More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0981 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  WD0981  tRNA modification GTPase TrmE  100 
 
 		 508 aa  1043    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0060  tRNA modification GTPase TrmE  48.71 
 
 		 439 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.646746  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0032  tRNA modification GTPase TrmE  47.32 
 
 		 441 aa  436  1e-121  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0717  tRNA modification GTPase TrmE  48.54 
 
 		 550 aa  302  8.000000000000001e-81  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0429  tRNA modification GTPase TrmE  36.59 
 
 		 462 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0291  tRNA modification GTPase TrmE  36.65 
 
 		 449 aa  293  4e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1272  tRNA modification GTPase TrmE  50.17 
 
 		 438 aa  291  2e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.803467 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0858  tRNA modification GTPase TrmE  36.91 
 
 		 442 aa  291  3e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2964  tRNA modification GTPase TrmE  48.99 
 
 		 438 aa  291  3e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1029  tRNA modification GTPase TrmE  40.62 
 
 		 434 aa  272  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.111023  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0005  tRNA modification GTPase TrmE  35.4 
 
 		 456 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273487  hitchhiker  0.00022418 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5308  tRNA modification GTPase TrmE  35.4 
 
 		 456 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.832252  normal  0.0803697 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0392  tRNA modification GTPase TrmE  34.64 
 
 		 460 aa  266  5e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5443  tRNA modification GTPase TrmE  34.74 
 
 		 456 aa  266  8e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5611  tRNA modification GTPase TrmE  34.49 
 
 		 456 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4390  tRNA modification GTPase TrmE  47.99 
 
 		 436 aa  261  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1284  tRNA modification GTPase TrmE  45.03 
 
 		 451 aa  261  2e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1982  tRNA modification GTPase TrmE  46.69 
 
 		 442 aa  260  3e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.535641  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5212  tRNA modification GTPase TrmE  34.36 
 
 		 456 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4619  tRNA modification GTPase TrmE  33.85 
 
 		 455 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3624  tRNA modification GTPase TrmE  43.55 
 
 		 455 aa  260  5.0000000000000005e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.473452  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0098  tRNA modification GTPase TrmE  47.23 
 
 		 456 aa  259  7e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0727899 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04098  tRNA modification GTPase  33.2 
 
 		 462 aa  258  2e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3931  tRNA modification GTPase TrmE  45.45 
 
 		 437 aa  258  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1411  tRNA modification GTPase TrmE  44.48 
 
 		 437 aa  258  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.03827 
 
 
-
 
NC_004310  BR2062  tRNA modification GTPase TrmE  45.85 
 
 		 442 aa  257  4e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00847213  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2587  tRNA modification GTPase TrmE  43.38 
 
 		 448 aa  254  3e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1580  tRNA modification GTPase TrmE  42.59 
 
 		 444 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.183316 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3472  tRNA modification GTPase TrmE  44.03 
 
 		 442 aa  252  9.000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1859  tRNA modification GTPase TrmE  43.22 
 
 		 444 aa  250  5e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.517365 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3205  tRNA modification GTPase TrmE  43.52 
 
 		 440 aa  250  5e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4257  tRNA modification GTPase TrmE  46.32 
 
 		 437 aa  249  6e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.910878 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2864  tRNA modification GTPase TrmE  43.89 
 
 		 428 aa  249  7e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73400  tRNA modification GTPase TrmE  34.55 
 
 		 455 aa  249  8e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000503354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5133  tRNA modification GTPase TrmE  44.37 
 
 		 456 aa  249  9e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5742  tRNA modification GTPase TrmE  44.16 
 
 		 456 aa  247  3e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3454  tRNA modification GTPase TrmE  43.91 
 
 		 429 aa  246  6e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4158  tRNA modification GTPase TrmE  32.24 
 
 		 454 aa  246  6.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000196641  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5136  tRNA modification GTPase TrmE  33.07 
 
 		 454 aa  246  6.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.041745  normal  0.0619684 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4260  tRNA modification GTPase TrmE  33.07 
 
 		 454 aa  246  9e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4219  tRNA modification GTPase TrmE  33.07 
 
 		 454 aa  246  9e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.99545  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4245  tRNA modification GTPase TrmE  32.24 
 
 		 454 aa  246  9e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00411948  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4288  tRNA modification GTPase TrmE  33.07 
 
 		 454 aa  246  9e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4263  tRNA modification GTPase TrmE  33.27 
 
 		 454 aa  245  9.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.226045  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4073  tRNA modification GTPase TrmE  33.27 
 
 		 454 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.420944  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52440  tRNA modification GTPase TrmE  32.75 
 
 		 455 aa  244  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03590  tRNA modification GTPase  32.88 
 
 		 454 aa  244  3e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3920  tRNA modification GTPase TrmE  32.88 
 
 		 454 aa  244  3e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.189642  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4183  tRNA modification GTPase TrmE  32.05 
 
 		 454 aa  244  3e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000380111  normal  0.0649437 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03534  hypothetical protein  32.88 
 
 		 454 aa  244  3e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.948294  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0164  tRNA modification GTPase TrmE  45.67 
 
 		 445 aa  243  5e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.364073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1658  tRNA modification GTPase TrmE  43.79 
 
