36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0728 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  WD0728  hypothetical protein  100 
 
 
378 aa  763    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0733072  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0907  hypothetical protein  40.31 
 
 
381 aa  302  7.000000000000001e-81  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0198  hypothetical protein  38.79 
 
 
381 aa  296  3e-79  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.789712  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3443  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  22.52 
 
 
801 aa  100  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2675  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.68 
 
 
798 aa  92.4  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4290  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  21.66 
 
 
861 aa  87.4  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.731111  normal  0.889005 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3963  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  21.12 
 
 
861 aa  85.9  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3577  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  20.32 
 
 
843 aa  85.1  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0085  putative sensor histidine kinase  23.41 
 
 
835 aa  81.6  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.376568 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0045  histidine kinase  20.65 
 
 
838 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.327934 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.57 
 
 
830 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0705844  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0082  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  21.45 
 
 
837 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3246  histidine kinase  22.71 
 
 
826 aa  76.3  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4942  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  20.33 
 
 
857 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.485802  normal  0.436687 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3296  histidine kinase  26.15 
 
 
837 aa  73.6  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.584314 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0382  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  20.8 
 
 
843 aa  73.2  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0500  multi-sensor signal transduction histidine kinase  20.26 
 
 
830 aa  73.2  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.919247  hitchhiker  0.00131243 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2016  putative sensory box histidine kinase  20.97 
 
 
837 aa  72  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.377194  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2099  sensory box histidine kinase, putative  20.97 
 
 
859 aa  71.6  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.320612  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0624  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.19 
 
 
837 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0348163  normal  0.542065 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0050  two component sensor kinase  21.86 
 
 
911 aa  70.5  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4896  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.72 
 
 
842 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4432  ATPase domain-containing protein  26.72 
 
 
846 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.645763 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4834  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.5 
 
 
770 aa  70.1  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0207  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.27 
 
 
837 aa  70.1  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.749864  normal  0.519956 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0118  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.79 
 
 
861 aa  70.1  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.235165  normal  0.571653 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0742  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  20.95 
 
 
862 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0162  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  18.99 
 
 
787 aa  68.2  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.842242  normal  0.67921 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0821  histidine kinase  19.83 
 
 
858 aa  68.2  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0080  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  20.22 
 
 
829 aa  67.8  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.572947 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0053  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  20.96 
 
 
838 aa  66.6  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1354  sensor histidine kinase  26.99 
 
 
824 aa  60.8  0.00000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4061  putative PAS/PAC sensor protein  24 
 
 
549 aa  53.5  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.313546 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0667  multi-sensor signal transduction histidine kinase  19.65 
 
 
859 aa  52.8  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.370657 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2841  hypothetical protein  17.2 
 
 
516 aa  51.2  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.876193  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2778  putative PAS/PAC sensor protein  19.48 
 
 
531 aa  51.2  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.866604  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>