymethyltransferase  60.48 
 
 
433 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2327  Glycine hydroxymethyltransferase  59.12 
 
 
413 aa  508  9.999999999999999e-143  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000566706  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1142  serine hydroxymethyltransferase  59.19 
 
 
434 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0417  serine hydroxymethyltransferase  57.93 
 
 
420 aa  506  9.999999999999999e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1537  serine hydroxymethyltransferase  57.97 
 
 
435 aa  505  9.999999999999999e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0106  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1468  serine hydroxymethyltransferase  56.87 
 
 
423 aa  502  1e-141  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03361  serine hydroxymethyltransferase  59.71 
 
 
411 aa  504  1e-141  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.498926  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1624  serine hydroxymethyltransferase  59.95 
 
 
411 aa  504  1e-141  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  58.63 
 
 
431 aa  501  1e-141  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4276  glycine hydroxymethyltransferase  60.39 
 
 
451 aa  502  1e-141  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.514948  normal  0.0110039 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  57.14 
 
 
417 aa  501  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  58.7 
 
 
422 aa  501  1e-140  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  57.83 
 
 
424 aa  501  1e-140  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  59.08 
 
 
422 aa  500  1e-140  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  57.91 
 
 
415 aa  499  1e-140  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4270  serine hydroxymethyltransferase  60.58 
 
 
423 aa  499  1e-140  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.978969  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0209  serine hydroxymethyltransferase  58.7 
 
 
427 aa  499  1e-140  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  58.88 
 
 
417 aa  497  1e-139  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  58.98 
 
 
429 aa  497  1e-139  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0759  serine hydroxymethyltransferase  58.35 
 
 
417 aa  496  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0207  serine hydroxymethyltransferase  58.45 
 
 
427 aa  497  1e-139  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0791  serine hydroxymethyltransferase  57.8 
 
 
435 aa  497  1e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0375384  normal  0.0421873 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0461  serine hydroxymethyltransferase  56.63 
 
 
417 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0841  glycine hydroxymethyltransferase  56.55 
 
 
417 aa  492  9.999999999999999e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33053  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>