More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0957 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  WD0957  amino acid permease family protein  100 
 
 
411 aa  819    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.253131  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41010  putative amino acid permease  33.41 
 
 
451 aa  230  4e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3476  putative amino acid permease  33.65 
 
 
451 aa  225  9e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1307  amino acid permease-associated region  31.08 
 
 
445 aa  197  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.678061 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3940  amino acid permease-associated region  34.69 
 
 
460 aa  197  4.0000000000000005e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.447116 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4640  arginine:agmatin antiporter  30.6 
 
 
445 aa  187  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4640  arginine:agmatin antiporter  30.6 
 
 
445 aa  187  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4689  arginine:agmatin antiporter  30.6 
 
 
445 aa  187  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4556  arginine:agmatin antiporter  30.6 
 
 
445 aa  187  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3702  arginine:agmatin antiporter  30.47 
 
 
509 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.391119 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2346  amino acid permease-associated region  30.3 
 
 
447 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4549  arginine:agmatin antiporter  30.36 
 
 
445 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226613  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3167  amino acid permease-associated region  30.07 
 
 
436 aa  184  3e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2206  amino acid permease-associated region  30.3 
 
 
452 aa  184  3e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.218547  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4244  amino acid permease-associated region  33.85 
 
 
453 aa  183  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.399011  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1326  arginine:agmatin antiporter  30.24 
 
 
444 aa  182  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.501085  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03986  arginine:agmatin  30.73 
 
 
445 aa  182  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3877  amino acid permease-associated region  30.73 
 
 
445 aa  182  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4580  arginine:agmatin antiporter  30.73 
 
 
445 aa  182  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.721219  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2801  amino acid permease  31.18 
 
 
476 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.764757  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4612  arginine:agmatin antiporter  30.73 
 
 
445 aa  181  1e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4669  arginine:agmatin antiporter  30.73 
 
 
445 aa  182  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03947  hypothetical protein  30.73 
 
 
445 aa  182  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2782  arginine:agmatin antiporter  30.24 
 
 
444 aa  182  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.604082  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3912  arginine:agmatin antiporter  30.73 
 
 
445 aa  182  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.27107  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5628  arginine:agmatin antiporter  30.73 
 
 
445 aa  182  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2861  arginine:agmatin antiporter  30.24 
 
 
444 aa  182  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0608832  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4860  arginine:agmatin antiporter  30.73 
 
 
508 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.086172  hitchhiker  0.00303215 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4355  arginine:agmatin antiporter  30.73 
 
 
445 aa  181  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.705479  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0780  arginine:agmatin antiporter  30.29 
 
 
510 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12332  normal  0.0754473 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4344  arginine:agmatin antiporter  30.47 
 
 
508 aa  180  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.620829  hitchhiker  0.000578907 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5198  amino acid permease-associated region  30.55 
 
 
441 aa  179  9e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.043341  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0536  amino acid permease-associated region  30.79 
 
 
435 aa  177  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.555012  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0147  amino acid permease-associated region  35.31 
 
 
448 aa  177  4e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2394  arginine:agmatin antiporter  30.58 
 
 
450 aa  175  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.66662  normal  0.401461 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  28.5 
 
 
440 aa  170  5e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1067  putrescine transporter  29.73 
 
 
439 aa  167  4e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1674  phospholipid binding protein  28.78 
 
 
438 aa  165  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.054806  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04834  putrescine transporter  30.14 
 
 
436 aa  163  4.0000000000000004e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001093  putrescine/proton symporter putrescine/ornithine antiporter PotE  30.43 
 
 
436 aa  162  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2989  putrescine transporter  27.64 
 
 
443 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00443871  normal  0.0573626 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0313  putrescine transporter  31.25 
 
 
439 aa  157  4e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0277  putrescine transporter  31.25 
 
 
439 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3872  putrescine transporter  30.98 
 
 
439 aa  156  6e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0414158 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4054  putrescine transporter  29.81 
 
 
439 aa  156  8e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4172  putrescine transporter  29.81 
 
 
439 aa  156  8e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3976  putrescine transporter  29.81 
 
 
439 aa  156  8e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4085  putrescine transporter  29.81 
 
