More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0937 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  WD0937  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein, putative  100 
 
 
293 aa  597  1e-169  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.388709  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0842  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  45.7 
 
 
282 aa  236  4e-61  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.290902  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0248  periplasmic solute binding protein  43.92 
 
 
287 aa  221  9.999999999999999e-57  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1730  periplasmic solute binding protein  30.77 
 
 
313 aa  162  9e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2751  periplasmic solute binding protein  28.12 
 
 
332 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4006  periplasmic solute binding protein  31.31 
 
 
303 aa  153  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.129807  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2184  ABC transporter substrate binding protein (zinc)  32.65 
 
 
308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.2291  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4176  periplasmic solute binding protein  29.48 
 
 
346 aa  145  6e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.383173  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1122  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  28.74 
 
 
334 aa  144  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.124728  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1027  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  28.74 
 
 
334 aa  144  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2718  periplasmic solute binding protein  31.89 
 
 
344 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11219  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2384  periplasmic solute binding protein  31.05 
 
 
351 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.691591  normal  0.896834 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1194  periplasmic solute binding protein  27.42 
 
 
329 aa  139  7e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.170646 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2251  high-affinity zinc transporter periplasmic component  27.44 
 
 
340 aa  129  7.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000558415  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2105  high-affinity zinc transporter periplasmic component  26.55 
 
 
314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.060713  normal  0.639588 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1329  high-affinity zinc transporter periplasmic component  27.27 
 
 
352 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00390701  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2045  high-affinity zinc transporter periplasmic component  26.55 
 
 
314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.279295  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1233  high-affinity zinc transporter periplasmic component  26.55 
 
 
314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00176582  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1357  high-affinity zinc transporter periplasmic component  26.55 
 
 
314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00461561 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004106  zinc ABC transporter-binding protein ZnuA  28.68 
 
 
295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2050  high-affinity zinc transporter periplasmic component  26.55 
 
 
314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153419  normal  0.0811015 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2593  high-affinity zinc transporter periplasmic component  26.83 
 
 
310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00016843  normal  0.856449 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0953  high-affinity zinc transporter periplasmic component  26.57 
 
 
310 aa  127  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0035869  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2087  high-affinity zinc transporter periplasmic component  26.92 
 
 
310 aa  127  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000165105  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2111  high-affinity zinc transporter periplasmic component  27.27 
 
 
339 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0209857  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1783  periplasmic solute binding protein  26.57 
 
 
328 aa  125  6e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000935054  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01828  high-affinity zinc transporter periplasmic component  26.57 
 
 
310 aa  125  7e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0190601  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01816  hypothetical protein  26.57 
 
 
310 aa  125  7e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0117492  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1775  high-affinity zinc transporter periplasmic component  26.57 
 
 
310 aa  125  7e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000650264  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1951  high-affinity zinc transporter periplasmic component  26.57 
 
 
310 aa  125  7e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00866903  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1827  high-affinity zinc transporter periplasmic component  27.1 
 
 
339 aa  125  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0735941  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0059  periplasmic solute binding protein  26.74 
 
 
309 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2142  high-affinity zinc transporter periplasmic component  27.69 
 
 
340 aa  123  5e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000717331  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1697  periplasmic solute binding protein  27.33 
 
 
347 aa  121  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.668207  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01361  hypothetical protein  27.37 
 
 
293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2426  high-affinity zinc transporter periplasmic component  26.04 
 
 
314 aa  119  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000208109  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3183  periplasmic solute binding protein  29.14 
 
 
371 aa  119  6e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0392805  normal  0.124808 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0275  periplasmic solute binding protein  24.61 
 
 
313 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2773  high-affinity zinc transporter periplasmic component  27.13 
 
 
321 aa  118  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000694266  hitchhiker  0.00715956 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1667  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  27.84 
 
 
297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1122  periplasmic solute binding protein  25.16 
 
 
328 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6299  putative adhesin  23.3 
 
 
307 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0852  high-affinity zinc uptake system protein ZnuA precursor  26.71 
 
 
297 aa  117  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0338292  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72550  putative adhesin  23.3 
 
 
307 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0120  periplasmic solute binding protein  22.96 
 
 
302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.463624  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0135  periplasmic solute binding protein  23.43 
 
 
318 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.972392 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5108  periplasmic solute binding protein  22.26 
 
