More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0963 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0787  UvrD/REP helicase  49.84 
 
 		 800 aa  644    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.82156  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0963  helicase II - UvrD/PcrA  100 
 
 		 638 aa  1316    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1460  UvrD/REP helicase  49.14 
 
 		 804 aa  663    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.373759  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0233  ATP-dependent DNA helicase Rep  62.38 
 
 		 639 aa  839    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2360  UvrD/REP helicase  49.32 
 
 		 816 aa  655    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1212  ATP-dependent DNA helicase UvrD  48.18 
 
 		 892 aa  638    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.771972  normal  0.554 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6141  ATP-dependent DNA helicase Rep  46.76 
 
 		 855 aa  645    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0790722 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2023  UvrD/REP helicase  46.27 
 
 		 845 aa  639    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.184337 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0860  UvrD/Rep family helicase  64.11 
 
 		 639 aa  858    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2777  ATP-dependent DNA helicase Rep  48.14 
 
 		 817 aa  636    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.46822  normal  0.929226 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0595  UvrD/REP helicase  49.21 
 
 		 790 aa  656    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.77908 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3367  UvrD/REP helicase  46.69 
 
 		 847 aa  645    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561637 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1426  UvrD/REP helicase  49.21 
 
 		 817 aa  654    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.854677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2739  UvrD/REP helicase  47.19 
 
 		 833 aa  646    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0218  UvrD/REP helicase  49.45 
 
 		 728 aa  640    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4021  UvrD/REP helicase  46.33 
 
 		 848 aa  641    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2059  ATP-dependent DNA helicase Rep  49.22 
 
 		 763 aa  652    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.439478  normal  0.531774 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2024  ATP-dependent DNA helicase Rep  47.55 
 
 		 814 aa  634  1e-180  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.260389  normal  0.212402 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2483  DNA helicase II  49.61 
 
 		 807 aa  631  1e-180  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0932  putative DNA helicase II  48.3 
 
 		 816 aa  630  1e-179  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.156274  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0689  UvrD/REP helicase  48.36 
 
 		 816 aa  629  1e-179  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.723035  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2836  DNA helicase II  47.46 
 
 		 858 aa  628  1e-179  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2436  UvrD/REP helicase  48.83 
 
 		 778 aa  631  1e-179  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0016628  normal  0.650689 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0398  UvrD/REP helicase  47.89 
 
 		 798 aa  625  1e-178  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.970559 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0678  UvrD/REP helicase  47.66 
 
 		 783 aa  625  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0563949  normal  0.0143494 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2092  ATP-dependent DNA helicase Rep  47.82 
 
 		 783 aa  628  1e-178  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0227682  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0766  UvrD/REP helicase  47.82 
 
 		 786 aa  627  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.423643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0356  UvrD/Rep family helicase  51.85 
 
 		 630 aa  627  1e-178  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.190335  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3279  UvrD/REP helicase  45.56 
 
 		 866 aa  626  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0367  UvrD/REP helicase  48.06 
 
 		 795 aa  625  1e-178  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.944301  normal  0.78423 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0322  UvrD/REP helicase  48.06 
 
 		 795 aa  626  1e-178  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4295  UvrD/REP helicase  48.69 
 
 		 799 aa  626  1e-178  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2563  UvrD/REP helicase  47.81 
 
 		 825 aa  625  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4951  UvrD/REP helicase  47.74 
 
 		 797 aa  624  1e-177  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.120082  decreased coverage  0.0000000995546 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2822  UvrD/REP helicase  47.5 
 
 		 826 aa  620  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.467404 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2037  UvrD/REP helicase  45.76 
 
 		 850 aa  619  1e-176  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114912  normal  0.635195 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1084  UvrD/REP helicase  48.74 
 
 		 789 aa  620  1e-176  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.305736 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1536  ATP-dependent DNA helicase Rep  47.35 
 
 		 768 aa  615  1e-175  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305848  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1293  ATP-dependent DNA helicase Rep  47.32 
 
 		 765 aa  606  9.999999999999999e-173  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0211  UvrD/REP helicase  46.55 
 
 		 760 aa  604  1.0000000000000001e-171  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0344755 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1988  ATP-dependent DNA helicase Rep  44.14 
 
 		 876 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1413  DNA helicase II  44.61 
 
