More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0503 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  WD0503  MiaB-like tRNA modifying enzyme  100 
 
 		 408 aa  831    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0217  MiaB family tRNA modification protein  63.83 
 
 		 412 aa  539  9.999999999999999e-153  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0789  tRNA 2-methylthioadenosine synthase  61.41 
 
 		 411 aa  520  1e-146  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.594901  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1182  MiaB-like tRNA modifying enzyme  47.72 
 
 		 441 aa  432  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0484271  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0785  MiaB family tRNA modification protein  51.46 
 
 		 429 aa  429  1e-119  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0522  MiaB-like tRNA modifying enzyme  46.52 
 
 		 420 aa  429  1e-119  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1414  MiaB-like tRNA modifying enzyme  47.09 
 
 		 420 aa  418  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0360  MiaB-like tRNA modifying enzyme  44.63 
 
 		 422 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.106341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2852  MiaB-like tRNA modifying enzyme  45.54 
 
 		 444 aa  413  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3574  MiaB-like tRNA modifying enzyme  46.75 
 
 		 423 aa  410  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2497  MiaB-like tRNA modifying enzyme  47.76 
 
 		 411 aa  409  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0715823  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0018  MiaB family tRNA modification protein  47.48 
 
 		 427 aa  410  1e-113  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2775  2-methylthioadenine synthetase  45.24 
 
 		 422 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.254506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0214  MiaB-like tRNA modifying enzyme  48.07 
 
 		 420 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0176423 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0926  MiaB-like tRNA modifying enzyme  46.15 
 
 		 427 aa  398  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.084888  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4866  MiaB-like tRNA modifying enzyme  44.69 
 
 		 449 aa  396  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1933  hypothetical protein  45.91 
 
 		 427 aa  398  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0319  MiaB-like tRNA modifying enzyme  46.21 
 
 		 419 aa  396  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1860  hypothetical protein  45.91 
 
 		 427 aa  398  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.17951  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2810  MiaB-like tRNA modifying enzyme  45.34 
 
 		 421 aa  396  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.756102  normal  0.266811 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3390  MiaB-like tRNA modifying enzyme  47.71 
 
 		 426 aa  397  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0252  MiaB-like tRNA modifying enzyme  46.94 
 
 		 423 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3229  MiaB-like tRNA modifying enzyme  44.85 
 
 		 416 aa  394  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0152656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0515  MiaB-like tRNA modifying enzyme  44.15 
 
 		 443 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.481565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0396  MiaB-like tRNA modifying enzyme  43.77 
 
 		 420 aa  392  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.342498  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4197  hypothetical protein  45.99 
 
 		 424 aa  389  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2980  MiaB-like tRNA modifying enzyme  43.93 
 
 		 425 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.065406 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0935  MiaB-like radical SAM protein  44.42 
 
 		 425 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2594  MiaB-like tRNA modifying enzyme  44.66 
 
 		 425 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.858187 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3747  MiaB-like tRNA modifying enzyme  45.26 
 
 		 424 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771272  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4070  MiaB-like tRNA modifying enzyme  46.47 
 
 		 424 aa  388  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3405  MiaB-like tRNA modifying enzyme  44.58 
 
 		 435 aa  386  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3092  MiaB-like tRNA modifying enzyme  46.23 
 
 		 424 aa  381  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.852601 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0412  MiaB-like tRNA modifying enzyme  44.44 
 
 		 437 aa  379  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.908018  normal  0.498454 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2843  MiaB-like tRNA modifying enzyme  43.7 
 
 		 410 aa  374  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.495489  normal  0.451673 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2721  MiaB-like tRNA modifying enzyme  43.46 
 
 		 410 aa  371  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2948  MiaB-like tRNA modifying enzyme  42.96 
 
 		 410 aa  364  1e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.736746  hitchhiker  0.001764 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0373  putative MiaB-like tRNA modifying enzyme  43.2 
 
 		 434 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215959  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1849  MiaB-like tRNA modifying enzyme  46.37 
 
 		 433 aa  362  8e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.922054 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2929  MiaB-like tRNA modifying enzyme  43.24 
 
 		 419 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.301495 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5336  MiaB-like tRNA modifying enzyme  43.46 
 
 		 408 aa  355  1e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0184  MiaB-like tRNA modifying enzyme  42.4 
 
 		 412 aa  348  8e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.734186  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3655  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.9 
 
 		 423 aa  319  5e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0378988  normal  0.0160657 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1401  MiaB-like tRNA modifying enzyme  41.71 
 