 
302 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.166633 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0137  periplasmic solute binding protein  22.64 
 
 
302 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5268  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  24.23 
 
 
311 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2027  high-affinity zinc transporter periplasmic component  27.76 
 
 
318 aa  112  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000130529  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2140  high-affinity zinc transporter periplasmic component  27.76 
 
 
318 aa  112  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000251275  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00830  ABC transporter, periplasmic binding protein  23.1 
 
 
297 aa  109  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3151  hypothetical protein  26.18 
 
 
336 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.506548 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1704  putative high-affinity zinc uptake system protein  31.03 
 
 
356 aa  105  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0200273  normal  0.0153509 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3616  periplasmic solute binding protein  32.14 
 
 
378 aa  104  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0144381 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1712  periplasmic solute binding protein  28.57 
 
 
369 aa  100  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.333525  normal  0.532025 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0188  periplasmic solute binding protein  22.77 
 
 
334 aa  94.4  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.494723  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4140  periplasmic solute binding protein  23.75 
 
 
326 aa  94  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.101102 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  25.87 
 
 
314 aa  87.8  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0179  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  29.17 
 
 
296 aa  87.4  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  27.86 
 
 
318 aa  87.4  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1156  periplasmic solute binding protein  29.25 
 
 
303 aa  86.7  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0138  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  28.47 
 
 
296 aa  85.1  0.000000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0312  periplasmic solute binding protein  29.94 
 
 
362 aa  83.2  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0895  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  25.53 
 
 
514 aa  80.9  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00479451  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0577  periplasmic solute binding protein  23.45 
 
 
301 aa  79  0.00000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.289421  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1892  periplasmic solute binding protein  21.67 
 
 
321 aa  78.6  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00897518  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0156  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  28.32 
 
 
291 aa  78.2  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2435  periplasmic solute binding protein  27.55 
 
 
301 aa  78.2  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148152  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  22.95 
 
 
317 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4568  periplasmic solute-binding protein  26.23 
 
 
322 aa  75.9  0.0000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.328746  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0624  periplasmic solute binding protein  24.67 
 
 
310 aa  75.1  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.17894  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3571  ABC zinc transporter, periplasmic binding protein ZnuA  30.43 
 
 
345 aa  74.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1999  periplasmic solute binding protein  22.83 
 
 
292 aa  73.9  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.870733  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3253  periplasmic solute binding protein  30.43 
 
 
347 aa  73.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0556768 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1470  periplasmic solute binding protein  22.67 
 
 
298 aa  73.9  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0700113  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1915  periplasmic solute binding protein  22.9 
 
 
365 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.163703  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  27.38 
 
 
309 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0222  periplasmic solute binding protein  25.67 
 
 
306 aa  73.6  0.000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  24.23 
 
 
307 aa  73.2  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1015  solute binding protein  25.75 
 
 
310 aa  72.8  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1891  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  26.34 
 
 
288 aa  72.8  0.000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3553  periplasmic solute binding protein  22.87 
 
 
306 aa  72.4  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00157548  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2553  periplasmic solute binding protein  24.71 
 
 
319 aa  72.4  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4951  periplasmic solute binding protein  23.45 
 
 
317 aa  72.4  0.000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3262  periplasmic solute binding protein  24.88 
 
 
341 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000710757  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2836  periplasmic solute binding protein  24.34 
 
 
299 aa  72  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  24.26 
 
 
309 aa  72  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0333  periplasmic solute binding protein  23.7 
 
 
302 aa  72  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000273282  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4439  periplasmic solute binding protein  27.2 
 
 
339 aa  71.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  26.98 
 
 
309 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  25.13 
 
 
294 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0604  periplasmic solute binding protein  28.86 
 
 
290 aa  71.2  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2781  periplasmic solute binding protein  22.53 
 
 
318 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1015  periplasmic solute binding protein  25.28 
 
 
293 aa  70.9  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1601  periplasmic solute binding protein  27.05 
 
 
325 aa  70.9  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1256  high-affinity zinc transporter periplasmic component  28.41 
 
 
372 aa  70.5  0.00000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000280798  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  24.18 
 
 
282 aa  70.5  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  23.81 
 
 
368 aa  70.1  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0461  periplasmic solute binding protein  26.36 
 
 
313 aa  69.7  0.00000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>