146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0508 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  WD0508  transcriptional regulator, putative  100 
 
 
312 aa  611  9.999999999999999e-175  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0626  transcriptional regulator, putative  60.33 
 
 
303 aa  312  3.9999999999999997e-84  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0882771  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0255  transcriptional regulator, putative  55.89 
 
 
308 aa  296  4e-79  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0623  transcriptional regulator, putative  55.18 
 
 
302 aa  261  1e-68  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0864444  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0622  transcriptional regulator, putative  46.15 
 
 
303 aa  229  3e-59  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.436499  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0254  transcriptional regulator, putative  46.7 
 
 
215 aa  142  9e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0564  hypothetical protein  45.13 
 
 
111 aa  85.9  9e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1118  putative transcriptional regulator  29.41 
 
 
213 aa  68.9  0.00000000009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0894  transcriptional regulator  29.55 
 
 
215 aa  67.8  0.0000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7309  protein of unknown function DUF955  29.33 
 
 
283 aa  57.4  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00000000844609  hitchhiker  0.000028574 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0591  XRE family transcriptional regulator  28.16 
 
 
113 aa  56.6  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  24.54 
 
 
255 aa  55.8  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1892  XRE family transcriptional regulator  31.73 
 
 
120 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0540  XRE family transcriptional regulator  31.73 
 
 
120 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0675  XRE family transcriptional regulator  31.73 
 
 
120 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00325967 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9533  transcriptional regulator Cro/CI family  39.68 
 
 
141 aa  55.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.140693  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2259  transcriptional regulator, XRE family  22.43 
 
 
255 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1232  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 
126 aa  53.1  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236768  normal  0.265611 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1909  XRE family transcriptional regulator  29.91 
 
 
123 aa  53.1  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1458  transcriptional regulator, XRE family  31.58 
 
 
114 aa  52.8  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1388  XRE family transcriptional regulator  31.07 
 
 
119 aa  52.8  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  24.61 
 
 
252 aa  52.4  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2775  putative transcriptional regulator  30.84 
 
 
123 aa  52.4  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6504  transcriptional regulator, XRE family  29.86 
 
 
152 aa  50.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0246  transcriptional regulator, XRE family  45.61 
 
 
69 aa  50.8  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0300  helix-turn-helix domain-containing protein  45.61 
 
 
370 aa  50.8  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193502  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3242  XRE family transcriptional regulator  43.64 
 
 
149 aa  50.4  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1020  XRE family transcriptional regulator  35.06 
 
 
149 aa  50.4  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.638142  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6040  transcriptional regulator, XRE family  29.51 
 
 
134 aa  50.4  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.591688 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6091  transcriptional regulator, XRE family  31.5 
 
 
152 aa  50.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0329  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 
171 aa  50.1  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.846996  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  24.79 
 
 
256 aa  50.1  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2429  XRE family transcriptional regulator  28.71 
 
 
143 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.214939  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0447  transcriptional regulator, XRE family  29.17 
 
 
139 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0230  transcriptional regulator, XRE family  29.03 
 
 
137 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737224  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0154  helix-turn-helix domain-containing protein  29 
 
 
134 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  36.51 
 
 
118 aa  49.3  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3177  XRE family transcriptional regulator  31.62 
 
 
142 aa  49.3  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0647326  normal  0.0138701 
 
 
-
 
NC_002978  WD0296  hypothetical protein  52.27 
 
 
303 aa  48.5  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0337026  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0595  XRE family transcriptional regulator  28.1 
 
 
139 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.958783  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0237  XRE family transcriptional regulator  28.1 
 
 
139 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0834  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 
145 aa  48.9  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.211274  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7073  transcriptional regulator  30.16 
 
 
138 aa  47.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0278  XRE family transcriptional regulator  40.38 
 
 
145 aa  48.5  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3344  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
125 aa  48.1  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2142  XRE family transcriptional regulator  36.05 
 