 		 858 aa  599  1e-170  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.338777  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3012  UvrD/REP helicase  47.33 
 
 		 770 aa  599  1e-170  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.853588 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1369  DNA helicase II  44.31 
 
 		 858 aa  598  1e-169  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.261872  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1764  UvrD/REP helicase  44.07 
 
 		 864 aa  593  1e-168  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.790075  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  44.03 
 
 		 732 aa  526  1e-148  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3483  ATP-dependent DNA helicase Rep  42.63 
 
 		 673 aa  514  1e-144  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  42.63 
 
 		 736 aa  505  1e-141  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.14 
 
 		 753 aa  499  1e-140  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.26 
 
 		 725 aa  501  1e-140  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.1 
 
 		 753 aa  500  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.5 
 
 		 747 aa  497  1e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.1 
 
 		 751 aa  497  1e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  42.1 
 
 		 753 aa  498  1e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  42.1 
 
 		 751 aa  497  1e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.5 
 
 		 747 aa  497  1e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.1 
 
 		 751 aa  496  1e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.1 
 
 		 751 aa  498  1e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2699  UvrD/REP helicase  40.4 
 
 		 709 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.506078  hitchhiker  0.00000113903 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.21 
 
 		 747 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3101  DNA helicase II  40.4 
 
 		 709 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.546852  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.11 
 
 		 730 aa  489  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.06 
 
 		 741 aa  492  1e-137  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.11 
 
 		 730 aa  489  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  40.61 
 
 		 739 aa  485  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.9 
 
 		 729 aa  488  1e-136  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3971  DNA-dependent helicase II  42.37 
 
 		 720 aa  486  1e-136  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2424  UvrD/REP helicase  41.11 
 
 		 725 aa  486  1e-136  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4162  DNA-dependent helicase II  42.53 
 
 		 720 aa  487  1e-136  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0353617  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  41.07 
 
 		 768 aa  487  1e-136  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.71 
 
 		 756 aa  483  1e-135  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6233  DNA-dependent helicase II  41.6 
 
 		 728 aa  485  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0187  DNA-dependent helicase II  41.78 
 
 		 720 aa  482  1e-135  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.276236  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  40.74 
 
 		 705 aa  485  1e-135  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  41.4 
 
 		 744 aa  483  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2863  ATP-dependent DNA helicase UvrD  39.02 
 
 		 725 aa  483  1e-135  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71870  DNA-dependent helicase II  41.29 
 
 		 728 aa  484  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.186903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4161  DNA-dependent helicase II  41.98 
 
 		 720 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.35 
 
 		 785 aa  481  1e-134  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.17 
 
 		 715 aa  480  1e-134  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4338  DNA-dependent helicase II  41.98 
 
 		 720 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0080  DNA helicase II  41.15 
 
 		 721 aa  479  1e-134  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4231  DNA-dependent helicase II  41.98 
 
 		 720 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4279  DNA-dependent helicase II  41.98 
 
 		 720 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4180  DNA-dependent helicase II  41.98 
 
 		 720 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.328302  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0186  DNA-dependent helicase II  41.94 
 
 		 723 aa  481  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  43.23 
 
 		 757 aa  479  1e-134  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.476962 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03689  DNA-dependent ATPase I and helicase II  42.13 
 
 		 720 aa  478  1e-133  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4166  DNA helicase II  42.13 
 
 		 720 aa  478  1e-133  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03638  hypothetical protein  42.13 
 
 		 720 aa  478  1e-133  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4194  DNA-dependent helicase II  41.98 
 
 		 720 aa  477  1e-133  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.452287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.5 
 
 		 742 aa  477  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40 
 
 		 729 aa  478  1e-133  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4332  DNA-dependent helicase II  42.13 
 
 		 720 aa  477  1e-133  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4179  DNA-dependent helicase II  42.13 
 
 		 720 aa  478  1e-133  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.654606  normal  0.0232596 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4273  DNA-dependent helicase II  41.98 
 
 		 720 aa  477  1e-133  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5252  DNA-dependent helicase II  42.13 
 
 		 720 aa  478  1e-133  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4038  DNA-dependent helicase II  41.98 
 
 		 720 aa  477  1e-133  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0236  DNA-dependent helicase II  41.32 
 
 		 720 aa  474  1e-132  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3458  UvrD/REP helicase  39.97 
 
 		 762 aa  473  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>