 
439 aa  156  8e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3668  putrescine transporter  30.71 
 
 
439 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0755  amino acid permease-associated region  29.08 
 
 
474 aa  153  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.254398  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0540  arginine/ornithine antiporter protein  28.78 
 
 
465 aa  153  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0180  putrescine transporter  30.25 
 
 
439 aa  154  4e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0665  amino acid permease family protein  28.95 
 
 
465 aa  153  5e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3513  putrescine transporter  28.79 
 
 
461 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.015578 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0540  arginine/ornithine antiporter protein  28.78 
 
 
465 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00650316  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3680  putrescine transporter  29.16 
 
 
439 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0596  amino acid permease family protein  28.71 
 
 
465 aa  152  8e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0684  amino acid permease family protein  28.71 
 
 
465 aa  152  8e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.164038 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0629  amino acid permease family protein  28.71 
 
 
465 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0758  amino acid permease family protein  28.54 
 
 
465 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3768  lysine/cadaverine antiporter  32.62 
 
 
449 aa  151  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000519797  normal  0.028767 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6446  amino acid permease-associated region  29.09 
 
 
750 aa  151  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.396159 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4672  amino acid permease family protein  28.47 
 
 
465 aa  150  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  4.1139e-21 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1574  putrescine transporter  28.36 
 
 
436 aa  149  7e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0697  amino acid permease family protein  28.3 
 
 
465 aa  149  9e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3254  putrescine transporter  28.5 
 
 
442 aa  149  9e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0683  amino acid permease-associated region  29.15 
 
 
471 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0941  amino acid permease family protein  28.37 
 
 
474 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000289126 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4355  putrescine transporter  28.03 
 
 
461 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.879219  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4011  putrescine transporter  28.03 
 
 
461 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.253932  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2934  lysine/cadaverine antiporter  30.98 
 
 
443 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.252343  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0754  arginine/ornithine antiporter  28.37 
 
 
474 aa  147  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0749  arginine/ornithine antiporter  28.37 
 
 
474 aa  147  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000982146  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2759  lysine/cadaverine antiporter  30.98 
 
 
443 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.420004  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2800  lysine/cadaverine antiporter  30.98 
 
 
443 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.1623  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2717  lysine/cadaverine antiporter  30.98 
 
 
443 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2821  lysine/cadaverine antiporter  30.98 
 
 
443 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3335  putrescine transporter  29.43 
 
 
438 aa  147  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0937  amino acid permease family protein  28.13 
 
 
474 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0508  putrescine transporter  28.01 
 
 
440 aa  146  7.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0805  amino acid permease family protein  28.71 
 
 
456 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0845  amino acid permease family protein  28.71 
 
 
456 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0542  amino acid permease-associated region  28.67 
 
 
465 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4436  amino acid permease family protein  28.13 
 
 
474 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0280359  normal  0.0537632 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1204  putrescine transporter  28.19 
 
 
437 aa  145  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.658764  decreased coverage  0.0000377329 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0901  amino acid permease family protein  28.13 
 
 
474 aa  145  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.264525  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1029  amino acid permease family protein  28.13 
 
 
474 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.530326  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5194  putrescine transporter  28.46 
 
 
452 aa  144  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2445  putrescine transporter  27.03 
 
 
446 aa  143  6e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.273787  normal  0.196088 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00648  putrescine/proton symporter: putrescine/ornithine antiporter  27.7 
 
 
439 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.173719  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2945  arginine/ornithine antiporter  27.7 
 
 
439 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00640  hypothetical protein  27.7 
 
 
439 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.167643  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2492  lysine/cadaverine antiporter  29.84 
 
 
444 aa  142  9.999999999999999e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2964  putrescine transporter  27.7 
 
 
439 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.018093  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0760  putrescine transporter  27.45 
 
 
439 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.428261  normal  0.419082 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0747  putrescine transporter  27.45 
 
 
439 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110662  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0857  putrescine transporter  27.45 
 
 
439 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0821  putrescine transporter  27.45 
 
 
439 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.438039  normal  0.147845 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0808  putrescine transporter  27.45 
 
 
439 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.210181  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0784  putrescine transporter  27.7 
 
 
439 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0285849  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>