 		 398 aa  316  4e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.14892  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2731  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.94 
 
 		 441 aa  293  5e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.549128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1017  RNA modification enzyme, MiaB family  33.98 
 
 		 449 aa  263  3e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2433  RNA modification enzyme, MiaB family  34.05 
 
 		 451 aa  261  2e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000747616  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1857  putative MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.05 
 
 		 432 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0976  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.8 
 
 		 467 aa  258  1e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149677  normal  0.0700259 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0807  RNA modification enzyme, MiaB family  34.05 
 
 		 450 aa  256  7e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137858  decreased coverage  2.64257e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4429  hypothetical protein  34.05 
 
 		 450 aa  256  7e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111241  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4161  RNA modification protein  34.05 
 
 		 450 aa  255  9e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.556145  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4391  hypothetical protein  34.05 
 
 		 450 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.115711  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4332  RNA modification enzyme, MiaB family  34.05 
 
 		 450 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16472e-48 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4209  hypothetical protein  34.05 
 
 		 450 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4047  hypothetical protein  34.05 
 
 		 450 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4057  hypothetical protein  34.05 
 
 		 450 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3036  RNA modification protein  34.05 
 
 		 450 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0366508  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4535  hypothetical protein  34.05 
 
 		 450 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4443  RNA modification enzyme, MiaB family  34.05 
 
 		 450 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000190996  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1643  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.35 
 
 		 429 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.119605  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2568  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.12 
 
 		 434 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1770  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.68 
 
 		 435 aa  253  4.0000000000000004e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000207484  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2570  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.83 
 
 		 429 aa  252  8.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.005255 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0223  hypothetical protein  35.06 
 
 		 441 aa  251  1e-65  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.180201 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.33 
 
 		 434 aa  249  8e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.81672  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09066  putative Fe-S oxidoreductase  35.43 
 
 		 458 aa  248  2e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.276137  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2492  RNA modification protein  34.11 
 
 		 436 aa  246  4e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00131013  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0566  hypothetical protein  33.5 
 
 		 470 aa  246  6e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.59061  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.8 
 
 		 434 aa  245  8e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.698002  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0611  RNA modification enzyme, MiaB family  33.72 
 
 		 437 aa  245  9.999999999999999e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.920211  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1668  RNA modification protein  34.2 
 
 		 448 aa  243  3e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0874  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.75 
 
 		 431 aa  244  3e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249518 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1634  RNA modification protein  34.2 
 
 		 448 aa  243  3e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.654078  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6578  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.75 
 
 		 425 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.745679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12760  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.06 
 
 		 438 aa  243  5e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00265105  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5039  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.41 
 
 		 444 aa  242  1e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1333  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.33 
 
 		 449 aa  241  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2937  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.6 
 
 		 439 aa  241  2e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.673839  normal  0.173134 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2207  RNA modification enzyme, MiaB family  33.8 
 
 		 440 aa  240  2.9999999999999997e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1144  hypothetical protein  34.04 
 
 		 448 aa  240  4e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0674  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.54 
 
 		 429 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1402  RNA modification enzyme, MiaB family  32.42 
 
 		 462 aa  236  7e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1050  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.72 
 
 		 438 aa  235  8e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0174  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.25 
 
 		 430 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0588  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.78 
 
 		 450 aa  234  2.0000000000000002e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0962192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1997  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.67 
 
 		 441 aa  234  3e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1737  2-methylthioadenine synthetase  34.66 
 
 		 438 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.131145 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1490  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.78 
 
 		 444 aa  233  5e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1992  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.33 
 
 		 471 aa  233  5e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.130467  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0150  RNA modification protein  33.18 
 
 		 434 aa  232  1e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.839753  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1282  RNA modification enzyme, MiaB family  33.72 
 
 		 434 aa  232  1e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2053  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.72 
 
 		 450 aa  231  2e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1164  RNA modification enzyme, MiaB family  33.33 
 
 		 431 aa  229  9e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4295  RNA modification enzyme, MiaB family  34.99 
 
 		 439 aa  229  9e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00281289  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1728  MiaB-like tRNA modifying enzyme  29.27 
 
 		 438 aa  228  1e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.479022  decreased coverage  0.00502843 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1790  RNA modification enzyme, MiaB family  33.42 
 
 		 452 aa  228  1e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0115132  normal  0.0236064 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1350  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.23 
 
 		 449 aa  228  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.306215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2299  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.26 
 
 		 466 aa  227  2e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.198843  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0969  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.48 
 
 		 421 aa  224  2e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>