 
175 aa  47.8  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0051  XRE family transcriptional regulator  29.41 
 
 
138 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3622  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 
147 aa  47.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5225  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 
140 aa  48.5  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0066  XRE family transcriptional regulator  32.14 
 
 
146 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0319384  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3125  XRE family transcriptional regulator  26.72 
 
 
162 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.412901  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2889  DNA-binding protein  28.85 
 
 
223 aa  47.8  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2653  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
110 aa  47.4  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0200481  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0026  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 
144 aa  47.8  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.153059  normal  0.660956 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2104  transcriptional regulator, XRE family  40.38 
 
 
174 aa  47.4  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0073  DNA-binding protein  37.1 
 
 
67 aa  47  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0074  DNA-binding protein  37.1 
 
 
67 aa  47  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0070  transcriptional regulator  37.1 
 
 
67 aa  47  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0070  transcriptional regulator  37.1 
 
 
67 aa  47  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0086  DNA-binding protein  37.1 
 
 
67 aa  47  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.786766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0074  DNA-binding protein  37.1 
 
 
67 aa  47  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1627  XRE family transcriptional regulator  26.22 
 
 
300 aa  47  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000332957  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0398  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
244 aa  47.4  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7198  transcriptional regulator, XRE family  33.06 
 
 
134 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0637638 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0083  DNA-binding protein  37.1 
 
 
67 aa  47  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440854 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2965  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 
224 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.598952  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4530  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 
152 aa  46.6  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2568  LacI family transcription regulator  28.85 
 
 
223 aa  46.6  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5234  DNA-binding protein  37.1 
 
 
67 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000302998 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0082  DNA-binding protein  37.1 
 
 
67 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.815457  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0070  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 
67 aa  46.6  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0627  hypothetical protein  37.84 
 
 
298 aa  46.2  0.0007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.261327  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0473  XRE family transcriptional regulator  27.5 
 
 
138 aa  46.2  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6629  putative Phage-related transcriptional regulator  36.76 
 
 
143 aa  46.2  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3686  transcriptional regulator, XRE family  32.91 
 
 
133 aa  46.2  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1401  transcriptional regulator, XRE family  29.03 
 
 
108 aa  46.2  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0873  DNA-binding protein, putative  31.73 
 
 
222 aa  45.8  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0692  XRE family transcriptional regulator  40.3 
 
 
74 aa  45.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.782082  normal  0.118291 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0019  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 
139 aa  45.4  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0558597 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3208  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 
141 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2892  transcriptional regulator, XRE family  35.82 
 
 
166 aa  45.4  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.203012 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2733  helix-turn-helix domain-containing protein  30.97 
 
 
115 aa  45.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000416248  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2928  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 
70 aa  45.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  unclonable  0.000000000000595128  normal  0.0963674 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0026  XRE family transcriptional regulator  27.27 
 
 
139 aa  45.8  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1881  transcriptional regulator  30.91 
 
 
259 aa  45.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0431466  hitchhiker  0.00212922 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0885  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 
83 aa  45.8  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4176  transcriptional regulator, XRE family  34 
 
 
104 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6981  transcriptional regulator, XRE family  36.76 
 
 
245 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2806  putative transcriptional regulatory protein  27.93 
 
 
131 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0506  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 
194 aa  45.4  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0504214  normal  0.112871 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  35.96 
 
 
144 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1221  XRE family transcriptional regulator  33.73 
 
 
127 aa  45.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.309245  normal  0.121494 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2727  transcriptional regulator, XRE family  30 
 
 
133 aa  45.4  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2959  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 
141 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.676432  normal  0.753241 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0791  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 
528 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1035  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 
159 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3746  XRE family transcriptional regulator  36.62 
 
 
397 aa  45.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3344  DNA-binding protein  40.35 
 
 
66 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2278  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 
136 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.504941  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5273  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  30.09 
 
 
305 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>