 		 444 aa  243  5e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.844134  normal  0.296272 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33876  predicted protein  42.45 
 
 		 489 aa  243  6e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.242987 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2775  tRNA modification GTPase TrmE  33.01 
 
 		 452 aa  243  7e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6368  tRNA modification GTPase TrmE  33.86 
 
 		 455 aa  243  7e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1783  tRNA modification GTPase TrmE  32.51 
 
 		 454 aa  242  1e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.028326  normal  0.377376 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4216  tRNA modification GTPase TrmE  32.68 
 
 		 454 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.021791  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1940  tRNA modification GTPase TrmE  42.41 
 
 		 435 aa  241  2.9999999999999997e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.704243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0027  tRNA modification GTPase TrmE  33.4 
 
 		 454 aa  240  4e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0008  tRNA modification GTPase TrmE  32.88 
 
 		 453 aa  240  4e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.185087  hitchhiker  0.000721309 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0297  tRNA modification GTPase TrmE  43.52 
 
 		 441 aa  240  5e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2929  tRNA modification GTPase TrmE  39.89 
 
 		 446 aa  239  5.999999999999999e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4234  tRNA modification GTPase TrmE  32.56 
 
 		 467 aa  239  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3073  tRNA modification GTPase TrmE  39.6 
 
 		 446 aa  238  1e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4200  tRNA modification GTPase TrmE  34.5 
 
 		 448 aa  239  1e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0153583 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4127  tRNA modification GTPase TrmE  32.56 
 
 		 454 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4177  tRNA modification GTPase TrmE  32.56 
 
 		 467 aa  239  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0106  tRNA modification GTPase TrmE  45.33 
 
 		 457 aa  238  1e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.446893  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4034  tRNA modification GTPase TrmE  32.42 
 
 		 453 aa  239  1e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.461545  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4070  tRNA modification GTPase TrmE  32.56 
 
 		 467 aa  239  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125734  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4055  tRNA modification GTPase TrmE  32.56 
 
 		 454 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.765231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56161  predicted protein  40.95 
 
 		 478 aa  238  1e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2195  tRNA modification GTPase TrmE  31.84 
 
 		 475 aa  238  2e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4081  tRNA modification GTPase TrmE  42.21 
 
 		 441 aa  237  4e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0162579 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4148  tRNA modification GTPase TrmE  32.35 
 
 		 454 aa  236  5.0000000000000005e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.421634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3894  tRNA modification GTPase TrmE  42.05 
 
 		 456 aa  236  7e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4013  tRNA modification GTPase TrmE  43.34 
 
 		 456 aa  236  7e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.205295  normal  0.289015 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0199  tRNA modification GTPase TrmE  44.63 
 
 		 473 aa  235  1.0000000000000001e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2124  tRNA modification GTPase TrmE  44.63 
 
 		 452 aa  235  2.0000000000000002e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0002  tRNA modification GTPase TrmE  42.57 
 
 		 455 aa  234  3e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1833  tRNA modification GTPase TrmE  44.22 
 
 		 431 aa  234  3e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0890064  normal  0.0768704 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4615  tRNA modification GTPase TrmE  31.65 
 
 		 454 aa  233  5e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394021  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4292  tRNA modification GTPase TrmE  31.46 
 
 		 454 aa  233  8.000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2515  tRNA modification GTPase TrmE  41.06 
 
 		 464 aa  233  9e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310293  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3038  tRNA modification GTPase TrmE  43.05 
 
 		 448 aa  232  1e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.38062  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0003  tRNA modification GTPase TrmE  44.15 
 
 		 419 aa  230  5e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398511  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3097  tRNA modification GTPase TrmE  31 
 
 		 464 aa  230  5e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151562  normal  0.0117151 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3213  tRNA modification GTPase TrmE  30.77 
 
 		 489 aa  229  6e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3755  tRNA modification GTPase TrmE  31.38 
 
 		 481 aa  229  8e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0010  tRNA modification GTPase TrmE  42.62 
 
 		 435 aa  229  9e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000341639  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2667  tRNA modification GTPase TrmE  40.65 
 
 		 428 aa  229  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0398705  normal  0.380735 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3612  tRNA modification GTPase TrmE  32.17 
 
 		 455 aa  228  2e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0132  tRNA modification GTPase TrmE  40.67 
 
 		 452 aa  228  2e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.849325  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2547  tRNA modification GTPase TrmE  30.7 
 
 		 464 aa  228  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0461446  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4031  tRNA modification GTPase TrmE  42.66 
 
 		 453 aa  227  3e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.608873  hitchhiker  0.001302 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3161  tRNA modification GTPase TrmE  30.7 
 
 		 464 aa  228  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.399046  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6518  tRNA modification GTPase TrmE  30.58 
 
 		 464 aa  227  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4138  tRNA modification GTPase TrmE  39.88 
 
 		 486 aa  227  4e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.619376  normal  0.415942 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4484  tRNA modification GTPase TrmE  32.62 
 
 		 459 aa  227  4e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000179125 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3495  tRNA modification GTPase TrmE  39.75 
 
 		 467 aa  227  5.0000000000000005e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>